ENVIRONNEMENT, PR\u00c9SERVATION, DESTRUCTION, US, TRUMP<\/p>\n\n\n\n
-7, 17. Cinq fa\u00e7ons de Trump pour saper la sant\u00e9 de l\u2019environnement.<\/p>\n\n\n\n
Que Trump est un imb\u00e9cile, nous le savons tous. Il est peut-\u00eatre moins clair qu\u2019il m\u00e8ne une politique volontaire et continue de destruction du climat. Le pr\u00e9sent rapport montre comment l\u2019Agence de Protection de l\u2019Environnement a \u00e9t\u00e9 transform\u00e9e en une agence de destruction de l\u2019environnement, au grand d\u00e9sespoir des employ\u00e9s. <\/p>\n\n\n\n
D\u2019abord, son administration poursuit \u00ab un agenda extr\u00eamement agressif \u00bb de d\u00e9molition des r\u00e8glements existants. Ainsi, rien qu\u2019au mois pass\u00e9 (avril) on a : (i) la r\u00e9gulation concernant l\u2019\u00e9mission des nouvelles automobiles qui exigeait une r\u00e9duction annuelle de 5% est ramen\u00e9e \u00e0 1,5%, (ii) la quantit\u00e9 de mercure autoris\u00e9e dans les \u00e9missions des centrales thermiques est consid\u00e9rablement augment\u00e9e et (iii) des efforts majeurs pour limiter les particules fines dans l\u2019air sont mis sous le tapis. Et ceci continue depuis 3 ans de mois en mois. <\/p>\n\n\n\n
Mais il y a plus. C\u2019est la fa\u00e7on m\u00eame d\u2019aborder les probl\u00e8mes de l\u2019environnement qui sont red\u00e9finis pour bloquer le fondement de l\u2019effort. Exemple: sous pr\u00e9texte de transparence, seules peuvent \u00eatre consid\u00e9r\u00e9es les donn\u00e9es qui sont totalement et publiquement accessibles. Ainsi, pour qu\u2019une \u00e9tude sur une maladies puisse \u00eatre consid\u00e9r\u00e9e, il faut que l\u2019identit\u00e9 de chaque personne \u00e9tudi\u00e9e soit publiquement accessible. Ceci n\u2019est pas compatible avec la notion de secret m\u00e9dical. Mais c\u2019est ainsi que l\u2019administration Trump rend ill\u00e9gale la politique bas\u00e9e sur la science. Selon l\u2019auteur de cette note et de l\u2019\u00e9ditorial de ce no, le mal est si tentaculaire que, quand cette nation voudra repartir en avant, il sera long et difficile de faire le nettoyage. <\/p>\n\n\n\n
The sustained undermining of science by the EPA’s leaders is a travesty. <\/em>(2020). <\/em><\/p>\n\n\n\n Nature, 581<\/em>(7806), 7-8. DOI: 10.1038\/d41586-020-01310-y<\/em><\/p>\n\n\n\n SANT\u00c9, PSYCHIATRIE, MALADIE, CLASSIFICATION.<\/p>\n\n\n\n -19-21. Les racines des maladies mentales. Feature, M. Marshall.<\/p>\n\n\n\n Il fut un temps (pas si \u00e9loign\u00e9 et probablement pas tellement oubli\u00e9) o\u00f9 les maladies mentales \u00e9taient d\u00e9termin\u00e9es par le DSM (Diagnostic and Statistic Manual of Mental Disorder) en dernier lieu par sa version 5 de 2013. Tr\u00e8s pratique pour les assurances, \u00e0 chaque maladie correspond une liste de sympt\u00f4mes univoques. Ainsi, si on est schizophr\u00e8ne on n\u2019est pas bipolaire et si on est anxieux, on n\u2019est pas d\u00e9pressif. Le pr\u00e9sent rapport explique que la tendance actuelle va plut\u00f4t dans la direction oppos\u00e9e que r\u00e9sume la figure qui repr\u00e9sente la corr\u00e9lation g\u00e9n\u00e9tique entre les diff\u00e9rents troubles. Comme on le voit, tout est li\u00e9 \u00e0 tout ou presque.<\/p>\n\n\n\n Beaucoup des recherches actuelles visent \u00e0 regrouper les sympt\u00f4mes de mani\u00e8re plus englobante. Certains pensent qu\u2019une classification \u00e0 trois ou deux d\u00e9terminants globaux serait plus utile. D\u2019autres pensent plut\u00f4t en termes de d\u00e9s\u00e9quilibre global de la fonction c\u00e9r\u00e9brale. <\/p>\n\n\n\n Cette approche me fait penser \u00e0 d\u2019autres articles sur l\u2019\u00e9tat pathologique. Celui qui nous tombe dessus est global. Le cancer ou le trouble circulatoire particulier ne sont que des r\u00e9alisations qui suivent en avalanche. <\/em><\/p>\n\n\n\n Int\u00e9ressante fa\u00e7on de penser la maladie ou le trouble psychiatrique. <\/em><\/p>\n\n\n\n Marshall, M. (2020). The hidden links between mental disorders. Nature, 581(7806), 19-21. Retrieved from https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/32372044. doi:10.1038\/d41586-020-00922-8<\/em><\/p>\n\n\n\n CLIMAT, SOL, CARBONE, STOCK.<\/p>\n\n\n\n -63 \u2013 66. La variation mill\u00e9naire du stock de carbone tropical d\u00e9pend d\u2019abord du cycle hydrologique. C. J. Hein et al. avec forte participation des g\u00e9ologues et physiciens de l\u2019ETHZ<\/p>\n\n\n\n Ces derniers temps, nous avons rapport\u00e9 \u00e0 plusieurs reprises des r\u00e9sultats mettant en \u00e9vidence la fragilit\u00e9 du sol des for\u00eats tropicales. On continue.<\/p>\n\n\n\n L\u2019\u00e2ge du carbone stock\u00e9 dans le sol (BOC : biospheric organic carbon) depuis le d\u00e9but de la d\u00e9glaciation (-18’000 ans) est d\u00e9termin\u00e9 dans le grand bassin continental du Nord-Est de l\u2019Inde (Gange et Brahmaputra). (La m\u00e9thode est exigeante ; les g\u00e9ologues et les physiciens de l\u2019ETH y sont impliqu\u00e9s.) \u00c0 l\u2019\u00e9poque, il s\u2019agissait d\u2019une for\u00eat tropicale soumise au r\u00e9gime des moussons. Le r\u00e9sultat global montre que si la temp\u00e9rature est le principal d\u00e9terminant du stock de C dans le sol des for\u00eats des zones temp\u00e9r\u00e9es et bor\u00e9ales, c\u2019est la quantit\u00e9 de pluie qui a \u00e9t\u00e9 d\u00e9terminante en zone tropicale : plus de pluie, plus de respiration du sol, moins de carbone. Il est conclu que l\u2019effet du changement climatique aura probablement un effet n\u00e9gatif sur le BOC des for\u00eats tropicales actuelles.<\/p>\n\n\n\n Hein, C. J., Usman, M., Eglinton, T. I., Haghipour, N., & Galy, V. V. (2020). <\/em>Millennial-scale hydroclimate control of tropical soil carbon storage. Nature, 581(7806), 63-66. doi:10.1038\/s41586-020-2233-9<\/em><\/p>\n\n\n\n 14.05.20 Nature 581, 7807<\/strong><\/p>\n\n\n\n BIOLOGIE STRUCTURALE, COMPARTIMENT CELLULAIRE, <\/p>\n\n\n\n -144-5, 209-14. Compartiment cellulaire fonctionnel non limit\u00e9 par une membrane. <\/p>\n\n\n\n Un jour, une membrane s\u2019est referm\u00e9e sur un petit volume de liquide et ce fut LUCA, le dernier anc\u00eatre commun universel. Ensuite, LUCA, s\u2019est divis\u00e9, a \u00e9volu\u00e9, a repli\u00e9 quelquefois sa membrane et a parfois aval\u00e9 un cousin. Ainsi naquirent toutes les cellules vivantes de notre biologie avec tous leurs compartiments fonctionnels toujours limit\u00e9s par une membrane. <\/p>\n\n\n\n Toujours ? \u00c0 mes \u00e9tudiants, je faisais \u00e9tudier une solution de TMV (virus de la mosa\u00efque du tabac), petit cylindre \u00e9troit et tout droit. \u00c0 faible concentration, les virus flottent librement, ind\u00e9pendamment. \u00c0 forte concentration, ils se groupent en alignements parall\u00e8les compacts. \u00c0 concentration interm\u00e9diaire, les deux \u00e9tats cohabitent : des r\u00e9gions \u00e0 faible densit\u00e9 o\u00f9 le virus flotte sans ordre et des r\u00e9gions o\u00f9 ils forment des alignements parall\u00e8les denses (liquide cristallin). La cohabitation de ces deux \u00e9tats fait jouer l\u2019\u00e9nergie de confinement entre les virus entass\u00e9s et l\u2019entropie (d\u00e9sordre) des virus libres. G=E-TS. C\u2019\u00e9tait une de mes fa\u00e7ons de faire comprendre cette merveilleuse loi de la nature. Elle m\u2019a permis de beaux succ\u00e8s didactiques. Lecteur, si tu m\u2019as lu jusqu\u2019ici, tu peux essayer d’expliquer l\u2019\u00e9quilibre de ces deux phases. (Un indice : chaque degr\u00e9 de libert\u00e9 contient \u00bd kT d\u2019\u00e9nergie.)<\/p>\n\n\n\n Ce qui nous int\u00e9resse ici est ce ph\u00e9nom\u00e8ne thermodynamique de formation d\u2019un domaine structurellement limit\u00e9, mais sans structure de fronti\u00e8re, sans bord, sans membrane. Il abonde dans les cellules. Il y a par exemple les gouttelettes de graisses. Comme pour la condensation du TMV, elles sont faciles \u00e0 comprendre. Le pr\u00e9sent article traite d\u2019une autre classe de ces structures que l\u2019on retrouve dans le noyau : les myst\u00e9rieux nucl\u00e9oles, les corps de Cajal, les corps-P et autres granules de stress. On les a beaucoup n\u00e9glig\u00e9s faute de savoir comment les aborder puisqu\u2019ils n\u2019ont pas de vraie limite. Et pourtant, ils ne sont pas \u00e0 n\u00e9gliger. Le nucl\u00e9ole par exemple est \u00ab l\u2019organe \u00bb o\u00f9 se forment les ribosomes. Au microscope \u00e9lectronique, dans la masse du noyau, on le reconna\u00eet \u00e0 sa texture diff\u00e9rente du reste du noyau et par le fait qu\u2019il se colore facilement. <\/p>\n\n\n\n Le pr\u00e9sent article \u00e9tudie la thermodynamique du RNA ribosomal (rRNA) dans le noyau en pr\u00e9sence de concentration variable de nucleophosmine 1 (NPM1) \u2013 la principale prot\u00e9ine r\u00e9gulant la formation du nucl\u00e9ole. Il d\u00e9montre ainsi le sc\u00e9nario suivant. (i) Les abondants rRNA nucl\u00e9aires se lient \u00e0 des prot\u00e9ines ribosomales formant ainsi une population de rRNP sp\u00e9cifiques. (ii) Sous l\u2019induction de MPMI ces RNP se condensent en une phase complexe riche en autres prot\u00e9ines ribosomales non encore attach\u00e9es. (iii) Dans cette phase se poursuit l\u2019autosynth\u00e8se des ribosomes. (iv) Jusqu\u2019au moment o\u00f9 ceux-ci ayant presque achev\u00e9 leur formation deviennent insolubles dans la phase nucl\u00e9olaire dont ils sont alors rejet\u00e9s avant d\u2019\u00eatre transport\u00e9s (comment ?) dans le cytoplasme o\u00f9 leur maturation est parachev\u00e9e. <\/p>\n\n\n\n Un int\u00e9r\u00eat particulier de cet article vient du traitement thermodynamique th\u00e9oris\u00e9 et mesur\u00e9 quantitativement. Contrairement au cas du TMV et des gouttes lipidiques cit\u00e9s ci-dessus, le syst\u00e8me du nucl\u00e9ole est hors \u00e9quilibre puisque le processus de synth\u00e8se consomme beaucoup d\u2019ATP. Or, la thermodynamique hors \u00e9quilibre est difficile et mal connue. Le commentateur s\u2019\u00e9tonne et admire qu\u2019il soit possible de si bien rendre compte du ph\u00e9nom\u00e8ne observ\u00e9 par les moyens simplifi\u00e9s de la thermodynamique en quasi-\u00e9quilibre. Il se r\u00e9jouit du temps o\u00f9 on saura faire mieux. Le fonctionnement du nucl\u00e9ole pourra continuer \u00e0 offrir un fructueux terrain d’exercice. <\/p>\n\n\n\n Joli ! C\u2019est le mot par lequel je conclus souvent mes articles de biologie. C\u2019est que la biologie est jolie.<\/em><\/p>\n\n\n\n Lee, C. F. (2020). Formation of liquid-like cellular organelles depends on their composition. <\/em>Nature, 581<\/em>(7807), 144-145. doi:10.1038\/d41586-020-01280-1<\/em><\/p>\n\n\n\n Riback, J. A., Zhu, L., Ferrolino, M. C., Tolbert, M., Mitrea, D. M., Sanders, D. W., . . . Brangwynne, C. P. (2020). <\/em>Composition-dependent thermodynamics of intracellular phase separation. Nature, 581(7807), 209-214. doi:10.1038\/s41586-020-2256-2<\/em><\/p>\n\n\n\n 21.05.20 Nature 581, 7808<\/strong><\/p>\n\n\n\n BIOLOGIE, VIROLOGIE, STRUCTURE, M\u00c9DICAMENT, COVID-19<\/p>\n\n\n\n -252 \u2013 5. Feature, M. Scudellari.<\/p>\n\n\n\n Quatre mois avec le virus Corona, pi\u00e8ce par pi\u00e8ce.<\/p>\n\n\n\n Il s\u2019agit du r\u00e9cit haletant de l\u2019\u00e9lucidation de la structure mol\u00e9culaire, des fonctions associ\u00e9es et des voies qui pourraient conduire \u00e0 un vaccin ou \u00e0 un bon m\u00e9dicament, entre le 10 janvier, date \u00e0 laquelle les Chinois ont mis en ligne la s\u00e9quence du COVID-19, jusqu\u2019au 14 mai, date de cl\u00f4ture de l\u2019\u00e9dition de ce no. D\u2019apr\u00e8s cet article, il s\u2019agit d\u2019un f\u00e9brile effort collectif des laboratoires du monde les plus comp\u00e9tents et les mieux \u00e9quip\u00e9s dans un flot continu d\u2019\u00e9change syst\u00e9matique des donn\u00e9es. \u00c9videmment, le r\u00f4le de la cryo-microscopie \u00e9lectronique est central, mais la diffraction des rayons X a aussi toute sa place, car des structures analogues avaient d\u00e9j\u00e0 \u00e9t\u00e9 r\u00e9solues lors de la crise du SARS en 2003, ce qui a permis d\u2019obtenir rapidement de bons cristaux. (La cristallisation est g\u00e9n\u00e9ralement l\u2019\u00e9tape la plus chronophage lors de la d\u00e9termination de structure macromol\u00e9culaire par diffraction des rayons X, la cryo-ME n’en a pas besoin). <\/p>\n\n\n\n On discute beaucoup de la n\u00e9cessit\u00e9 que tout ce savoir soit un bien commun \u00e0 disposition de tous pour le bienfait de l\u2019humanit\u00e9. L\u2019appel de l\u2019OMS du 29 mai en est un fondement \ud83d\ude41<\/em>https:\/\/www.who.int\/fr\/dg\/speeches\/detail\/who-director-general-s-opening-remarks-at-the-media-briefing-on-covid-19—29-may-2020<\/em><\/a>).<\/em><\/p>\n\n\n\n Malheureusement, au moment o\u00f9 est r\u00e9dig\u00e9 le pr\u00e9sent rapport, les USA et l\u2019UK annoncent qu\u2019ils ne joueront pas le jeu en ce qui concerne un futur vaccin. <\/em><\/p>\n\n\n\n doi:10.1038\/d41586-020-01444-z<\/em><\/p>\n\n\n\n CLIMAT, COUVERTURE NEIGE, H\u00c9MISPH\u00c8RE NORD, <\/p>\n\n\n\n -294 – 8. \u00c9volution de la masse de neige dans l\u2019h\u00e9misph\u00e8re Nord de 1980 \u00e0 2018.<\/p>\n\n\n\n Nous sommes tous impressionn\u00e9s par la diminution consid\u00e9rable de la banquise arctique. La masse de la couverture neigeuse de l\u2019h\u00e9misph\u00e8re nord en hiver a-t-elle diminu\u00e9 d\u2019autant ?<\/p>\n\n\n\n Disons d\u2019abord que s\u2019il est facile de savoir si la banquise est pr\u00e9sente ou s\u2019il y a de la neige quelque part, la mesure de la masse de neige est beaucoup plus difficile. Les r\u00e9sultats obtenus pr\u00e9c\u00e9demment laissaient une incertitude de 50%. Dans la pr\u00e9sente \u00e9tude, les auteurs constatent que les donn\u00e9es satellitaires sont entach\u00e9es d\u2019une erreur de 33% qu\u2019ils r\u00e9duisent \u00e0 7% en comparant aux donn\u00e9es in situ.<\/em><\/p>\n\n\n\n Pour faire court, la r\u00e9ponse est NON, la perte de masse de neige est beaucoup moins impressionnante que n\u2019est la disparition de la banquise. La quantit\u00e9 de neige durant le mois le plus couvert (mars) a diminu\u00e9 d\u2019environ 4% par d\u00e9cade en Am\u00e9rique, mais n\u2019a pratiquement pas diminu\u00e9 en Eurasie (Europe, Sib\u00e9rie centrale et Sib\u00e9rie extr\u00eame-orientale.) La neige des r\u00e9gions montagneuses n\u2019a pas \u00e9t\u00e9 incluse dans cette \u00e9tude. <\/p>\n\n\n\n Maintenant, si vous voulez savoir combien \u00e7a fait, alors voil\u00e0 :<\/p>\n\n\n\n 3’062 \u00b135 Gt = 3,062×1012 <\/sup>t.<\/p>\n\n\n\n![\"\"](\"https:\/\/i0.wp.com\/www.dubochet.ch\/jacques\/wp-content\/uploads\/2020\/06\/Fig.-Mental-illness.png?resize=920%2C990&ssl=1\")
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