{"id":1001,"date":"2017-03-14T11:17:55","date_gmt":"2017-03-14T10:17:55","guid":{"rendered":"http:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/?p=1001"},"modified":"2017-03-14T11:42:59","modified_gmt":"2017-03-14T10:42:59","slug":"nature-et-autres-lectures-scientifiques-de-jacques-en-fevrier-2017","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/?p=1001","title":{"rendered":"Nature et autres lectures scientifiques de Jacques en f\u00e9vrier 2017"},"content":{"rendered":"

Dans la livraison de f\u00e9vrier, j’ai \u00e9t\u00e9 particuli\u00e8rement int\u00e9ress\u00e9 par les articles suivants:
\n– Nature, 2 f\u00e9vrier, p. 96. Comment prendre une d\u00e9cision en une petite fraction de seconde? L’\u00e9quipe d’A.L\u00fcthi de B\u00e2le l’explique dans le cas de la souris qui choisit entre le comportement d’immobilisation ou de fuite.
\n– Nature, 9.2,152; 16.2. 298, etc. \u00a0La glace de l’Arctique fout le camp \u00e0 toute allure et celle de l’Antarctique est plus instable qu’il n’y parait. C’est terrible!
\n– Science 17.2, 719. On avait vu sur C\u00e9r\u00e8s, le plus grand des ast\u00e9ro\u00efdes, deux points brillants bizarres. Ce sont probablement des sources hydrothermales riches en mati\u00e8re organique. De quoi r\u00eaver!
\n– Nature 23.3. Plusieurs articles. L’\u00e9pitranscriptomique, un chapitre qui s’ouvre en biologie et qui vaudra peut-\u00eatre bien l’\u00e9pig\u00e9n\u00e9tique.
\nLast but Not Least
\n– Scientific American 1.3.17. Si vous \u00eates de la petite majorit\u00e9 qui souffre d’anosmie de l’asperge, cet article ne vous concerne pas. Si vous n’\u00eates pas de ceux-ci, vous aurez l’intense satisfaction de savoir enfin pourquoi votre pipi, parfois, sent horriblement mauvais.\u00a0<\/strong><\/p>\n

Nous gardons un oeil attentif sur la cryo-ME:<\/strong><\/p>\n

Li, M., Zhou, X., Wang, S., Michailidis, I., Gong, Y., Su, D., . . . Yang, J. (2017). Structure of a eukaryotic cyclic-nucleotide-gated channel. Nature, 542<\/em>(7639), 60-65. doi:10.1038\/nature20819<\/p>\n

Fica, S. M., Oubridge, C., Galej, W. P., Wilkinson, M. E., Bai, X. C., Newman, A. J., & Nagai, K. (2017). Structure of a spliceosome remodelled for exon ligation. Nature, 542<\/em>(7641), 377-380. doi:10.1038\/nature21078<\/p>\n

Bertram, K., Agafonov, D. E., Liu, W. T., Dybkov, O., Will, C. L., Hartmuth, K., . . . Lu Hrmann, R. (2017). Cryo-EM structure of a human spliceosome activated for step 2 of splicing. Nature, 542<\/em>(7641), 318-323. doi:10.1038\/nature21079<\/p>\n

 <\/p>\n

02.02.2017, Nature 542, 7639<\/strong><\/p>\n

– 8. <\/strong>TOMATE, OGM, SAVEUR, AGRICULTURE. <\/strong>Not\u00e9 d\u2019ailleurs\u00a0: Science 355, 391 (2017). Chacun le constate, les tomates commerciales n\u2019ont pas de gout.<\/u> Cet article issu d\u2019une collaboration Chine-US compare les g\u00e8nes de l\u2019ar\u00f4me des tomates qui avaient encore du gout avec les tomates du grand commerce. Il est constat\u00e9 que, au cours de la s\u00e9lection pour la taille, la fermet\u00e9, la conservation, etc., le gout a \u00e9t\u00e9 n\u00e9glig\u00e9 et largement perdu, pas parce qu\u2019il contrecarre les autres propri\u00e9t\u00e9s, mais simplement parce qu\u2019on ne s\u2019en est pas pr\u00e9occup\u00e9. Les g\u00e8nes du gout ainsi identifi\u00e9s pourraient \u00eatre remis en circulation par les m\u00e9thodes classiques de la s\u00e9lection des vari\u00e9t\u00e9s\u00a0; m\u00eame pas besoin d\u2019OGM.<\/p>\n

Une illustration de plus que les buts de l\u2019industrie alimentaire ne sont pas les bons.<\/em><\/p>\n

\u00a0<\/em><\/p>\n

    \n
  1. RISQUE BIOLOGIQUE, G\u00c9N\u00c9TIQUE, GENE-DRIVE. S\u00e9v\u00e9rine. X fois ici, j\u2019ai parl\u00e9 des risques incontr\u00f4lables associ\u00e9s \u00e0 gene-drive. Le pr\u00e9sent rapport donne une autre vue.<\/u> Un labo italien dispose de la plus grande cage s\u00e9curis\u00e9e pour \u00e9tudier les moustiques modifi\u00e9s par gene-drive dans le but de lutter contre la malaria. Ces chercheurs constatent que gene-drive est difficile \u00e0 mettre en oeuvre. Je retiens trois arguments. (i) Les \u00e9l\u00e9ments g\u00e9n\u00e9tiques \u00e9go\u00efstes mobiles sont aussi divers que nombreux\u00a0; souvent pas si diff\u00e9rents que ceux de gene-drive. Ils sont tous tr\u00e8s difficiles \u00e0 contr\u00f4ler dans la nature. (ii) Il faut s’attendre que la r\u00e9sistance d\u2019une esp\u00e8ce diversifi\u00e9e \u00e0 un organisme gene-drive se d\u00e9veloppera rapidement. Il suffira d\u2019une mutation dans le drive CRISPR\/Cas9 ou dans les s\u00e9quences associ\u00e9es pour empoisonner le syst\u00e8me. (iii) Dans ce, m\u00eame num\u00e9ro (pp 101-4) on trouve une \u00e9tude g\u00e9n\u00e9tique de diff\u00e9rentes esp\u00e8ces de moustiques vecteurs de la malaria. Comme pour les abeilles butineuses, la diversit\u00e9 des esp\u00e8ces est surprenante.<\/li>\n<\/ol>\n

    Le dernier mot n\u2019est pas dit, mais relativiser les catastrophes annonc\u00e9es est au moins utile pour y r\u00e9fl\u00e9chir.<\/em><\/p>\n

    De son c\u00f4t\u00e9, S\u00e9v\u00e9rine me signale la grosse \u00e9tude US sur les possibilit\u00e9s et risques associ\u00e9s \u00e0 CRISPR et gene-drive.
    \nISBN 978-0-309-43787-5 | DOI: 10.17226\/23405<\/p>\n

    – 96 \u2013 100. NEUROBIOLOGIE, COMPORTEMENT. Fran\u00e7oise. Fonctionnement du couteau suisse du comportement. Comment choisir entre la fuite et l\u2019attaque\u00a0? <\/u>On \u00e9tudie depuis longtemps le comportement d\u2019immobilisation (freeze) de la souris face au danger. Des cellules bien localis\u00e9es du centre de l\u2019amygdale (CEA) dans le cerveau ant\u00e9rieur les commandent. Dans le pr\u00e9sent article, le groupe d\u2019Andreas L\u00fcthi \u00e0 l\u2019Institut Miescher de B\u00e2le utilise l\u2019optog\u00e9n\u00e9tique in vivo (une prot\u00e9ine excitant le neurone est coupl\u00e9e \u00e0 un r\u00e9cepteur de lumi\u00e8re que l\u2019on active par un faisceau de lumi\u00e8re localis\u00e9). Ils d\u00e9montrent ainsi que les cellules responsables du comportement de fuite sont dans la m\u00eame r\u00e9gion du cerveau que celles de l\u2019immobilisation. Les neurones de l\u2019immobilisation sont somatostatin-positifs (SOM+) alors que celles de la fuite expriment une prot\u00e9ine de rel\u00e2chement, la corticotropine (CRF). L\u2019\u00e9chelle de temps de telles r\u00e9actions est au mieux de l\u2019ordre de la seconde, alors que la souris doit d\u00e9cider bien plus vite. Comment fait-elle\u00a0?\u00a0 Le pr\u00e9sent travail donne un fort \u00e9l\u00e9ment de r\u00e9ponse. <\/em>L\u2019\u00e9quilibre entre les deux r\u00e9actions est contr\u00f4l\u00e9 par la conductivit\u00e9 entre les neurones SOM+ et CRF. Ainsi, entre ces deux types de neurones, l\u2019activit\u00e9 de quelques synapses pourrait d\u00e9finir lequel des deux comportements est s\u00e9lectionn\u00e9. On comprend que cela puisse \u00eatre l\u2019affaire de quelques dizaines de millisecondes.<\/p>\n

     <\/p>\n

    09.02.2017, Nature 542, 7640.<\/strong><\/p>\n

    – 140. Highlights. AGRICULTURE, HISTOIRE, G\u00c9N\u00c9TIQUE. L\u2019agriculture existait en Asie de l\u2019Est il y a plus de 8’000 ans. On a partiellement s\u00e9quenc\u00e9 les g\u00e9nomes de deux femmes datant de 7’700 ans dans ces r\u00e9gions. Leurs plus proches descendants se trouvent dans la population locale du lieu. Il y a des lieux o\u00f9 on reste s\u00e9dentaire.<\/em><\/p>\n

    \u00a0<\/em><\/p>\n

     <\/p>\n

    – 152 \u2013 4. \u00c9CHAUFFEMENT CLIMATIQUE, ARCTIQUE, GLACE. J.-Cl. K. La glace de l\u2019Arctique fout le camp \u00e0 toute allure. L\u2019effet d\u2019entrainement est consid\u00e9rable puisque, en passant d\u2019une surface de neige \u00e0 une surface d\u2019eau, la part d\u2019\u00e9nergie du soleil absorb\u00e9e augmente d\u2019un facteur 10. Au point o\u00f9 vont les choses, le 1er<\/sup> \u00e9t\u00e9 arctique sans glace pourrait avoir lieu d\u2019ici 2030.<\/p>\n

    Quatre-millions de personnes dont 400’000 indig\u00e8nes habitent dans l\u2019Arctique. Leurs conditions de vie vont \u00eatre boulevers\u00e9es. Les populations c\u00f4ti\u00e8res devront se retirer, car, sans glace, les c\u00f4tes sont d\u00e9stabilis\u00e9es, en particulier \u00e0 cause des vagues et des temp\u00eates.<\/p>\n

    Quant aux esp\u00e8ces animales et v\u00e9g\u00e9tales, si on parle beaucoup de l\u2019Ours, l\u2019article insiste sur le fait que nous sommes tous des esp\u00e8ces d\u00e9pendant de la glace\u00a0; par exemple, les populations humaines, \u00e0 travers les courants marins ou, \u00e0 bien plus court terme, la descente des effets m\u00e9t\u00e9orologiques vers nos latitudes.<\/p>\n

     <\/p>\n

    – 142. Highlights. ENVIRONNEMENT, \u00c9CHAUFFEMENT CLIMITIQUE, POLITIQUE, SU\u00c8DE. La Su\u00e8de a d\u00e9cid\u00e9 d\u2019\u00eatre carbon-neutre dans moins de 20 ans.<\/u> Une loi pr\u00e9vue pour mars exigera que jusqu\u2019en 2045, l\u2019\u00e9mission de GES par l\u2019industrie et les transports soit ramen\u00e9e \u00e0 15% du niveau 1990.<\/p>\n

    La photo de signature de la loi par la ministre entour\u00e9e de 7 collaboratrices est bonne \u00e0 voir face \u00e0 celle des 7 connards m\u00e2les encadrant Trump signant son d\u00e9cret limitant l\u2019avortement.<\/p>\n

     <\/p>\n

    – 186 \u2013 190. G\u00c9N\u00c9TIQUE, TAILLE. Le r\u00f4le de variantes rares dans la taille des individus.<\/u> Doi\u00a0: 10.1038\/nature21039.<\/p>\n

    La taille est un trait hautement h\u00e9ritable. Dans un tel cas, j\u2019avais tendance \u00e0 croire qu\u2019un petit nombre de g\u00e8nes devraient \u00eatre d\u00e9terminants afin d\u2019en faire un trait qui puisse facilement \u00e9voluer. Erreur de pens\u00e9e, le trait taille est important depuis si longtemps et de mani\u00e8re si multiple qu\u2019il entre dans le g\u00e9nome de diff\u00e9rentes fa\u00e7ons sans qu\u2019aucune ne joue en elle-m\u00eame un r\u00f4le consid\u00e9rable (400 g\u00e8nes dont aucun ne contribue pour plus de 1%). Les manuels traitent abondamment le sujet.<\/p>\n

    Le pr\u00e9sent article pose la question\u00a0: y a-t-il des all\u00e8les rares qui pourraient jouer un r\u00f4le plus important\u00a0? L\u2019article implique 400+<\/sup> auteurs et consid\u00e8re 700’000 personnes. Il identifie 83 variants codants contribuant chacun pour 1 – 4.8% de la variance. L\u2019un de ces all\u00e8les implique une taille plus \u00e9lev\u00e9e de 2 cm. Plusieurs de ces all\u00e8les mettent le doigt sur des fonctions m\u00e9taboliques qui n\u2019avaient pas \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9es comme contribuant \u00e0 ce trait.<\/p>\n

    Encore un article montrant la puissance du Big Data en g\u00e9n\u00e9tique <\/em><\/p>\n

    \u00a0<\/em><\/p>\n

    – 143. Highlights, STE, ORIGINE NATIONALE, ETHNIE<\/p>\n

    \"Nature<\/p>\n

    – 263, <\/strong>Carri\u00e8re. POSTDOC, SALAIRE. Aux USA, 10 ans apr\u00e8s le doctorat, ceux qui ont commenc\u00e9 par un post-doc gagnent 11% de moins que les autres.
    \nIl faut revaloriser les carri\u00e8res de la recherche fondamentale ou acad\u00e9mique. <\/em><\/p>\n

    \u00a0<\/strong><\/p>\n

    16.02.2017. Nature\u00a0 542, 7641.<\/strong><\/p>\n

    – 284 \u2013 5. NANOTECHNOLOGIE, MFA. Rapport d\u2019un article dans Nature nanotechnologie. Le labo d\u2019IBM \u00e0 Z\u00fcrich a invent\u00e9 le microscope \u00e0 force atomique. Il s\u2019agit de la forme affin\u00e9e de l\u2019aiguille des pickups de la musique de notre jeunesse. \u00c7a leur a valu le prix Nobel en 1986. Cet instrument peut aussi d\u00e9placer des atomes un par un. Ici est pr\u00e9sent\u00e9e la construction \u00ab\u00a0m\u00e9canique\u00a0\u00bb d\u2019une mol\u00e9cule impossible \u00e0 synth\u00e9tiser par la chimie<\/u>. Joli gadget illustrant l\u2019obs\u00e9dante phrase de Feynman \u00ab\u00a0en bas, il y a beaucoup \u00e0 faire\u00a0\u00bb.<\/em><\/p>\n

    \"IBM \"IBM<\/p>\n

    – 300 \u2013 1, 307 \u2013 12. G\u00c9N\u00c9TIQUE, QUINOA. Christine D. Le g\u00e9nome du quinoa<\/u>. Il y a peu de plantes essentielles \u00e0 la nourriture humaine. On aurait pu penser que, maintenant, le gros de leur s\u00e9quen\u00e7age serait termin\u00e9. Pas si vite\u00a0! On comprend pourquoi avec le cas du quinoa. Son g\u00e9nome correspond \u00e0 la moiti\u00e9 du g\u00e9nome humain. Pour 64% il est form\u00e9 de s\u00e9quences r\u00e9p\u00e9titives difficiles \u00e0 placer l\u2019une par rapport aux autres. C\u2019est une plante t\u00e9traplo\u00efde, issue, il y a quelques 3 \u2013 6 millions d\u2019ann\u00e9es de la combinaison d\u2019un diplo\u00efde d\u2019origine am\u00e9ricaine avec un autre d\u2019origine asiatique. La s\u00e9quence pr\u00e9sent\u00e9e ici sugg\u00e8re l\u2019existence de 45’000 g\u00e8nes. Moins de mille \u00e9taient connus pr\u00e9c\u00e9demment, mais presque tous ceux-ci peuvent \u00eatre identifi\u00e9s dans la s\u00e9quence obtenue, indiquant que la couverture de la lecture est \u00e0 peu pr\u00e8s compl\u00e8te. Comme il se doit, la s\u00e9quence \u00e9claire la nature de la plante et sugg\u00e8re des chemins pour am\u00e9liorer sa culture. En particulier, la plante est naturellement toxique\u00a0; la graine est recouverte d\u2019un produit amer et toxique, la saponine, qui d\u00e9truit les globules rouges. C\u2019est un bon truc de la nature pour prot\u00e9ger la plante des rongeurs, mais cela fait que, pour la consommation humaine, le quinoa doit subir un traitement laborieux. Il y a 7000 ans que les Am\u00e9ricains savent le faire. De temps en temps, apparait naturellement un mutant saponin–<\/sup>. Contrairement \u00e0 ce qui s\u2019est pass\u00e9 avec l\u2019amandier en \u00c9gypte et son cyanure, les Andins n\u2019ont pas trouv\u00e9 le moyen d\u2019adopter ces formes non toxiques. La connaissance du g\u00e9nome sugg\u00e8re que des solutions ne seront peut-\u00eatre pas difficiles \u00e0 obtenir. Il faut le souhaiter, car le quinoa est une plante magnifique qui est capable de s\u2019adapter \u00e0 des conditions diverses comme, par exemple, de pousser de z\u00e9ro et 4000 m d\u2019altitude ainsi que entre -8 et 38\u00b0C.<\/p>\n

     <\/p>\n

    – 298 \u2013 9, 332 –\u00a04; 303 \u2013 4, 335 \u2013 9. GLACIOLOGIE, \u00c9PISODE HEINRICH, OC\u00c9AN, OXYG\u00c8NE. J.-Cl. K. Deux articles qui nous parlent de l\u2019instabilit\u00e9 des oc\u00e9ans.<\/u> L\u2019un concerne des \u00e9v\u00e8nements extr\u00eames de la derni\u00e8re glaciation, l\u2019autre rapportant 50 ans de mesures du taux d\u2019O2 des oc\u00e9ans. Je ne rapporte que le premier.<\/p>\n

    Les \u00e9pisodes Heinrich sont de brusque d\u00e9versement de grandes quantit\u00e9s d\u2019icebergs \u00e0 travers la Baie d\u2019Hudson, entrainant des mat\u00e9riaux terrestres du socle nord-am\u00e9ricain. Ces \u00e9v\u00e8nements brusques se sont r\u00e9p\u00e9t\u00e9s plusieurs fois durant la derni\u00e8re glaciation\u00a0; ils sont associ\u00e9s \u00e0 une mont\u00e9e de plusieurs m\u00e8tres du niveau des oc\u00e9ans. Plusieurs mod\u00e8les ont \u00e9t\u00e9 consid\u00e9r\u00e9s pour expliquer cette instabilit\u00e9. Les auteurs pr\u00e9sentent ici un mod\u00e8le d\u2019enchainement cyclique relativement simple. La figure le sch\u00e9matise.<\/p>\n

    \"Heinrich<\/p>\n

    Le niveau du socle glaciaire s\u2019ajuste lentement avec le poids de la glace. Ainsi, il est courant (nous l\u2019avons vu aussi en Antarctique) que le socle soit plus haut au bord du front glaciaire. Comme le montre la figure, c\u2019est dans cette r\u00e9gion qu\u2019un relativement petit changement de la forme du front glaciaire ouvre ou ferme l\u2019entr\u00e9e d\u2019un courant d\u2019eau chaude en dessous de la surface. (Quand on dit \u00ab\u00a0chaud\u00a0\u00bb, \u00e7a ne veut pas dire \u00ab\u00a0bouillant\u00bb, on parle de moins de 1\u00b0 de diff\u00e9rence. La diff\u00e9rence de densit\u00e9 est compens\u00e9e par la concentration saline). L\u2019effet en est la d\u00e9stabilisation du front par lubrification du socle.<\/p>\n

    17.02.2017. Science 355, 6326.<\/strong><\/p>\n

    – 719 \u2013 22. C\u00c9R\u00c8S, AST\u00c9RO\u00cfDE, ASTROBIOLOGIE. Manu, C\u00e9r\u00e8s contient des min\u00e9raux hydrates riches en ammoniaque, de l\u2019eau, des carbonates, des sels et une grande diversit\u00e9 de mol\u00e9cules organiques dont des chaines aliphatiques\u00a0; bref, tous les signes d\u2019une riche chimique pr\u00e9biotique. <\/u>C\u00e9r\u00e8s est une plan\u00e8te naine de 950km de diam. C\u2019est le plus gros objet situ\u00e9 dans la zone des ast\u00e9ro\u00efdes entre Mars et Jupiter. La sonde am\u00e9ricaine Dawn y est en orbite depuis le 6 mars 2015. Depuis lors, son propulseur ionique en r\u00e9duit lentement l\u2019altitude. Elle tourne actuellement \u00e0 moins de 400 km de la surface. D\u00e8s les premi\u00e8res observations, une \u00e9tonnante r\u00e9gion de riche \u00e9mission mol\u00e9culaire avait \u00e9t\u00e9 rep\u00e9r\u00e9e. Elle est analys\u00e9e en d\u00e9tail dans le pr\u00e9sent article. Le fait que ces signaux sont strictement localis\u00e9s dans une r\u00e9gion de quelque 1000 km2<\/sup> doit encore \u00eatre mieux expliqu\u00e9. On ne pense pas que ce soit le reste d\u2019un impact m\u00e9t\u00e9oritique relativement r\u00e9cent. On pense plut\u00f4t \u00e0 l\u2019effet d\u2019activit\u00e9 hydrothermale faisant remonter du mat\u00e9riel des profondeurs\u2026 profondeurs qui semblent donc bien riches. J\u2019aime l\u2019id\u00e9e de la protobiologie \u2013 biologie peut-\u00eatre \u2013 qui se d\u00e9velopperait en profondeur, par exemple aussi dans l\u2019oc\u00e9an profond d\u2019Europa, satellite de Jupiter.<\/em><\/p>\n

    \"C\u00e9res<\/p>\n

    23.02.2017. Nature 542, 7642<\/strong><\/p>\n

    – 401. CRISPR. \u00c0 qui appartient CRISPR\u00a0? La justice a (mal\u00a0?) tranch\u00e9.<\/u> Voir aussi mon rapport\u00a0: Nature 25.12.2016, 326-7. Le tribunal du bureau US des brevets maintient les brevets pour CRISPR accord\u00e9s au Broad institute du MIT. Ainsi, le tribunal juge que, en appliquant \u00e0 des eucaryotes la m\u00e9thode invent\u00e9e par Mmes Doudna et Charpentier sur des bact\u00e9ries, Zhang du MIT a fait une invention de port\u00e9e comparable \u00e0 celle de ces dames. Reste maintenant \u00e0 savoir si ces dames auront aussi acc\u00e8s \u00e0 une part de l\u2019argent qui se fera en appliquant CRISPR aux eucaryotes (le gros du futur commercial) ou si elles devront se contenter du monde des procaryotes. La lutte judiciaire n\u2019est pas finie et l\u2019imbroglio commercial reste nou\u00e9. Tout cela est lamentable.<\/em><\/p>\n

     <\/p>\n

    – 406 \u2013 408, 503 \u2013 6. \u00c9PITRANSCRIPTOMIQUE, RNA, \u00c9PIG\u00c9N\u00c9TIQUE. Laur\u00e9e. La g\u00e9n\u00e9tique prend place dans les niches que peu avaient imagin\u00e9, mais aussi dans celles que l\u2019on se dit, a post\u00e9riori, mais bien s\u00fbre. C\u2019est le cas pour l\u2019\u00e9pitranscriptomique.<\/u> L\u2019\u00e9pig\u00e9n\u00e9tique, c\u2019est la modification de l\u2019ADN sans changer sa s\u00e9quence de mani\u00e8re \u00e0 contr\u00f4ler la fa\u00e7on dont le message est lu. L\u2019\u00e9pitranscriptomique, c\u2019est la modification des mARN sans en changer la s\u00e9quence Les ARN messagers sont des transcrits du message de l\u2019ADN apport\u00e9s aux ribosomes o\u00f9 il sont traduits en termes de prot\u00e9ines.<\/p>\n

    \"Ribosome<\/p>\n

    Fig provenant de: (DOI\u00a0: 10.1038\/542503a ).<\/p>\n

    Typiquement, un groupe m\u00e9thyle (CH3<\/sub>) est attach\u00e9 \u00e0 certaines bases A de l\u2019ARN. Depuis peu, on caract\u00e9rise les enzymes qui produisent et\/ou annulent ces modifications. On d\u00e9couvre ainsi que l\u2019\u00e9pitranscriptomique est une nouvelle couche de r\u00e9glage dans l\u2019expression des g\u00e8nes. La recherche sur ce domaine n\u2019est possible que depuis peu parce qu\u2019elle est tr\u00e8s exigeante en termes de capacit\u00e9 de s\u00e9quen\u00e7age. En effet, il s\u2019agit de mettre en \u00e9vidence des modifications rares sur les bases des mARN. Or , alors que l\u2019ADN est stable et durable, l\u2019ARN \u00a0est se d\u00e9grade vite et il est soumis \u00e0 un intense m\u00e9tabolisme. Le domaine va certainement se r\u00e9v\u00e9ler consid\u00e9rable, mais il en est qu\u2019\u00e0 ses petits d\u00e9buts. Ce no de Nature pr\u00e9sente deux rapports g\u00e9n\u00e9raux sur ces nouveaux d\u00e9veloppements (disponible chez moi) et un article de recherche d\u00e9montrant l\u2019effet de la transcriptomique lors du d\u00e9veloppement pr\u00e9coce du zebrafish DOI\u00a0: 10.1038\/nature21355.<\/p>\n

    \u00a0<\/u><\/p>\n

    – 421 -3, 456 \u2013 60. PLAN\u00c8TES EXTRASOLAIRES. TRAPPIST-1. Une \u00e9tonnante moisson d\u2019exoplan\u00e8tes\u00a0autour d\u2019une \u00e9toile naine proche; sept d\u2019un coup\u00a0! Elles pourraient toutes ressembler \u00e0 la Terre.
    \n<\/u>Quand se forme un corps c\u00e9leste de la taille du soleil, la temp\u00e9rature au centre est suffisante pour que se d\u00e9veloppent les complexes r\u00e9action nucl\u00e9aires que Hans Bethe a \u00e9t\u00e9 le premier (?) \u00e0 d\u00e9crire. Pour des corps gros comme Jupiter, la plus grosse des plan\u00e8tes du syst\u00e8me solaire, la temp\u00e9rature est insuffisante pour allumer, m\u00eame la plus froide des r\u00e9actions nucl\u00e9aires\u00a0: la fusion de l\u2019hydrog\u00e8ne en h\u00e9lium. Pour une masse l\u00e9g\u00e8rement plus grande, cette r\u00e9action allume une \u00e9toile naine. Celles-ci sont peu lumineuses et extr\u00eamement durables. Les astronomes des exoplan\u00e8tes sont int\u00e9ress\u00e9s par ces \u00e9toiles, car, du fait de leur petites dimension et faible luminosit\u00e9, elles devraient offrir des conditions favorables \u00e0 la d\u00e9tection de transit plan\u00e9taire et l\u2019observation d\u2019\u00e9ventuelles plan\u00e8tes. Le petit t\u00e9lescope TRAPPIST, au Chili, a \u00e9t\u00e9 con\u00e7u \u00e0 cet effet. Ainsi, il a d\u00e9couvert TRAPPIST-1, une \u00e9toile naine situ\u00e9e \u00e0 39 ann\u00e9es-lumi\u00e8re de chez nous, la porte \u00e0 c\u00f4t\u00e9\u00a0!: Apr\u00e8s quoi, ces astronomes (dont notre Didier Queloz de Sauvergny, cod\u00e9couvreur de la premi\u00e8re exoplan\u00e8te) ont longuement observ\u00e9 TRAPPIST-1 avec TRAPPIST. Ils se sont fait aider par quelques tout gros t\u00e9lescopes. Ils ont ainsi observ\u00e9 34 transits qu\u2019ils ont pu attribuer \u00e0 7 plan\u00e8tes tournant en 1.7 \u00e0 17 jours. Ces plan\u00e8tes sont suffisamment proches pour interagir entre elles et les placer en orbites r\u00e9sonantes, c\u2019est-\u00e0-dire que leurs temps de rotation sont entre eux dans des rapports simples. Ceci donne aussi des indications sur leurs masses. Ces 7 plan\u00e8tes ont des dimensions et des densit\u00e9s comparables \u00e0 celle de la Terre et elles ont une temp\u00e9rature compatible avec la pr\u00e9sence d\u2019eau liquide.<\/p>\n

    Avec ce qui est dit ci-dessus de la chimie pr\u00e9biotique de C\u00e9r\u00e8s, avec l\u2019avalanche probable de plan\u00e8tes ressemblant \u00e0 la terre autour des abondantes \u00e9toiles naines, avec, en plus, la tranquille stabilit\u00e9 de ces syst\u00e8mes plan\u00e9taires, offrant du temps sans limites pour les exercices pr\u00e9liminaires de la vie, alors, il est de plus en plus difficile de croire que notre vie terrestre est unique. Reste alors la question de la conscience. Les g\u00e9n\u00e9rations avenir ont du pain sur la planche. Mais, est-il souhaitable de le savoir\u00a0? La prudence devrait \u00eatre de mise. <\/em><\/p>\n

     <\/p>\n

    01.03.2017. Scientific American. <\/strong><\/p>\n

    – 70. ASPERGE, ODEUR. GWA (genome wide association) study of asparagus anosmia.<\/u> Si t\u00f4t apr\u00e8s avoir mang\u00e9 des asperges, le pipi d\u00e9gage une forte odeur. Il s\u2019agit de S-m\u00e9thyl thioester\u00a0– l\u2019odeur est remarquable\u00a0! -, \u00a0mais \u00a060% de notre population n\u2019en sait rien. Ces gens souffrent de l\u2019anosmie de l\u2019asperge, les pauvres\u00a0! L\u2019\u00e9tude mentionn\u00e9e ici par Steve Mirsky (l\u2019homme du podcast du Sci. Am.) cite le num\u00e9ro de No\u00ebl du Bitish Medical Journal (ai-je bien compris\u00a0?) o\u00f9 est rapport\u00e9e une \u00e9tude globale de la g\u00e9n\u00e9tique de ce trait remarquable. Je ne suis pas all\u00e9 voir, mais quelle satisfaction de savoir r\u00e9solu le myst\u00e8re de cette injustice olfactive.<\/p>\n

     <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

    Dans la livraison de f\u00e9vrier, j’ai \u00e9t\u00e9 particuli\u00e8rement int\u00e9ress\u00e9 par les articles suivants: – Nature, 2 f\u00e9vrier, p. 96. Comment prendre une d\u00e9cision en une petite fraction de seconde? L’\u00e9quipe d’A.L\u00fcthi de B\u00e2le l’explique dans le cas de la souris qui choisit entre le comportement d’immobilisation ou de fuite. – Nature, 9.2,152; 16.2. 298, etc. […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"jetpack_post_was_ever_published":false,"footnotes":"","jetpack_publicize_message":"","jetpack_publicize_feature_enabled":true,"jetpack_social_post_already_shared":false,"jetpack_social_options":{"image_generator_settings":{"template":"highway","default_image_id":0,"font":"","enabled":false},"version":2}},"categories":[1,89],"tags":[200,285,298,258,293,110,189,175,294,288,284,76,292,281,291,289,299,296,290,283,295,287,286,282,297],"class_list":["post-1001","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-article","category-science-actualite","tag-agriculture","tag-arctique","tag-asperge","tag-brevet","tag-ceres","tag-climat","tag-crispr","tag-epigenetique","tag-epitranscriptomique","tag-ethnie","tag-gene-drive","tag-genetique","tag-glaciologie","tag-gm","tag-heinrich","tag-nanotechnologie","tag-odeur","tag-planete","tag-quinoa","tag-risque","tag-rna","tag-ste","tag-taille","tag-tomate","tag-trappiste"],"jetpack_publicize_connections":[],"jetpack_featured_media_url":"","jetpack-related-posts":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1001","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=1001"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1001\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=1001"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=1001"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=1001"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}