{"id":585,"date":"2015-03-29T21:43:16","date_gmt":"2015-03-29T19:43:16","guid":{"rendered":"http:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/?p=585"},"modified":"2015-05-08T18:47:09","modified_gmt":"2015-05-08T16:47:09","slug":"science-actualite-mars-2015-debut","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/?p=585","title":{"rendered":"Science actualit\u00e9, mars 2015"},"content":{"rendered":"

01.03.05. Scientific American.<\/strong><\/p>\n

– 15. INN\u00c9 et ACQUIS. Deux fr\u00e8res jumeaux am\u00e9ricains, actuellement de 51 ans, sont astronautes. Mark Kelly a d\u00e9j\u00e0 donn\u00e9! Il a fait plusieurs missions \u00e0 la Station spatiale. Scott est un bleu, il va y monter un de ces prochains jours (c’est fait)<\/em> dans le cadre d’une \u00e9tude sur l’effet \u00e0 long terme d’un s\u00e9jour dans l’espace. Mark fait aussi partie de la mission, mais il restera au sol, il sera la r\u00e9f\u00e9rence exempte du bruit de fond de la variable g\u00e9n\u00e9tique.<\/p>\n

– 50 – 57. \u00c9CHAUFFEMENT CLIMATIQUE. S. Donner. Fantasy island.<\/span> Les 33 iles de Kiribati (100’000 habitants) sont des atolls perdus au milieu de Pacifique. Aucune ne d\u00e9passe 4m. Elles sont l’objet d’un grand mouvement de compassion, d’un substantiel flux d’argent et d’une avalanche de conseils pour les aider face \u00e0 la mont\u00e9e des oc\u00e9ans que le monde \u00e9colobienveillant, mais mal inform\u00e9 imagine d\u00e9j\u00e0 catastrophique. Ce n’est pas le cas, les autochtones, polis, en rient. Stupidement cet article ne donne pas l’estimation de la mont\u00e9e des oc\u00e9ans, mais il constate qu’elle est encore n\u00e9gligeable en pratique et que la surface de ces iles cro\u00eet un peu gr\u00e2ce \u00e0 la bonne gestion des habitants et l’activit\u00e9 des coraux. Je n’ai pas de bons chiffres, mais, \u00e0 ma connaissance, la mont\u00e9e des oc\u00e9ans que l’on peut attribuer \u00e0 l’\u00e9chauffement climatique est probablement de l’ordre de 10cm. Depuis 1960 la moyenne annuelle est d’environ 1.6mm. Durant la derni\u00e8re d\u00e9cennie, elle atteint environ 3mm\/an.<\/p>\n

L\u00e9gende urbaine: les oc\u00e9ans montent, les c\u00f4tes sont rong\u00e9es, d\u00e9j\u00e0 un flux de r\u00e9fugi\u00e9s climatiques fuit la mont\u00e9e des eaux dans les iles du pacifique. \u00c7a viendra sans doute, mais, pour le moment, c’est faux.<\/p>\n

 <\/p>\n

5.3.15. Nature 519<\/strong><\/p>\n

-11. INDE, POLITIQUE SCIENTIFIQUE. Arjun. Le nouveau budget pour la science est connu. Il sera l\u00e9g\u00e8rement en dessous de l’inflation et la recherche sur les \u00e9nergies renouvelables est coup\u00e9e de 68%<\/p>\n

– 13 – 14; 24 – 26. EBOLA. Les d\u00e9g\u00e2ts collat\u00e9raux de l’\u00e9pid\u00e9mie.<\/span> S. Reardon (mental-health). E.C. Hayden (m\u00e8res et enfants). L’\u00e9pid\u00e9mie a touch\u00e9 24’000 personnes, 9’700 sont mortes. Les femmes enceintes forment le groupe le plus touch\u00e9. La personne infect\u00e9e et son enfant survivent rarement \u00e0 l’accouchement qui est aussi particuli\u00e8rement dangereux pour les accompagnants. Un tiers du personnel m\u00e9dical mort d’ebola \u00e9tait engag\u00e9 en gyn\u00e9cologie. Ce fait connu dans la population a pour cons\u00e9quences que ces femmes sont triplement bannies. Elles sont rejet\u00e9es des familles, de l’assistance locale (transports), des centres m\u00e9dicaux locaux. M\u00eame dans les h\u00f4pitaux \u00e9quip\u00e9s – mais surcharg\u00e9s – elles doivent attendre le diagnostic fait dans des centres sp\u00e9cialis\u00e9s avant d’\u00eatre pris en charge. Ainsi, les femmes enceintes sont priv\u00e9es de support m\u00e9dical et humanitaire. Il est estim\u00e9 que 120’000 femmes en sont mortes dans les pays de l’\u00e9pid\u00e9mie.<\/p>\n

– Une petite bonne nouvelle toutefois: l’OMS vient d’approuver un test US simple qui permet de d\u00e9terminer si une personne est infect\u00e9e en 15′. Il ne n\u00e9cessite aucune infrastructure. Jusqu’ici il fallait envoyer un \u00e9chantillon de sang \u00e0 un laboratoire sp\u00e9cialis\u00e9 qui recherchait l’ADN du virus par PCR. Typiquement, il fallait un jour pour cela. La mise \u00e0 disposition du nouveau test est une \u00e9tape d\u00e9cisive pour la lutte contre l’\u00e9pid\u00e9mie. C’est le virologiste Robert Garry de l’Universit\u00e9 de New Orl\u00e9ans qui l’a mis au point avec la firme Corgenix au Colorado. Il s’agit peut-\u00eatre de la premi\u00e8re contribution s\u00e9rieuse de l’industrie pharmaceutique.<\/p>\n

– L’article de Reardon d\u00e9crit quelques probl\u00e8mes de sant\u00e9 mentale li\u00e9s \u00e0 l’\u00e9pid\u00e9mie. Les relations interpersonnelles sont boulevers\u00e9es dans les communaut\u00e9s. On parle de cong\u00e9lation des contacts sociaux. Il faut aussi imaginer la relation soignant-patient alors que le premier tente de traiter le plus de patients possible pendant le temps limit\u00e9 pendant lequel il peut supporter le scaphandre anti-infection. Une population enti\u00e8re va devoir sortir de son traumatisme, mais l’infrastructure pour l’y aider est inexistante. Avant l’\u00e9pid\u00e9mie, il y avait un (1) psychiatre au Lib\u00e9ria et aucun en Sierra L\u00e9one. Le drame Ebola n’est pas termin\u00e9.<\/em><\/p>\n

– 106 – 109. BIOPHYSIQUE. Laur\u00e9e. Dans une prot\u00e9ine, la chaine d’acides amin\u00e9s est repli\u00e9e en une forme sp\u00e9cifique dont r\u00e9sulte la fonction de la mol\u00e9cule. Dans certaines prot\u00e9ines, des portions de la chaine restent d\u00e9sordonn\u00e9es. Ils peuvent, par exemple, jouer le r\u00f4le de tentacule pour accrocher ou repousser des voisins de passage. C’est le cas de l’histone H1 ou de prot\u00e9ines des pores nucl\u00e9aires. Certaines prot\u00e9ines sont intrins\u00e8quement d\u00e9sordonn\u00e9es et on se demande bien ce qu’elles peuvent faire. Le pr\u00e9sent article \u00e9tudie une prot\u00e9ine d\u00e9sordonn\u00e9e (4E-BP2) impliqu\u00e9e dans le contr\u00f4le de la traduction (l’op\u00e9ration de synth\u00e8se des prot\u00e9ines) dans des neurones. La d\u00e9couverte rapport\u00e9e ici montre que cette prot\u00e9ine devient ordonn\u00e9e par adition de groupes phosphates en certains emplacements de la chaine d\u00e9sordonn\u00e9e. Ainsi, une prot\u00e9ine non fonctionnelle, parce qu\u2019informe devient active en prenant sa forme gr\u00e2ce \u00e0 la phosphorylation. Le fonctionnement d’une cellule est contr\u00f4l\u00e9 par des m\u00e9canismes dont la richesse ne cesse de nous \u00e9tonner. Voici donc un m\u00e9canisme et une surprise de plus.<\/em><\/p>\n

\u00a0<\/em><\/p>\n

06.03.15. Science 347, 6226<\/strong><\/p>\n

– 1064 – 5. SANT\u00c9, POLITIQUE. Arjun, Lucy. S. Baker. Revient-on au temps d’avant les antibiotiques?<\/span> Vers 1970, \u00c9douard (mon patron) avait un copain – Anderson si je ne m’abuse – qui \u00e9tait le consultant du gouvernement Anglais pour les probl\u00e8mes de sant\u00e9 publique. Son cheval de bataille \u00e9tait le d\u00e9veloppement des r\u00e9sistances aux antibiotiques. Il d\u00e9non\u00e7ait l’utilisation irresponsable de ces m\u00e9dicaments et pr\u00e9disait le prix qu’il faudra payer.<\/em> Il s’\u00e9chauffait vite!<\/em> Aujourd’hui, la situation est bien avanc\u00e9e. Les souches r\u00e9sistances se d\u00e9veloppent partout. Les m\u00e9canismes qui conduisent \u00e0 la r\u00e9sistance sont impressionnants. Par exemple, SXT est un groupe de g\u00e8nes li\u00e9es qui transmet d’un seul coup au Vibrio cholerae la r\u00e9sistance aux – tenez-vous bien -, sulfamethoxazole, trimethoprimsulfate, chloramphenicole, streptomycine et beta-lactame. Apparu en 73 au Bangladesh, ce facteur se retrouve maintenant partout dans le monde, mais bien d’avantages dans les pays pauvres. Heureusement, on commence \u00e0 s’agiter, m\u00eame au plus haut niveau politique. La recherche de nouveaux microbicides, qui avait \u00e9t\u00e9 largement abandonn\u00e9e depuis des d\u00e9cennies, parce que trop couteuse, est maintenant r\u00e9activ\u00e9e par quelques fortes initiatives politiques. D\u00e9j\u00e0 il y a des succ\u00e8s (Nature 23.1.15; https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/?p=501#more-501). Toutefois le pr\u00e9sent article montre que de nouveaux m\u00e9dicaments n’apporteront qu’une solution locale et momentan\u00e9e. Ce qu’il faut, c’est changer radicalement les conditions d’utilisations. Comme l’illustre dramatiquement l’\u00e9pid\u00e9mie Ebola, la solution n’est pas primairement dans les labos; elle est sur le terrain. Il faudra des moyens, en particulier dans les pays en voie de d\u00e9veloppement o\u00f9, faute de diagnostic pr\u00e9cis et de suivi s\u00e9rieux, on donne n’importe quoi, n’importe quand. Ce n’est pas tellement mieux dans les pays d\u00e9velopp\u00e9s, en particulier avec l’insupportable pratique d’ajouter des antibiotiques \u00e0 la nourriture animale. Pour le moment et pour le futur pr\u00e9visible, ce sont les pauvres qui paient le prix fort.<\/p>\n

– No. sp\u00e9cial. 100 ans RELATIVI\u00c9 G\u00c9N\u00c9RALE.<\/span> Malheureusement, la relativit\u00e9 g\u00e9n\u00e9rale, je ne la comprends pas. Les maths sont trop difficiles. J’en retiens ici deux choses:<\/em><\/p>\n

\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0 <\/em>– La physique moderne repose sur deux bases: (i) la relativit\u00e9 g\u00e9n\u00e9rale et (ii) la physique quantique. Les bases de la seconde ont \u00e9t\u00e9 \u00e9labor\u00e9es par un bon nombre de personnes durant un bon nombre d’ann\u00e9es et elle ne cesse d’\u00eatre approfondie depuis. La relativit\u00e9 g\u00e9n\u00e9rale elle, sort du cerveau d’une seule personne en travail intense et solitaire durant deux ans, publi\u00e9 le 2 d\u00e9cembre 2015 en 4 pages auxquelles rien n’a \u00e9t\u00e9 ajout\u00e9 ni retranch\u00e9 depuis, si ce n’est les innombrables observations confirmant sa rigoureuse exactitude.<\/p>\n

– Arjun. Dans les ann\u00e9es 30, l’Indien Subrahmanyan Chandrasekhar (Chandra) combinant physique quantique et relativit\u00e9 g\u00e9n\u00e9rale conclut que les \u00e9toiles les plus massives deviendraient instables en fin de vie et s’effondreraient sans limite. Eddington, ponte fameux qui avait particip\u00e9 \u00e0 la premi\u00e8re d\u00e9monstration exp\u00e9rimentale de la th\u00e9orie de la relativit\u00e9 g\u00e9n\u00e9rale en 1919, le ridiculisa, estimant qu’il s’agissait d’une \u00ab\u00a0bouffonnerie stellaire\u00a0\u00bb. La querelle dura quelques ann\u00e9es, Chandra quitta l’Angleterre pour les USA et changea de domaine, mais son id\u00e9e re\u00e7u plus tard le nom de trou noir et lui, le prix Nobel de 1983.<\/p>\n

12.3.15. Nature 519<\/strong><\/p>\n

– 166, 193 – 202. BIOLOGIE MOL\u00c9CULAIRE, BIOTECHNOLOGIE. Cl\u00e9ment. Nunez et al, Heler et al., CRISP.<\/span> La d\u00e9couverte d’importance fondamentale de l’immunologie bact\u00e9rienne date de 2007. Elle fonctionne ainsi. Lorsqu’un virus attaque une bact\u00e9rie, des fragments de son ADN sont int\u00e9gr\u00e9s entre des s\u00e9quences sp\u00e9cifiques du g\u00e9nome bact\u00e9rien. On y retrouve alors ce pattern caract\u00e9ristique form\u00e9 d’une succession de s\u00e9quences r\u00e9p\u00e9titives d\u00e9limitant des s\u00e9quences virales diverses accumul\u00e9es au cours des g\u00e9n\u00e9rations. C’est la m\u00e9moire immunologique de la bact\u00e9rie. Associ\u00e9 \u00e0 cette m\u00e9moire existe un processus qui d\u00e9truit le DNA d’un attaquant, reconnu comme homologue \u00e0 une s\u00e9quence m\u00e9moris\u00e9e. C’est remarquable! L’exploration de ce m\u00e9canisme complexe va bon train. Les deux articles cit\u00e9s sont des contributions remarquables.<\/p>\n

Pour nous, toutefois, le plus important avec le syst\u00e8me CRISP, c’est qu’il ouvre la voie \u00e0 l’ing\u00e9nierie pr\u00e9cise et efficace du DNA. Pour en faire quoi? Le bruit circule que, d’une part, des travaux sont en cours sur des embryons humains, et de l’autre, que des prises de position fortes sont sous presse. On va en reparler.<\/em><\/p>\n

– 148 – 50. CONFLIT. Lucy. D. Jones. Wars without end<\/span>. Une approche syst\u00e9mique de la complexit\u00e9 permettrait, pr\u00e9tendent certains, de mieux aborder ces conflits qui n’en finissent pas (Inde-Pakistan, Israel-Palestine, Chypre, RDC, etc.) On comprend ainsi que, sur la fonction de paysage du conflit, une situation qui semble bloqu\u00e9e dans un trou de potentiel sans issu visible peut se r\u00e9soudre si l’on enrichit la fonction, typiquement, en augmentant le nombre de dimensions consid\u00e9r\u00e9es ou par une meilleure analyse empirique de leurs relations. C’est tout \u00e0 fait le genre de raisonnement que je d\u00e9veloppe dans mon chapitre \u00ab\u00a0faire juste\u00a0\u00bb.<\/em> L’id\u00e9e est certainement correcte, mais sur quoi d\u00e9bouche-t-elle? (i) Sur le bon conseil qu’il faut voir large et bien \u00e9valuer les diff\u00e9rents aspects du conflit ou (ii) qu’une simulation informatique de mille robots virtuels conduira \u00e0 des solutions r\u00e9alistes que nul n’avait imagin\u00e9s. Bof, j’ai peu d’espoirs avec la deuxi\u00e8me approche. Je crains plut\u00f4t qu’elle d\u00e9tourne de la simple n\u00e9cessit\u00e9 de bien penser. <\/em><\/p>\n

13.3.15. Science 347, 6227.<\/strong><\/p>\n

– ENVIRONNEMENT, \u00c9CONOMIE. Lucy, Gilles, Peter. S. Naem et al. <\/span>(40 scientifiques d’institutions diverses, principalement US). La bonne science pour payer le service \u00e0 l’\u00e9cosyst\u00e8me.<\/span> La politique classique de protection de l’environnement veut que le pollueur paie. Aujourd’hui, on tend vers le syst\u00e8me proactif du PES: payer pour le service de l’\u00e9cosyst\u00e8me. La m\u00e9thode s’\u00e9tend dans l’agriculture suisse. Typiquement on en voit la marque dans les bandes de terrain non cultiv\u00e9 le long des chemins ou les vaches sorties de l’\u00e9table en hiver. Elle l’est plus encore au niveau mondial. Le protocole de Kyoto en est le fameux exemple. Les buts r\u00e9vis\u00e9s du mill\u00e9naire de l’ONU pourraient en faire grand cas apr\u00e8s 2015. Trois domaines sont particuli\u00e8rement concern\u00e9s: l’eau, le carbone et la biodiversit\u00e9. Le probl\u00e8me est que la mise en oeuvre des PES de mani\u00e8re politiquement robuste et scientifiquement solide est difficile. Ainsi, on constate par exemple que le protocole de Kyoto ne fonctionne pas, comme le prouve la valeur d\u00e9risoire de la tonne de CO2, et les paysans suisses nous disent assez les \u00e2neries que leur font faire les \u00ab\u00a0sp\u00e9cialistes\u00a0\u00bb de l’administration. Le pr\u00e9sent article analyse tous les PES identifiables de par le monde et constate que la majorit\u00e9 \u00a0d\u2019entre eux ne sont pas scientifiquement fond\u00e9s. Fort de cette analyse les auteurs d\u00e9finissent les crit\u00e8res qui doivent \u00eatre respect\u00e9s pour rendre les projets scientifiquement acceptables. Ils incluent: un but clairement d\u00e9fini, une situation de d\u00e9part connue, une action scientifiquement motiv\u00e9e, une proc\u00e9dure d’\u00e9valuation, etc. Le principe des PES pourrait \u00eatre une forte m\u00e9thode politicoscientifique pour le d\u00e9veloppement durable. Encore faut-il savoir l’utiliser. C’est comme pour la marche du monde, de l’Europe et m\u00eame de la Suisse, qui semble trop compliqu\u00e9 pour \u00eatre conduite (Gilles). Les efforts pour mieux conduire sont bienvenus.<\/em><\/p>\n

– 1240 – 42. EBOLA, SANT\u00c9. Akosh. Takahashi et al. Danger de rougeole postebola<\/span>. Le syst\u00e8me sanitaire des pays touch\u00e9s par l’\u00e9pid\u00e9mie Ebola s’est effondr\u00e9. Nous avons parl\u00e9 des d\u00e9g\u00e2ts collat\u00e9raux affectant les m\u00e8res et les nouveau-n\u00e9s (Nature, 5.3.15). Ici est discut\u00e9 le risque li\u00e9 \u00e0 l’interruption de la vaccination de la rougeole. Il faut savoir que la rougeole est extr\u00eamement contagieuse; on compte que chaque malade transmet la maladie \u00e0 15 autres personnes; pour Ebola, le chiffre est inf\u00e9rieur \u00e0 2, m\u00eame au pire moment de la crise. Selon les donn\u00e9es \u00e9pid\u00e9miologiques pr\u00e9sent\u00e9es, une interruption de la vaccination pendant 18 mois causera de l’ordre de 200’000 cas suppl\u00e9mentaires avec autant de morts qu\u2019en a caus\u00e9es l’\u00e9pid\u00e9mie d’Ebola. Pour l’\u00e9viter, une seule solution: une campagne intensive de vaccination dans les r\u00e9gions en danger. NB. Cet article comme beaucoup d’autres est certainement li\u00e9 au changement de vitesse dans la recherche sur la fa\u00e7on dont se d\u00e9veloppe une \u00e9pid\u00e9mie. Pour Ebola m\u00eame, les r\u00e9sultats n’ont pas \u00e9t\u00e9 impressionnants. A-t-on ainsi fait des progr\u00e8s? Nous aurons sans doute l’occasion de le savoir bient\u00f4t.<\/em><\/p>\n

– 1243 – 6. PSYCHOLOGIE, POLITIQUE. Lucy. Wojcik et al. Les gens de droite se pr\u00e9tendent plus heureux, ceux de gauche le sont. <\/span>La psychologie pr\u00e9tend devenir quantitative par le BigData et la statistique. Est-ce que \u00e7a marche? Pas de r\u00e9ponse avec le pr\u00e9sent article, mais beaucoup de questions.<\/em> Il est bien \u00e9tabli (r=0.12) que les gens de droite se disent plus heureux que les gens de gauche. Sans doute sur une base husserlienne, l’auto\u00e9valuation du bonheur est consid\u00e9r\u00e9e comme l’approche la plus solide (il s’agit d’\u00e9valuer des phrases du genre \u00ab\u00a0en gros, ma vie est presque id\u00e9ale\u00a0\u00bb; voir YourMoral.org pour s’y essayer). Ces r\u00e9sultats sont valid\u00e9s, normalis\u00e9s, quantifi\u00e9s selon diff\u00e9rents param\u00e8tres. Le pr\u00e9sent article met en question la valeur de l’auto\u00e9valuation du bonheur. Il se demande s’il n’existe pas un biais syst\u00e9matique d\u00fb \u00e0 un ph\u00e9nom\u00e8ne d’amplification par autoconviction. Pour \u00eatre plus objectifs, les auteurs utilisent (i) les mots prononc\u00e9s (emotion scale in psychological litterature PANAS-X pour analyser les \u00ab\u00a0emoticons\u00a0\u00bb joyeux ou tristes) et (ii) la physionomie analys\u00e9e par ordinateur. Il s’agit l\u00e0 d’\u00e9valuer si le sourire est du type Duchenne (coin de la bouche relev\u00e9 et activit\u00e9 p\u00e9riocculaire = le bon sourire) ou non-Duchenne dans lequel manque l’activit\u00e9 p\u00e9riocculaire ce qui en fait un faux sourire.\u00a0 Munis de ces deux ensembles de param\u00e8tres, les auteurs analysent les paroles et des images des politiciens du Congr\u00e8s US ainsi que 47’000 Twitts de personnes identifi\u00e9es comme conservatrices ou lib\u00e9rales. C’est ainsi qu’ils arrivent \u00e0 la conclusion susmentionn\u00e9e, renforc\u00e9e de moult r, beta, P et chi2<\/sup>.<\/p>\n

Reste \u00e0 remarquer que le r\u00e9sultat me plait et \u00e0 me demander: fait-il sens? Plus g\u00e9n\u00e9ralement: que vaut cette psychologie quantitative sur le Big Data? J’ai l\u2019impression que dans notre institut, on est beaucoup plus s\u00e9v\u00e8re dans l’analyse des donn\u00e9es de populations et beaucoup plus modeste dans les conclusions. Subsidiairement, pensant aux biais qui sont majoritaires dans les \u00e9tudes m\u00e9dicales, comment ne pas \u00eatre prudent face \u00e0 une conclusion pareillement plaisante?\u00a0<\/em><\/p>\n

19.3.15. Nature 519.<\/strong><\/p>\n

– MUSIQUE, HISTOIRE. Agnes. Un podcast: http:\/\/go.nature.com\/xhluk3. Le p\u00e8re de Galli\u00e9e \u00e9tait un luthiste obs\u00e9d\u00e9 de musique, mais l’interaction entre science et musique ne s’arr\u00eate pas l\u00e0.<\/p>\n

– 266. EBOLA. Depuis la semaine pass\u00e9e, un m\u00e9dicament canadien pour soigner les personnes malades est en test en Sierra Leone. Les pr\u00e9misses sont favorables. Ainsi, on pourrait se retrouver tr\u00e8s bient\u00f4t avec (i) un test rapide et facile pour d\u00e9tecter les malades, (ii) un m\u00e9dicament pour les soigner et (iii) un vaccin pour prot\u00e9ger la population. On tient les pouces. <\/em><\/p>\n

– 276. SANT\u00c9. E.Dolgin. The myopia boom.<\/span> Les gens du Sud-est asiatique deviennent massivement myopes. Que se passe-t-il? Des exp\u00e9riences sugg\u00e8rent qu’ils ne vont pas assez \u00e0 la lumi\u00e8re du soleil. Cette condition pose des risques de c\u00e9cit\u00e9 avec l’\u00e2ge. Les teenagers de Shanghai font leur devoir 15h par semaine contre 5-6 aux USA et en Angleterre. Qu’en est-il en Chine? Je rapportais r\u00e9cemment un article du New York Review (https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/?p=435) pr\u00e9disant la faillite du syst\u00e8me chinois parce qu’il pousse \u00e0 l’apprentissage massif plut\u00f4t qu’\u00e0 la compr\u00e9hension et la cr\u00e9ativit\u00e9.<\/p>\n

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– 309 – 314. G\u00c9N\u00c9TIQUE, POPULATION. Leslie et al. The fine-scale genetic structure of the British population.<\/span> Un article pour illustrer ce que la combinaison de l’analyse g\u00e9n\u00e9tique et la statistique nous enseigne. On \u00e9tudie le g\u00e9nome de 2000 Anglais de pure souche (c’est \u00e0 dire dont les 4 grands-parents habitaient dans un rayon de 80 km) que l’on groupe par proximit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique. Ainsi, l’\u00e9tude porte sur la population anglaise avant les grands chamboulements de la mondialisation. On d\u00e9finit ainsi 17 groupes nettement distincts. Il faut bien dire que c’est la statistique sur un demi-Millon de sites d’ADN pour chaque individu qui r\u00e9v\u00e8le cette proximit\u00e9 \u00e0 l’int\u00e9rieur du groupe. \u00c0 vue de nez on ne voit pratiquement pas de diff\u00e9rence entre les groupes. Sur la figure ci-dessous, chaque groupe a sa couleur et les 2000 individus sont plac\u00e9s sur la carte. Ce qui saute aux yeux, c’est \u00e0 quel point la population est structur\u00e9e et comment la g\u00e9n\u00e9tique et la statistique le r\u00e9v\u00e8lent. La 2e partie de l’article ajoute 6000 individus de l’Europe continentale. Apparaissent alors toutes les migrations et les peuplements de l’histoire de l’Angleterre. On apprend par exemple que la population primitive de Celtes n’\u00e9tait pas uniforme, pas plus que celle des Saxons venus plus tard. Ceux-l\u00e0 ont apport\u00e9 pr\u00e8s de la moiti\u00e9 du patrimoine g\u00e9n\u00e9tique actuel.<\/p>\n

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20.3.15.Science 347, 6228<\/strong><\/p>\n

– 1298. BIOLOGIE, CHIMIE. R.F. Service. Origine de la vie.<\/span> Un article de J. Szostak (gr. Sutherland \u00e0 Boston) online dans Nature Chemistry. Pour que la vie telle que nous la connaissons puisse commencer, il faut trois types de mol\u00e9cules: des acides nucl\u00e9iques (genre ARN), des prot\u00e9ines et des lipides. Malheureusement, les conditions qui favorisent la synth\u00e8se abiotique d’un type semblaient jusqu’ici contraires aux conditions favorisant les autres. L’article en question semble avoir trouv\u00e9 une recette. Partant de HCN et de H2S – des compos\u00e9s bien compatibles avec la chimie terrestre originale – il identifie des voies de synth\u00e8ses activ\u00e9es par l’UV d\u00e9bouchant sur chacun des 3 types de mol\u00e9cules. Un progr\u00e8s substantiel.<\/p>\n

– 1300 – 01. G\u00c9N\u00c9TIQUE, BIO\u00c9TIQUE, POLITIQUE. Cont. Rapport par J. Bohannon et G. Vogel. Ing\u00e9neuring g\u00e9n\u00e9tique. (Voir aussi Nature 26.3). Avec CRISPR, Gene drive, etc. la technologie g\u00e9n\u00e9tique sort du bricolage pour devenir un outil m\u00fbr. Il n’y a plus moyen de tourner autour du pot, il faut d\u00e9cider ce que l’on en fait. La r\u00e9alit\u00e9 pourrait nous prendre de vitesse. Un article chinois d\u00e9crivant une intervention sur un embryon humain serait en publication. Un fort groupe, incluant ceux qui avaient initi\u00e9 le moratoire d’Asilomar en 1975, s’est r\u00e9uni en janvier \u00e0 Napa (Ca) pour \u00e9tudier les mesures \u00e0 prendre pour que les b\u00e9n\u00e9fices potentiels soient d\u00e9velopp\u00e9s surement et \u00e9thiquement. <\/em>\u00a0L’article sera publi\u00e9 dans Science du 3 avril. Il est d\u00e9j\u00e0 online<\/p>\n

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26.3.15. Nature 519<\/strong><\/p>\n

– 389. NEUROBIOLOGIE, POLITIQUE. Gilles. Cont. \u00c9ditorial. Repenser le Humain Brain Project<\/span>. Il y a 9 mois, une fronde de scientifiques europ\u00e9ens se dressa contre le Humain Brain Project (HBP) et Henry Markram de l’EPFL (www.neurofuture.eu). Ce projet one-man-show \u00e9tait d\u00e9nonc\u00e9 pour son \u00e9troitesse conceptuelle et la d\u00e9raison de ses pr\u00e9tentions. Un comit\u00e9 ind\u00e9pendant fut d\u00e9sign\u00e9. Il vient de rendre son rapport qui corrobore pratiquement toutes les plaintes adress\u00e9es l’an pass\u00e9. En particulier il reconnait que le but de mod\u00e9lisation du cerveau est irr\u00e9aliste dans la situation actuelle et la gouvernance autocratique de Markram est l\u00e9thale pour les collaborations qui devaient \u00eatre au coeur du projet tel que voulu par la Commission. Que va-t-il se passer maintenant? Le projet central va \u00eatre d\u00e9grad\u00e9, d’autres aspects de la recherche sur le cerveau vont y \u00eatre associ\u00e9s; l’ensemble diversifi\u00e9 prendra \u00e9ventuellement sa place dans la neurobiologie actuelle. Reste \u00e0 savoir si (i) l’Europe soutiendra encore le projet phare une fois celui-ci rentr\u00e9 dans le rang, et (ii) quel sera le r\u00f4le qui restera \u00e0 l’EPFL. \u00c0 suivre – voir aussi Science du 27.3, ci-dessous.<\/p>\n

-402 – 405. BIOTECHNOLOGIE, \u00c9CONOMIE, INNOVATION. Gilles. H. Ledford. Le camp pousse-biotech. Silicon Valley est une ic\u00f4ne de l’\u00e9conomie conqu\u00e9rante de la fin du 20e si\u00e8cle. On le sait. Certains r\u00eavent de r\u00e9p\u00e9ter l’op\u00e9ration avec les biotechs. Cet article d\u00e9crit 9 semaines d\u2019une \u00e9cole destin\u00e9es \u00e0 ceux qui esp\u00e8rent y contribuer. Les recettes \u00e0 d\u00e9velopper sont simples: ne pas avoir une id\u00e9e, mais \u00eatre pr\u00eat \u00e0 sauter sur toutes; pas trop de temps au labo; interviewer, interviewer, interviewer, convaincre viendra dans un autre cadre. Le fond de l’article donne l’ambiance: arrogance, virilit\u00e9, certitude d’\u00eatre le meilleur; du moins, il s’agit de faire semblant. Ce n’est qu’un article de journaliste; est-il significatif? Il illustre en tout cas un courant fondamental de notre soci\u00e9t\u00e9. Vivement plus de femmes avant qu\u2019elles n\u2019en soient d\u00e9shumanis\u00e9es.<\/p>\n

– 410 – 11. BIO\u00c9THIQUE, G\u00c9N\u00c9TIQUE. Jean. Cont. Lanphier et al. N’\u00e9ditez pas la lign\u00e9e germinale humaine.<\/span> Les auteurs sont de ceux qui ont d\u00e9velopp\u00e9 les m\u00e9thodes pour modifier l’ADN des cellules de mani\u00e8re cibl\u00e9e et ils travaillent \u00e0 utiliser ces m\u00e9thodes pour corriger des maladies dans le cadre de \u00ab\u00a0The Alliance for Regenerative Medecine\u00a0\u00bb, vaste regroupement allant d’associations de patients jusqu’\u00e0 des firmes de biotechnologie en passant par des ONG et autres organisations non commerciales. Leur prise de position a du poids. Les auteurs nous apprennent que des travaux portant sur la modification du g\u00e9nome d’embryons vont \u00eatre publi\u00e9s incessamment. On devait s’y attendre avec le r\u00e9cent d\u00e9veloppement de la technique CRISPR\/Cas9 dont nous avons souvent parl\u00e9 ici (voir ci-dessus, Nature 12.3.15). La pression monte. Les auteurs demandent un moratoire sur toute modification de la lign\u00e9e germinale et l’initiation d’une large discussion. Il s’agit bien de limiter l’action aux lign\u00e9es germinales (celles dont les modifications passeront aux descendants) et non pas aux cellules somatiques pour lesquelles la th\u00e9rapie g\u00e9nique peut \u00eatre bienvenue (selon l’avis des auteurs, que je partage). Le probl\u00e8me ne concerne pas la Suisse puisque la manipulation des cellules germinales y est sp\u00e9cifiquement et constitutionnellement interdite, ni 14 autres des 22 nations europ\u00e9ennes. Pourtant il est consid\u00e9rable et in\u00e9vitable.<\/p>\n

Voir aussi: http:\/\/www.technologyreview.com\/featuredstory\/535661\/engineering-the-perfect-baby\/<\/p>\n

– 443 – 445; N&W 417 – 8. EAU, CRYO-EM. Algara-Siller et al. Glace cubique et glace carr\u00e9e.<\/span> La mol\u00e9cule d’eau se place naturellement au centre d’un cube dont 4 sommets sont occup\u00e9s par les mol\u00e9cules voisines. En ajoutant un \u00abetc.\u00bb on obtient la glace cubique, bien connue en cryo-ME, ou hexagonal, bien connue de tous. Ici, les auteurs laissent l’attraction mutuelle de deux lames de graph\u00e8ne expulser l’eau prise en sandwich jusqu’\u00e0 ne laisser qu’une ou quelques couches monomol\u00e9culaires. Le graph\u00e8ne, cet \u00e9tonnant arrangement 2-dimensionel de carbone, forme des plans monoatomiques extraordinairement plats et solides. \u00c9cras\u00e9 entre ces plans, l’arrangement cubique habituel des mol\u00e9cules d’eau est aplati en carr\u00e9. Les 4 liaisons de la mol\u00e9cule d’eau \u00e9tant toutes occup\u00e9es dans ce plan, il ne reste plus de liaisons disponibles pour lier d’autres mol\u00e9cules d’eau dans la 3e dimension. La couche d’eau monomol\u00e9culaire est ainsi parfaitement hydrophobe et ces lames d’eau carr\u00e9es glissent l’une sur l’autre comme eau sur graisse. Dans cette histoire, est-ce l’eau ou le carbone qui nous surprennent le plus? En tout cas, on admire; la nature et la photo.<\/p>\n

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27.3.15. Science 347, 6229<\/strong><\/p>\n

– 1397. POLITIQUE SCIENTIFIQUE- <\/strong>\u00c9ditorial. Ils sont fous ces Am\u00e9ricains. <\/em><\/span>L’augmentation des tremblements de terre en Oklahoma: Silence impos\u00e9 \u00e0 l’office de g\u00e9ologie de l’\u00c9tat. \u00c9chauffement climatique et d\u00e9veloppement durable: des mots interdits aux employ\u00e9s d’\u00c9tats de Floride. Il y a 10 ans, le d\u00e9partement d’\u00c9tat voulait imposer le silence aux employ\u00e9s du service f\u00e9d\u00e9ral de la faune. En r\u00e9ponse, en 2009, Obama garantit la libre expression des chercheurs et la protection des d\u00e9nonciateurs. Vivement que cette protection s’\u00e9tende aux \u00c9tats.<\/p>\n

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– 1406 – 7. NEUROBIOLOGIE, POLITIQUE SCIENTIFIQUE. Enserink. Red\u00e9marrage d’un milliard c\u00e9r\u00e9bral.<\/span> Il s’agit du Humain Brain Project. Le rapport de Science est plus s\u00e9v\u00e8re que celui de Nature (26.3). Au d\u00e9part il y a eu la lettre de A. Pouget de Gen\u00e8ve et Z. Mainen de Lisbonne, soutenue par une centaine de scientifiques, protestant contre la marche du Human Brain Project (HBP). \u00ab\u00a0Un de nos buts \u00e9tait de mettre fin \u00e0 l’affaire entre Markram et les m\u00e9dias\u00a0\u00bb. Un panel de scientifiques de haut niveau fut d\u00e9sign\u00e9 – sans Markram ni les deux protestataires. \u00ab\u00a0Un consensus eut \u00e9t\u00e9 difficile avec Henry et moi (Pouget) dans la m\u00eame salle.\u00a0\u00bb La Commission europ\u00e9enne d\u00e9signa aussi un panel anonyme. Les deux groupes arrivent essentiellement aux m\u00eames conclusions telles que: \u00ab\u00a0extremly troubling unrealistic claims; HBP needs honest and more modest strategy; need for a new interntional gouvernance entity\u00a0\u00bb. P. Gillet, vice-pr\u00e9sident de l’EPFL accepte toutes ces conclusions. Markram n’est pas disponible. Reste maintenant \u00e0 les mettre en pratique . L\u00e0 r\u00e9side la grande incertitude.<\/p>\n

– 1441 – 46. CRYO-ME, BIOLOGIE STRUCTURALE. Urnavicus et al. (MRC, Cambridge) \u00b5-tubules, dyneine et dynactine. La prot\u00e9ine dyn\u00e9ine est la principale locomotive du transport le long des voies que sont les \u00b5-tubules. La dynactine est un cofacteur essentiel. Cette \u00e9tude par cryo-me \u00e0 une r\u00e9solution de 8 – 4\u00c5 d\u00e9crit ce gros complexe de 23 sous-unit\u00e9s comprenant deux filaments de type actine de 4 et 5 sous-unit\u00e9s. Un mod\u00e8le de fonctionnement en est d\u00e9duit. Je compte les points pour la cryo; en voil\u00e0 un gros de plus.<\/p>\n

– 1480 – 84. \u00c9DUCATION, STATISTIQUE. Widom et al. Transmission interg\u00e9n\u00e9rationnelle d’abus sur les enfants: r\u00e9alit\u00e9 et biais de d\u00e9tection.<\/span> C’est un fait connu et robuste: les enfants abus\u00e9s ont tendance \u00e0 devenir des parents abuseurs. Les auteurs \u00e9largissent, contr\u00f4lent par enqu\u00eates individuelles et r\u00e9analysent les donn\u00e9es. Ils concluent que l’effet est un biais d\u00fb au fait que les parents connus pour avoir eux-m\u00eames subi des abus sont surveill\u00e9s de plus pr\u00e8s et sont plus facilement identifi\u00e9s comme abuseurs. Le pr\u00e9tendu effet disparait lorsque qu’il est tenu compte de ce biais. Reste le drapeau rouge de danger qu’il faut agiter chaque fois que s’accumulent les mots-cl\u00e9s tels que: statistique, sciences sociales, politiques, \u00e9conomie, int\u00e9r\u00eats financiers, morale. Dans ce cas, j’agite.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

01.03.05. Scientific American. – 15. INN\u00c9 et ACQUIS. Deux fr\u00e8res jumeaux am\u00e9ricains, actuellement de 51 ans, sont astronautes. Mark Kelly a d\u00e9j\u00e0 donn\u00e9! Il a fait plusieurs missions \u00e0 la Station spatiale. Scott est un bleu, il va y monter un de ces prochains jours (c’est fait) dans le cadre d’une \u00e9tude sur l’effet \u00e0 […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"jetpack_post_was_ever_published":false,"footnotes":"","jetpack_publicize_message":"","jetpack_publicize_feature_enabled":true,"jetpack_social_post_already_shared":false,"jetpack_social_options":{"image_generator_settings":{"template":"highway","default_image_id":0,"font":"","enabled":false},"version":2}},"categories":[1,89],"tags":[180,76,160],"class_list":["post-585","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-article","category-science-actualite","tag-biologie-moleculaire","tag-genetique","tag-population"],"jetpack_publicize_connections":[],"jetpack_featured_media_url":"","jetpack-related-posts":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/585","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=585"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/585\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=585"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=585"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=585"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}