{"id":587,"date":"2015-05-23T12:15:53","date_gmt":"2015-05-23T10:15:53","guid":{"rendered":"http:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/?p=587"},"modified":"2015-05-23T19:16:00","modified_gmt":"2015-05-23T17:16:00","slug":"science-actualite-avril-2015-debut","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/?p=587","title":{"rendered":"Science – actualit\u00e9, avril 2015"},"content":{"rendered":"

01.04.05. Scientific American.<\/strong><\/p>\n

– 11 – 12. NEUROBIOLOGIE, BIOLOGIE MOL\u00c9CULAIRE. Laur\u00e9e. R. Jacobson. The persistence of memory. <\/span> On explique g\u00e9n\u00e9ralement la m\u00e9moire \u00e0 court terme (m\u00e9moire de travail, le No. de t\u00e9l\u00e9phone que l’on compose \u00e0 partir de l’annuaire) par l’activit\u00e9 \u00e9lectrique du cerveau. Elle est inscrite dans les trains de d\u00e9charges coordonn\u00e9es qu’envoient les neurones. Cette activit\u00e9 contribue \u00e0 la formation ou la destruction de synapses modifiant petit \u00e0 petit le r\u00e9seau neuronal qui forme le substrat de la m\u00e9moire \u00e0 long terme. La p\u00e9riodes interm\u00e9diaires (minute \u00e0 heure) est myst\u00e9rieuse; on se rend compte qu’il faudrait quelque chose pour la porter mais on ne sait pas quoi. Le pr\u00e9sent article rapporte une remarquable exp\u00e9rience. Activ\u00e9 par une exposition prolong\u00e9e \u00e0 de petites d\u00e9charges \u00e9lectriques, le cerveau d’Aplysia (une esp\u00e8ce de limace) exprime de nouvelles synapses qui rendent ces neurones r\u00e9actifs aux d\u00e9charges. Les neurones sont alors isol\u00e9es et mis en culture. Apr\u00e8s quelques jours, ces neurones \u00e9tablissent un nouveau r\u00e9seau de connections synaptiques qui, c’est normal, n’a plus la m\u00e9moire de l’histoire pass\u00e9e. Pourtant, surprise, surprise, deux jours apr\u00e8s la stimulation qui ne donnait rien initialement, le r\u00e9seau synaptique retrouve sa r\u00e9activit\u00e9 face \u00e0 la stimulation \u00e9lectrique. Le r\u00e9seau synaptique est d\u00e9truit mais la m\u00e9moire revient doucement lorsue revient le stimuli innitial. Il faut croire qu’elle se cache ailleurs. Dans les g\u00e8nes imagines l’auteur D. Glazman d’UCLA, proposant ainsi un beau chapitre \u00e0 creuser pour les \u00e9pig\u00e9n\u00e9ticiens. Personnellement, je r\u00eave depuis longtemps que des prot\u00e9ines de type prions puissent porter la m\u00e9moire chimique interm\u00e9diaire. L’id\u00e9e est la suivante. Nous voulons un syst\u00e8me du genre flip-flop qui flip sous l’effet d’un signal (ce pourrait \u00eatre la d\u00e9charge de la synapse) et qui revienne tranquillement \u00e0 l’\u00e9tait initial par un flop au bout de quelques minutes ou quelques heures. Le probl\u00e8me est que, au niveau mol\u00e9culaires, la thermodynamiques favorise un flip-flop rapide (\u00e0 cette \u00e9chelle, la micro-seconde est longue). Les mol\u00e9cules qui flippent durablement le font g\u00e9n\u00e9ralement de mani\u00e8re irr\u00e9versible. Elles ne nous int\u00e9ressent pas. En biologie, les cycles \u00e0 longue constante de temps existent pourtant. On pense \u00e0 l’effet d’un g\u00e8ne ou la polym\u00e9risation-d\u00e9polym\u00e9risation des \u00b5-tubules. Toutefois ces syst\u00e8mes sont lents parce qu’ils sont extr\u00eamement complexes alors que nous aimerions un syst\u00e8me simple et peu couteux. Le prion pathologique est une des rares mol\u00e9cule simple qui fasse son flip apr\u00e8s une tr\u00e8s longue attente. Se peut-il que le prion non pathologique – dont on ne connait toujours pas la fonction – puisse faire flop dans les synapses quelques minutes ou quelques heures apr\u00e8s le flip induit par le message \u00e9lectrique? Ceci est une \u00e9lucubration gratuite.<\/em><\/p>\n

– 47 – 51. PSYCHOLOGIE, NEUROBIOLOGIE. R.F. Baumeister, Conquer yourself, conquer the world.<\/span> Anecdotes: (i) jeune adulte, j’avais re\u00e7u de Mich\u00e8le un minuscule bouquin, \u00ab\u00a0la volont\u00e9\u00a0\u00bb qui pr\u00f4nait de la d\u00e9velopper par des exercices. Il m’a \u00e9t\u00e9 important est l’est encore. De l\u00e0 j’ai mes habitudes – limit\u00e9es – de relaxation et de contr\u00f4le de soi. (ii) Lors d’une r\u00e9cente rencontre conflictuelle, j’avais vaillamment lutt\u00e9 lors de la premi\u00e8re altercation. Lorsqu’est venue la 2e , qui \u00e9tait d’ailleurs aussi pr\u00e9visible que la premi\u00e8re, je n’ai pas boug\u00e9, comme si, ayant d\u00e9j\u00e0 donn\u00e9, j’\u00e9tais dispens\u00e9 de me mobiliser \u00e0 nouveau.<\/em><\/p>\n

Depuis des d\u00e9cennies, la psychologie valorise l’estime de soi comme base \u00e0 la bonne vie. Il semblerait que la psychologie exp\u00e9rimentale, la neurobiologie et l’\u00e9tude de l’addiction sont en passe de faire du contr\u00f4le de soi<\/strong> la nouvelle panac\u00e9e. Le contr\u00f4le de soi, c’est la capacit\u00e9 \u00e0 r\u00e9guler ses impulsions et ses d\u00e9sirs. Celui qui en est richement \u00e9quip\u00e9 \u00e0 tous les avantages dans la vie. Il est meilleur \u00e0 l’\u00e9cole, a un meilleur job, gagne plus, est mieux appr\u00e9ci\u00e9 de ses proches et est un meilleur amant. On le met moins en prison, il sombre plus rarement dans des addictions et aura moins de grossesses non d\u00e9sir\u00e9es. Le contr\u00f4le de soi semble \u00eatre pour l’individu ce que le facteur Gini est pour la soci\u00e9t\u00e9. Son h\u00e9ritabilit\u00e9 est notoire, mais surtout, il s’\u00e9duque et les m\u00e9thodes pour le faire fonctionnent assez bien. C’est l’anecdote (i). Les ressources en contr\u00f4le de soi dont chacun dispose \u00e0 un moment sont limit\u00e9es. Comme le repr\u00e9sente l’analogie hydraulique, sa consommation \u00e0 un moment donn\u00e9, rend le moment suivant vide. C’est l’anecdote (ii). En g\u00e9n\u00e9ral, parce que nous avons le temps de r\u00e9cup\u00e9rer d’une tentation \u00e0 l’autre, notre contr\u00f4le de soi fonctionne \u00e0 peu pr\u00e8s. Le drame de l’addiction n’est pas que ceux qui en souffrent sont particuli\u00e8rement peu capables de contr\u00f4le de soi, mais que leur mal ne leur laisse aucun r\u00e9pit. Une fois en manque, le besoin de cigarette ne l\u00e2che plus. Le malade c\u00e8dera \u00e0 la premi\u00e8re basse de son tonus de contr\u00f4le de soi. La revalorisation de la volont\u00e9 et de sa culture ne me d\u00e9plait pas.<\/em> Est-ce un courant de fond evidence based, ou n’est-ce que le biais politiquement motiv\u00e9 de ce chercheur de Floride.<\/em> Nous serons vigilants.\u00a0Le 15.4.15, j’ai appris que le groupe de Ernst Fehr (neuro\u00e9conomie, Z\u00fcrich) poursuit en milieu scolaire une recherche destin\u00e9e \u00e0 tester ces id\u00e9es dans le cadre d’une \u00e9tude comparative pr\u00e9vue sur de nombreuses ann\u00e9es<\/em><\/p>\n

02.04.15. Nature 520<\/strong><\/p>\n

– 18, online 14299. CRISPR, \u00c9TIQUE, G\u00c9NIE G\u00c9N\u00c9TIQUE. Urs, Laur\u00e9e, Manu. H.Ledford rapporte: Mini enzyme to complement CRISPR<\/span>. Depuis quelque temps, il n’y a pas de mois que je ne vous parle des perowskites qui sont en passe de changer la donne de l’\u00e9nergie solaire. Lent, lent, tout cela compar\u00e9 \u00e0 CRISPR qui est en passe de r\u00e9volutionner le g\u00e9nie g\u00e9n\u00e9tique. C’est presque toutes les semaines qu\u2019il en est question sur mon blog. Il s’agit donc d’une technologie d\u00e9riv\u00e9e d’un syst\u00e8me de d\u00e9fense des bact\u00e9ries contre les virus. La rumeur veut que l\u2019article d\u00e9crivant la premi\u00e8re correction d’un d\u00e9faut g\u00e9n\u00e9tique chez un embryon humain va sortir incessamment. Pas en Suisse ni dans un des 60 autres \u00e9tats civilis\u00e9s qui interdisent ce genre de manipulation. Ce qui serait autoris\u00e9 chez nous et qui attire fort les biotechnologues et les m\u00e9decins, c’est la correction cibl\u00e9e de cellules somatiques d\u00e9fectueuses. Par exemple, on aimerait corriger le g\u00e8ne de la dystrophine responsable de la myopathie de Duchenne, cette terrible d\u00e9g\u00e9n\u00e9rescence musculaire qui tue 1 enfant sur 3’500 avant qu’il n’atteigne l’\u00e2ge adulte. La m\u00e9thode que l’on vise le plus souvent consisterait \u00e0 infecter les cellules \u00e0 corriger avec un virus dans lequel est int\u00e9gr\u00e9 l’ADN corrig\u00e9 ainsi que le moyen de le mettre en place. Dans la situation actuelle, cette correction est all\u00e9atoire et inefficace. Cas9 et le syst\u00e8me CRISPR devraient permettre une int\u00e9gration parfaite \u00e0 l’endroit rigoureusement choisi. Le probl\u00e8me est que AAV, le virus utilis\u00e9 pour cette technique, est trop petit pour transporter la grande prot\u00e9ine Cas9 et l’ARN sp\u00e9cifiant l’emplacement. L’article dont il est question ici rapporte que, en analysant les variants du syst\u00e8me CRISPR\/Cas9 de nombreuses bact\u00e9ries, les auteurs en ont trouv\u00e9 un dont le message sur l’ADN est de 1000 lettres plus court et qui, de ce fait, trouve sa place dans le vecteur AAV. Un d\u00e9tail technique, peut-on penser. Sans doute, mais \u00e0 mon sens, c’est la premi\u00e8re fois que l’on tient une piste vraiment s\u00e9rieuse (meilleure que le th\u00e9 vert en tout cas) pour esp\u00e9rer corriger bient\u00f4t la myopathie de Duchenne – et bien d’autres maladies g\u00e9n\u00e9tiques <\/em><\/p>\n

– 27. CLIMAT, POLITIQUE. D. G. Victor <\/span>(seul sp\u00e9cialiste de la politique des sciences \u00e0 l’IPCC). Mettre les sciences sociales dans la politique du climat.<\/span><\/p>\n

L’image r\u00e9sume. \"Capture<\/a>\u00a0<\/em><\/p>\n

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C’est l’histoire du type qui a perdu sa cl\u00e9. D’autres gens sympas viennent lui aider \u00e0 la chercher sous le lampadaire. Rien! L’un d’eux demande: \u00ab\u00a0Es-tu s\u00fbr de l’avoir perdue ici?\u00a0\u00bb \u00ab\u00a0Non, c’est plus loin, mais l\u00e0-bas il n’y a pas de lumi\u00e8re et les gens r\u00e2lent.\u00a0\u00bb<\/em><\/p>\n

R\u00e9cemment, un proche coll\u00e8gue – et en principe, un ami – m’a offert l’occasion d’une exp\u00e9rience frappante \u00e0 ce m\u00eame propos. Il disait: \u00ab\u00a0L’\u00e9chauffement climatique […] est une esbroufe plan\u00e9taire, relay\u00e9e par les m\u00e9dias.\u00a0\u00bb La suite fut peu am\u00e8ne.<\/em><\/p>\n

C’est aussi la le\u00e7on principale que je tire de mes 6 premi\u00e8res ann\u00e9es de retraite: les gens communiquent beaucoup plus mal que l’on ne l’imagine. Chacun, engonc\u00e9 dans son image du monde, incapable de se projeter dans celle de son partenaire, n’\u00e9coute pas et n\u2019y comprend rien<\/em>.<\/p>\n

Le pr\u00e9sent article constate que l’IPCC (le panel international d’\u00e9tude sur le climat) \u00e9met un aimable ronronnement totalement \u00e0 c\u00f4t\u00e9 de la plaque. L’\u00e9chauffement climatique est une r\u00e9alit\u00e9 maintenant bien connue; ce qui ne l’est pas, c’est comment notre soci\u00e9t\u00e9 doit y faire face. La question n’est plus tant du domaine des sciences de la Terre. Elle est de celui des sciences humaines. Il y a urgence. Pour enfin faire sens, cet automne \u00e0 Paris, l’IPCC devra s’ouvrir aux sciences sociales et oser aborder les probl\u00e8mes politiques qu’il a toujours frileusement mis de c\u00f4t\u00e9. Ce sont par exemple: (i) qui va payer le cout du changement climatique? (ii) comment distribuer les contributions? (iii) Quels accords internationaux faut-il conclure? (iv) comment r\u00e9pondent les gouvernements et les peuples aux informations sur le climat? (v) vers quels conflits va-t-on, comment les g\u00e9rer et comment \u00e9viter les guerres?<\/p>\n

Eh oui, gens des sciences humaines, cessez de vous plaindre de ne pas \u00eatre pris au s\u00e9rieux ou de devoir \u00e9crire vos \u00abGrants\u00bb en anglais. Venez s\u00e9rieusement travailler aux probl\u00e8mes vitaux de notre monde que seule pourra r\u00e9soudre la science la plus large et la plus ouverte. Vos comp\u00e9tences y sont absolument n\u00e9cessaires. <\/em><\/p>\n

Autre chapitre et m\u00eame conclusion: Que faire de CRISPR\/Cas9 et de ses acolytes pr\u00e9sents et avenir?<\/em><\/p>\n

03.4.15 Science348, 6230.<\/strong><\/p>\n

– 14 – 15. \u00c9THIQUE, G\u00c9NIE G\u00c9N\u00c9TIQUE, SCIENCE ET SOCI\u00c9T\u00c9. J. Couzin-Frankel. Les mitochondries font d\u00e9bat<\/u>. Les Anglais autorisent depuis peu la f\u00e9condation in\u00a0vitro (FIV) avec transfert de mitochondrie d’une donneuse (\u00ab\u00a0enfant \u00e0 3 parents\u00a0\u00bb). Les cons\u00e9quences compliqu\u00e9es apparaissent d\u00e9j\u00e0. En voici un exemple. L’ADN est concentr\u00e9 dans le noyau des cellules; en particulier dans l’ovule et le spermatozo\u00efde. Toutes nos cellules contiennent aussi, mais hors du noyau, des mitochondries qui fournissent l’\u00e9nergie n\u00e9cessaire \u00e0 tous les processus cellulaires. Bizarrement, les mitochondries ont aussi un peu d’ADN codant pour quelques-unes de leurs prot\u00e9ines. Les mitochondries de l’ovule passent \u00e0 l’embryon. Celles du sperme sont rejet\u00e9es\u00a0 lors de la f\u00e9condation. Comme l’ADN nucl\u00e9aire, l’ADN mitochondrial peut aussi porter des mutations n\u00e9fastes. Les maladies qui en r\u00e9sultent sont caract\u00e9ristiques et ne sont transmises que par la m\u00e8re. C’est pour permettre \u00e0 ces femmes d’avoir un enfant sain que les Anglais ont autoris\u00e9 une nouvelle proc\u00e9dure de FIV. La m\u00e9thode consiste \u00e0 pr\u00e9lever un ovule chez une donneuse saine. On remplace le noyau de cet ovule par un noyau pr\u00e9lev\u00e9 sur un ovule de la m\u00e8re. On a ainsi un ovule qui contient l’ADN nucl\u00e9aire de la future m\u00e8re et les mitochondries de la donneuse. Apr\u00e8s quoi, on proc\u00e8de \u00e0 une FIV normale, par f\u00e9condation, implantation chez la m\u00e8re. \u00c0 priori, voil\u00e0 qui est tr\u00e8s bien. Pourtant certains sont inquiets. Ils craignent la pente glissante qui peut mener \u00e0 n’importe quoi, m\u00eame \u00e0 ce que nous n’avons pas imagin\u00e9. \u2028Par exemple. Il y a une l\u00e9gende urbaine pseudoscientifique qui pr\u00e9tend que la vitalit\u00e9 d’un individu d\u00e9pend de la vigueur de l’embryon pr\u00e9coce. De l\u00e0 \u00e0 penser qu’un boost mitochondrial de l’ovule avant f\u00e9condation donnerait du turbo au d\u00e9veloppement pr\u00e9coce. Michelle Dipp et sa firme OvaScience veulent vendre ce service et pr\u00e9tendent que le rechargement mitochondrial augmente consid\u00e9rablement le taux de succ\u00e8s de la FIV. La firme ne devrait pas avoir de grands probl\u00e8mes en Angleterre qui a ouvert la voie. Aux USA il y a bagarre, car la FDA (Food and Drug Administration) est cens\u00e9e approuver toutes nouvelles pratiques m\u00e9dicales. Mme Dipp insiste en constatant que la pratique fonctionne, qu’elle est demand\u00e9e et que si le service ne peut pas \u00eatre fourni aux USA il sera fourni ailleurs dans de moins bonnes conditions. Allons-y gaiment! …mais pas en Suisse, la loi actuelle ni celle sur laquelle nous aurons \u00e0 voter le 14 juin ne permettent ce genre d’exercice. \u00a0<\/em><\/p>\n

– 20. EBOLA. On se bat pour les patients!<\/u> L’\u00e9pid\u00e9mie diminue et les patients manquent pour tester m\u00e9dicaments et vaccins qui arrivent enfin sur le terrain. Il faudrait abandonner certains programmes peu prometteurs pour concentrer sur ceux qui le sont le plus. La d\u00e9cision est scientifiquement difficile. Qui peut la prendre? Les seules personnes qui seraient vraiment comp\u00e9tentes sont les m\u00e9decins qui conduisent les tests, mais ceux-ci sont presque tous li\u00e9s aux firmes qui veulent valider leur produit pour le vendre. Impossible d’arriver \u00e0 une d\u00e9cision raisonnable. La triste saga de la gestion de l’\u00e9pid\u00e9mie continue.<\/p>\n

– 36 – 38. \u00c9THIQUE, G\u00c9NIE G\u00c9N\u00c9TIQUE. Baltimore, Berg et 16 autres (dont un Suisse de Z\u00fcrich, seul non US). Appel \u00e0 ne pas pratiquer de modifications g\u00e9n\u00e9tiques sur les cellules germinales humaines avant qu’une discussion g\u00e9n\u00e9rale n’ait eu lieu sur l’opportunit\u00e9 d’une telle action.<\/u> \u00a0<\/u>L’appel \u00e9tait annonc\u00e9 (ici aussi). Il est lanc\u00e9 par ceux qui sont \u00e0 l’origine de la r\u00e9volution m\u00e9thodologique actuelle et ceux qui avaient initialis\u00e9 le moratoire d’Asilomar en 1975 (?) Il est motiv\u00e9 par (i) le d\u00e9veloppement r\u00e9cent du syst\u00e8me CRISPR\/Cas9 qui va sans doute faire passer le g\u00e9nie g\u00e9n\u00e9tique de l’\u00e9tait de laborieux bricolage \u00e0 celui de m\u00e9thode mure et efficace aux possibilit\u00e9s illimit\u00e9es et (ii) l’urgence induite par la rumeur que l’annonce de la premi\u00e8re modification g\u00e9n\u00e9tique d’un embryon est sous presse. (Voir 23.4.15)<\/p>\n

– \u00a090. \u00c9PIG\u00c9N\u00c9TIQUE. Laur\u00e9e. Ragunathan et al. H\u00e9r\u00e9dit\u00e9 \u00e9pig\u00e9n\u00e9tique ou effet de s\u00e9quence.<\/u> Question: les modifications \u00e9pig\u00e9n\u00e9tiques (m\u00e9thylation, phosphorylation) passent-elles \u00e0 la g\u00e9n\u00e9ration suivante (i) comme telle ou (ii) par le fait que la s\u00e9quence sp\u00e9cifique de l’ADN recrute les enzymes induisant la modification \u00e0 la nouvelle g\u00e9n\u00e9ration? La question n’a pas re\u00e7u de r\u00e9ponse claire jusqu’ici, mais cet article montre que, dans le cas de modification li\u00e9e aux histones (1er niveau d’empaquetage de l’ADN), l’h\u00e9r\u00e9dit\u00e9 \u00e9pig\u00e9n\u00e9tique est une vraie h\u00e9r\u00e9dit\u00e9 (cas (i)), mais qu’elle ne se maintien gu\u00e8re sur plusieurs g\u00e9n\u00e9rations. Il s’agit bien ici d’h\u00e9r\u00e9dit\u00e9 somatique (lors de la division cellulaire) et non pas d’h\u00e9r\u00e9dit\u00e9 germinale (de parents \u00e0 enfants). Pour cette derni\u00e8re, il faudra revenir.<\/em><\/p>\n

\u00a0<\/strong><\/p>\n

09.04.15. Nature 520, 7546<\/strong><\/p>\n

– 137 . G\u00c9N\u00c9TIQUE, SCIENCE ET SOCI\u00c9T\u00c9. <\/strong>23andMe en Angleterre. <\/u>23andMe est la firme US qui offre, pour un prix d\u00e9risoire, le s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome de chacun en s’appropriant les droits sur cette information. On en a parl\u00e9 (voir commentaire du 1.1.2015), c’est \u00e9pouvantable. L’administration US est intervenue pour interdit \u00e0 23&Me son commerce dans la forme actuelle. Le 30 mars, la firme a annonc\u00e9 que son kit de test \u00e9tait dor\u00e9navant disponible dans 600 pharmacies anglaises. Contr\u00f4ler l’usage de la g\u00e9n\u00e9tique sera difficile.<\/em><\/p>\n

– 148 – 150. TECHNIQUE, \u00c9NERGIE. <\/strong>M. Peplow. Histoire de trous.<\/u> Stocker un gaz comme le m\u00e9thane ou l’hydrog\u00e8ne est couteux et lourd. Une m\u00e9thode prometteuse consiste \u00e0 l’absorber dans les trous d’un mat\u00e9riau poreux. Pour ce faire, la z\u00e9olite, un aluminosilicate, est consid\u00e9r\u00e9e comme le mat\u00e9riel de choix. Une autre voie semble approcher maturit\u00e9 : fabriquer des cristaux poreux rigoureusement contr\u00f4l\u00e9s en liant des noyaux min\u00e9raux avec des mol\u00e9cules organiques (MOF: metalo-organic framework). Actuellement, certains de ces cristaux battent tous les records de rapport surface\/volume (on approche l’hectare\/gramme). Le proc\u00e9d\u00e9 est adaptable \u00e0 l’infini selon la dimension et la nature des pores. BASF en a cr\u00e9\u00e9 20’000 potentiellement utilisables pour des fonctions telles que: stockage de gaz, extraction de CO2, s\u00e9parations de m\u00e9langes, catalyse et \u00e9tudes structurales. Pour H2, le but de 40g\/l vis\u00e9 par le d\u00e9partement US de l’\u00e9nergie pour 2020 n’est pas atteint, mais les chances sont bonnes. Les 2 prochaines ann\u00e9es seront d\u00e9cisives.<\/p>\n

 <\/p>\n

10.4.15. Science 348, 6231.<\/strong><\/p>\n

– 178 – 80. M\u00c9DECINE, \u00c9THIQUE. I.G. Cohen et al., la th\u00e9rapie de remplacement mitochondrial. Voir ci-dessus: Science 348, 14 (2015). Face aux questions m\u00e9dicales et \u00e9thiques soulev\u00e9es par cette nouvelle technique, la GB et les USA proc\u00e8dent de mani\u00e8re tr\u00e8s diff\u00e9rente. Il y a le\u00e7on \u00e0 en tirer pour tous. Les auteurs mettent en \u00e9vidence 4 diff\u00e9rences. (i) Les Anglais ont un organisme sp\u00e9cifique et ind\u00e9pendant (HFEA) destin\u00e9 \u00e0 rapporter au parlement sur tout ce qui touche \u00e0 la loi de 1990 sur la fertilisation humaine et l’embryologie. L’interaction avec le Parlement est \u00e9troite et la HFEA organise de larges consultations avec le public. Aux USA, c’est le Centre d’\u00e9valuation et de recherche biologique de la FDA (Food and Drug Administration) qui est r\u00e9pondant. Ce m\u00e9lange entre recherche et politique est lourd. (ii) Aux USA, le d\u00e9bat est davantage politis\u00e9 par des mouvements fondamentalistes de type \u00ab\u00a0prolife\u00a0\u00bb. (iii) Un large d\u00e9bat en diverses modalit\u00e9s a \u00e9t\u00e9 organis\u00e9 avec le public anglais. Aux USA, les organes officiels restent tr\u00e8s ferm\u00e9s au public. (iv) Les auteurs parlent de \u00ab\u00a0fiert\u00e9 nationale\u00a0\u00bb GB dans ce domaine de la science. L’article conclut qu’ \u00ab\u00a0il reste \u00e0 voir si la r\u00e9forme du syst\u00e8me US peut se faire sans le faire couler sous l’effet de son poids et des vents politiques\u00a0\u00bb.<\/p>\n

\u00a0<\/strong><\/p>\n

16.4.15. Nature 520.<\/strong><\/p>\n

– 273. BIOTECHNOLOGIE. Rapport de conf\u00e9rence. L’impression 3-D devient vivante<\/u>. Il est pr\u00e9sent\u00e9 une oreille de remplacement construite par impression 3-D avec des cellules vivantes dans un \u00e9chafaudage d’hydrogel se reconstituant en cartilage. Un fil de nanoparticules d’argent servant d’antenne y est int\u00e9gr\u00e9. La conf\u00e9rence conclut toutefois que le chemin pour reconstruire des organes de remplacement vivants sera encore long!<\/p>\n

– 275 – 6. GENRE, SCIENCE ET SOCI\u00c9T\u00c9. Rapport sur un article: William & Ceci, PNAS USA, http:\/\/dx.doi.org\/10.1073\/pnas.1418878112(2015). \u00c9tude de psychologie exp\u00e9rimentale sur l’effet du genre dans la s\u00e9lection acad\u00e9mique au niveau de la pr\u00e9titularisation aux USA. Diff\u00e9rentes approches sont utilis\u00e9es, par exemple, la pr\u00e9sentation de cas hypoth\u00e9tiques \u00e0 des personnes en position de prendre de telles d\u00e9cisions. Le r\u00e9sultat montre que les femmes sont pr\u00e9f\u00e9r\u00e9es \u00e0 deux contre un. OK, je veux bien qu’il y ait actuellement un certain biais en faveur des femmes,\u00a0mais, en Suisse en tous cas, la r\u00e9alit\u00e9 des nominations est bien diff\u00e9rente. De nouveau la question: qu’a-t-on mesur\u00e9?\u00a0 <\/em><\/p>\n

\u00a0<\/em><\/p>\n

17.4.15. Science 348, 6232. <\/strong>Un riche num\u00e9ro.<\/em><\/p>\n

-303 – 307 + Insights 288-9. BIOLOGIE STRUCTURALE, CRYO-ME. Greber et al. (Z\u00fcrich) Structure du mitoribosome. <\/u>La r\u00e9volution de la cryo-microscopie est en marche. Elle a commenc\u00e9 il y a quelque 18 mois par la publication de quelques mod\u00e8les de structures atteignant la r\u00e9solution atomique. La plus remarquable de ces structures nouvellement r\u00e9solues et le mitoribosome. Un groupe de Z\u00fcrich et un groupe de Cambridge sont en belle concurrence, publiant chaque quelques mois le raffinement suivant de leurs mod\u00e8les. Nous en avons d\u00e9j\u00e0 parl\u00e9 ici (Science, 7.11.14; https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/?p=417#more-417). Rappelons: le ribosome est une \u00e9norme structure form\u00e9e d’un demi-millon d’atomes, d’une centaine de prot\u00e9ines et de plusieurs filaments d’ARN. Chaque cellule en contient un grand nombre. Leur fonction: la synth\u00e8se des prot\u00e9ines \u00e0 partir du message de l’ADN via RNA interpos\u00e9. Les bact\u00e9ries ont leurs ribosomes. Les cellules sup\u00e9rieures (eucaryotes) ont aussi les leurs, nettement diff\u00e9rents. Il y a 1,5 milliard d’ann\u00e9es, une cellule eucaryote (de l’\u00e9poque) a aval\u00e9 une bact\u00e9rie (de l’\u00e9poque) et, surprise, surprise, au lieu de l’habituelle digestion de la premi\u00e8re par la seconde, les deux cellules se sont entendues en une collaboration qui dure encore et qui s’est \u00e9tendue \u00e0 l’ensemble du monde des eucaryotes. Dans cette collaboration, la bact\u00e9rie s’est sp\u00e9cialis\u00e9e dans la production de carburant (la mol\u00e9cule d’ATP). Elle est devenue l’organelle que l’on appelle mitochondrie. Durant cette \u00e9volution, le ribosome bact\u00e9rien initial a consid\u00e9rablement \u00e9volu\u00e9. On lui donne le nom de mitoribosome. Les ribosomes bact\u00e9riens comme ceux des eucaryotes ont \u00e9t\u00e9 intens\u00e9ment \u00e9tudi\u00e9s depuis 50 ans. Le mitoribosome, par conte a \u00e9t\u00e9 \u00e9tonnement n\u00e9glig\u00e9. Jusqu’il y a 2 ans, on n’en savait pas grand-chose. Tout \u00e0 coup, il s’offre \u00e0 nous par sa carte atomique compl\u00e8te … et l’on sent venir quelque chose de fondamental.<\/p>\n

En 1952 (?) Watson et Crick ont d\u00e9couvert la structure de l’ADN. Leur article se termine par une phrase fameuse (cit\u00e9e de m\u00e9moire): \u00ab\u00a0Il n’a pas \u00e9chapp\u00e9 aux auteurs que la structure propos\u00e9e a des cons\u00e9quences fonctionnelles int\u00e9ressantes\u00a0\u00bb. Oui, int\u00e9ressante, on peut le dire; elle r\u00e9v\u00e8le le m\u00e9canisme le plus fondamental de la vie, la r\u00e9plication, le passage de l’information g\u00e9n\u00e9tique d’une g\u00e9n\u00e9ration \u00e0 la suivante. Sur cette base fracassante, le programme de la recherche biologique \u00e9tait tout trac\u00e9: r\u00e9soudre les structures pour en comprendre la fonction. Depuis, on devint tr\u00e8s bon \u00e0 r\u00e9soudre la structure des prot\u00e9ines et de diff\u00e9rents complexes \u00b1 significatifs. La base de donn\u00e9es centralis\u00e9e PDB contient plus de 100’000 mod\u00e8les \u00e0 r\u00e9solution atomique. Pourtant le r\u00e9sultat global est d\u00e9cevant. Ces structures sont peu bavardes et m\u00eame en les torturant de toute mani\u00e8re, elles n’avouent que p\u00e9niblement leurs fonctions. La raison, en est peut-\u00eatre que, contrairement \u00e0 l’ADN dont la fonction de r\u00e9plication est condens\u00e9e dans le principe simple de l’appariement des deux brins, la grande majorit\u00e9 des fonctions biologiques font appel \u00e0 des interactions complexes dans des structures multiples. Pour y comprendre quelque chose, il faut voir grand.<\/p>\n

Arrive le mitoribosome, organelle complexe fonctionnant par l’interaction de plus de 100 sous-unit\u00e9s structurales, que la cryo-ME r\u00e9v\u00e8le d’un coup, tout entier. Les chercheurs observent et s’\u00e9tonnent. Ils remarquent, par exemple, une petite mol\u00e9cule inattendue, enfouie dans la structure, ou alors une protub\u00e9rance bizarre que l’on ne retrouve pas dans les ribosomes cellulaires et d\u00e9j\u00e0, alors que l’\u00e9tude ne fait que commencer, ils remarquent que la mol\u00e9cule surprise comme aussi la protub\u00e9rance font sens. Les voir dans leur contexte r\u00e9v\u00e8le leur fonction.<\/p>\n

Est-ce, 50 ans plus tard, le retour \u00e0 la case de d\u00e9part de la biologie structurale… par la cryo-ME? Comme on peut l’imaginer, l’id\u00e9e me plait.<\/p>\n

– 327 – 330. CLIMAT, GLACIER, ANTARCTIQUE. F. S. Paolo et al. La perte de volume de la banquise antarctique s’acc\u00e9l\u00e8re.<\/u> \u00a0D’abord, ne confondons pas la banquise<\/em>, qui est la couche de glace form\u00e9e sur la mer refroidie, et le flot glaciaire<\/em> qui se d\u00e9verse dans la mer. L’article rapporte 20 ans de mesures de quantit\u00e9 de glace dans la banquise durant les 20 derni\u00e8res ann\u00e9es. R\u00e9sultat: de 1994 – 2003, le volume total \u00e9tait stable avec une l\u00e9g\u00e8re d\u00e9croissance en Antarctique de l’Ouest et l\u00e9g\u00e8re croissance \u00e0 l’est. De 2004 \u00e0 2012, l’ouest est en forte diminution alors que l’est a cess\u00e9 de croitre. En 20 ans, les grandes banquises de l’ouest ont perdu jusqu’\u00e0 18% de leur \u00e9paisseur.<\/p>\n

Pour ce qui est de la masse totale de glace, la banquise est relativement peu importante. Par contre, elle joue un r\u00f4le stabilisateur de l’\u00e9coulement des grands glaciers. Gardons l’oeil sur la banquise, sa disparition pourrait \u00eatre un d\u00e9clencheur de l’\u00e9coulement glaciaire. On l’a vu, \u00e7a peut \u00eatre s\u00e9rieux au nord (voir: ), au sud, a\u00efe a\u00efe!<\/p>\n

– \u00c0 ce propos, un article du Scientific American du 1er mai est relevant. Il concerne la stabilit\u00e9 de la banquise arctique (elle est beaucoup plus mince que les grandes banquises antarctiques). En substance, il not\u00e9 que, l\u00e0 o\u00f9 est la banquise, il n’y a pas de vagues. La banquise se disloque lorsqu’elle est soumise \u00e0 des vagues venant de l’ext\u00e9rieur, et ce, d’autant plus que les vagues sont grandes – \u00e9videmment – et longues. Pour que les vagues soient grandes et longues, il faut du vent et de la distance. Avant l’\u00e9chauffement climatique, la banquise arctique s’\u00e9tendait la majeure partie de l’ann\u00e9e jusqu’\u00e0 la terre (Sib\u00e9rie, Alaska, Canada, Groenland) ou pas tr\u00e8s loin. Ainsi: pas de mer libre, pas de vagues, banquise stable. L’\u00e9chauffement climatique change la donne: recul de la banquise, mer libre, vent et vague contre la banquise, plus de mer d\u00e9couverte, plus grandes vagues… etc. Ainsi s’explique peut-\u00eatre que le recule des glaces arctiques d\u00e9passe toutes les pr\u00e9visions.<\/p>\n

– 333 – 336. Features: 274 – 281. CHIENS, DOMESTICATION, SOCIOBIOLOGIE. Nagasawa et al. Les chiens ont d\u00e9tourn\u00e9 le m\u00e9canisme d’attachement des humains.<\/u> Le chien est de beaucoup le plus ancien animal domestique: 15 – 30’000 ans selon les arch\u00e9ologues. Arrive la g\u00e9n\u00e9tique. Elle confirme la plus ancienne de ces valeurs ou plus encore. Elle montre aussi que tous les chiens descendent du loup, mais on ne sait pas si cette \u00e9volution a une ou plusieurs origines. En tous cas, le g\u00e9nome du chien est identique \u00e0 celui du loup \u00e0 99,9%. Pour comparaison, notons que la diff\u00e9rence homme-chimpanz\u00e9 est de 1.5% ce qui ne surprend pas puisque la s\u00e9paration loup\/chien est si r\u00e9cente. Autrefois on imaginait qu’un humain avait, un jour, adopt\u00e9 un b\u00e9b\u00e9 loup et l’avait \u00e9duqu\u00e9 en un chien domestique. Ce n’est pas possible. Apprivoiser un b\u00e9b\u00e9 loup peut se faire dans une certaine mesure, mais le r\u00e9sultat adulte est quand m\u00eame un loup \u00b1 d\u00e9natur\u00e9. Le sc\u00e9nario probable est plus lent. Il commence par des loups int\u00e9ress\u00e9s aux restes de nourriture d’une troupe humaine. Ceux des loups qui \u00e9taient les moins effray\u00e9s par l’homme et qui \u00e9taient les moins agressifs envers lui ont profit\u00e9 au mieux de cette relation. La s\u00e9lection naturelle a favoris\u00e9 le renforcement de cette relation. Comment cela s’est-il pass\u00e9. L’article dont il est question ici apporte une r\u00e9ponse surprenante et, \u00e0 mon sens, d’importance majeure.<\/p>\n

La femme humaine comme la louve s’attache \u00e0 ses petits. L’hormone ocytocine en est l’expression physiologique majeure. Chez l’humain l’attachement a pris des formes tr\u00e8s \u00e9volu\u00e9es, en particulier dans l’attachement \u00e0 l’int\u00e9rieur du couple ou celui du p\u00e8re pour ses enfants, toutes choses qui ne sont pas dans la nature du loup. Ces attachements sont li\u00e9s \u00e0 des signaux tels que le toucher, les odeurs, les pleurs du b\u00e9b\u00e9, mais chez l’homme, le plus caract\u00e9ristique passe par le regard. On se regarde, on se sourit, on s’aime… et dans le processus monte le taux d’ocytocine chez les deux partenaires. Le loup ne regarde pas dans les yeux. Tous les chiens le font avec intensit\u00e9. Les exp\u00e9riences rapport\u00e9es ici consistent \u00e0 laisser se regarder le chien et le maitre et \u00e0 constater que le taux d’ocytocine en est augment\u00e9 chez les deux en m\u00eame temps qu’est augment\u00e9e la bienveillance mutuelle. L\u2019application intranasale d\u2019ocytocine au chien renforce son regard vers l’homme ainsi que les marques d’attachement.<\/p>\n

On en conclut que durant le cours de l’\u00e9volution du loup en chien, le m\u00e9canisme d’attachement de la chienne vers ses petits \u00e0 \u00e9t\u00e9 repris et \u00e9tendu \u00e0 l’attachement du chien – femelle ou m\u00e2le – envers l’\u00eatre humain. La rapidit\u00e9 avec laquelle s’est d\u00e9velopp\u00e9e cette propri\u00e9t\u00e9 comportementale complexe ne semble pas compatible avec un ajustement pi\u00e8ce par pi\u00e8ce selon le laborieux processus du bricolage de l’\u00e9volution. Il faut croire qu’elle a \u00e9t\u00e9 mise en place comme un bloc coh\u00e9rent. On a l’impression que la \u00ab\u00a0cassette sociale\u00a0\u00bb de la relation femelle\/petit a \u00e9t\u00e9 recycl\u00e9e presque telle qu’elle dans la relation sociale homme\/chien. Comme il n’y a qu’un pour mille de diff\u00e9rence entre le g\u00e9nome du chien et celui du loup, il ne sera peut-\u00eatre pas trop difficile d’\u00e9lucider ce qu’est cette \u00ab\u00a0cassette sociale\u00a0\u00bb et ses nouvelles r\u00e9gulations chez le chien. La cassette sociale du chien \u00e9tant visiblement assez semblable \u00e0 celle de l’homme (l’exp\u00e9rience rapport\u00e9e ici confirme ce que savent tous les cynophiles), ce que l’on va apprendre de l’une nous informera aussi sur l’autre.<\/p>\n

23.4.15\u00a0\u00c9THIQUE. G\u00c9N\u00c9TIQUE. La rumeur est officielle.<\/strong><\/p>\n

La rumeur circulait depuis quelques mois; la grande presse confirme aujourd’hui la publication d’un article d\u00e9crivant la premi\u00e8re correction d’une maladie g\u00e9n\u00e9tique dans un embryon humain. Elle concerne la correction du g\u00e8ne responsable de la thalass\u00e9mie b\u00eata. (Par hasard, mon \u00e9l\u00e8ve Mina fait son travail d’ann\u00e9e au gymnase sur ce sujet pr\u00e9cis\u00e9ment). En Suisse,\u00a0comme dans 60 autres pays, ce genre d’intervention est interdite. Elle inqui\u00e8te. On y reviendra.<\/p>\n

http:\/\/www.rts.ch\/info\/sciences-tech\/6726688-des-chinois-sont-parvenus-a-modifier-genetiquement-des-embryons-humains.html<\/u><\/p>\n

24.4.15, Science 348,6233<\/strong><\/p>\n

380- 1.POLITIQUE SCIENTIFIQUE. Gilles. News<\/u>. Proposition de budget pour les sciences US par le pr\u00e9sident du comit\u00e9 des affaires scientifiques de la chambre des repr\u00e9sentants. Il y a d\u00e9j\u00e0 quelque temps que Lamar Smith (R – TX) s\u00e9vit, mais il semble que la situation actuelle lui est favorable. Il s’encourage. Son programme s’appelle America COMPETES. Il implique en particulier. D\u00e9signation des domaines importants pour la Nation. Diminution massive >50% du financement des sciences sociales et g\u00e9osciences. Ferme la recherche sur le climat au DOE (dpt. energie). Et le plus beau. Interdit le gouvernement de faire un usage politique des r\u00e9sultats de la recherche du DOE.<\/p>\n

Pour ce qui est des sentiments humanistes, la torture fait mal au ventre. Pour ce qui est de la raison, le mouvement antiscience dont M. Smith ou autres deniers sont les porteurs, me fait presque aussi mal. <\/em><\/p>\n

394-5: perspectives; 428-431; 431 – 434. CHIMIE. ENVIRONNEMENT. Suite r\u00e9flexion avec Jean-Claude. D’o\u00f9 vient la diff\u00e9rence de concentration isotopique dans les gaz organiques tels que CO2 ou CH4. Les r\u00e9actions chimiques produisant le gaz ont une efficacit\u00e9 qui d\u00e9pend de l’isotope. L’effet, qui porte typiquement sur quelques o\/oo, diminue avec la temp\u00e9rature. La temp\u00e9rature des dinosaures a ainsi \u00e9t\u00e9 estim\u00e9e. Dans les deux articles dont il est question ici, l’analyse est plus subtile. Les auteurs d\u00e9terminent la concentration des mol\u00e9cules qui contiennent plusieurs isotopes lourds (e.g: 13<\/sup>CH3<\/sub>D et autres, ou la ribambelle des O2<\/sub> telle que 18<\/sup>O17<\/sup>O). De l\u00e0, ils d\u00e9duisent l’origine des r\u00e9actions qui ont produit le gaz. Par exemple le chemin photosynth\u00e9tique de O2 (Yeung et al.) ou l’hydrog\u00e9nation du C par H2 du m\u00e9thane (Wang et al.)<\/p>\n

– 442 – 444. BIOTECHNOLOGIE. Alain, Gilles, Lary. Gantz & Bier (La Jolla, USA.) The mutagenic chain reaction (MCR)<\/u>. De Science du 8.8. 2014 nous avions rapport\u00e9 le d\u00e9veloppement du Gene Drive System qui permet de faire qu’une mutation introduite (h\u00e9t\u00e9rozygote) force l’homozygotie \u00e0 la g\u00e9n\u00e9ration suivante. Ainsi le lent et incertain processus \u00e9volutif d’envahissement d’un trait dans une population est cout circuit\u00e9 par une domination forc\u00e9e. Le pr\u00e9sent article utilise le syst\u00e8me CRISPR\/Cas9 \u00e0 m\u00eame fin. Je ne peux pas juger ce que vaut le nouveau syst\u00e8me par rapport \u00e0 celui de 2014. Quoi qu’il en soit, ce que l’on peut imaginer des possibilit\u00e9s de l’une et de l’autre de ces techniques est fracassant. Ce que l’on n’imagine pas l’est sans doute encore plus. Comme il se doit, les auteurs rappellent le risque que l’un de ces construits \u00e9chappe. Ils proposent un protocole qui emp\u00eacherait sa viabilit\u00e9 hors labo. Ils parlent aussi de l’urgence d’un vaste d\u00e9bat et citent le moratoire d’Asilomar pour y penser. Lip service, comme on dit en anglais.
\nL’affaire m’inspire le petit conte suivant. <\/em><\/p>\n

On a trouv\u00e9 de l’or, l\u00e0-haut, sur la montagne du village de Heidi. Les premiers sur place ont vite su en tirer profit. Ils ont creus\u00e9 avec vigueur, ont abattu quelques rochers et ont veill\u00e9 \u00e0 bien assurer leurs droits exclusifs sur la mine et ses produits. Ils ont aussi observ\u00e9 les larges fissures que leurs efforts avaient provoqu\u00e9es et ils se sont demand\u00e9: \u00ab\u00a0oh l\u00e0, est-elle stable cette montagne?\u00a0\u00bb Apr\u00e8s quoi, ils sont all\u00e9s voir le Pr\u00e9sident et le Bureau du Conseil Communal in corpore pour les informer de la menace qui plane sur le village et leur sugg\u00e9rer de faire ex\u00e9cuter de toute urgence les travaux qui, peut-\u00eatre, \u00e9viteront l’effondrement catastrophique. Ils ont propos\u00e9 de diriger les travaux. <\/em><\/p>\n

 <\/p>\n

30.4.15, Nature 520.<\/strong><\/p>\n

– 600 – 603. \u00c9THIQUE, RECHERCHE. Alain, Gilles. News, D. Cryanoski. Collateral Damage. L’Institut Riken, et ses diff\u00e9rents centres \u00e9taient LE fleuron de la science – surtout biologique – japonaise et le paradis pour ceux qui y travaillaient. Financement et salaires g\u00e9n\u00e9reux, ind\u00e9pendance dans la recherche, libre d’enseignements – un peu comme l’EMBL, mais sans limites de temps pour les chercheurs engag\u00e9s. Cons\u00e9quemment, les chercheurs de Riken sont au \u00ab\u00a0cutting edge\u00a0\u00bb de la science et les chercheurs \u00ab\u00a0normaux\u00a0\u00bb les regardent sans am\u00e9nit\u00e9. Au d\u00e9but 2014 un groupe du Riken Center for Developmental Biology (CDB), annoncent avoir d\u00e9couvert comment transformer des cellules somatiques normales en cellules souches par un simple traitement physique (\u00e0 la limite, il deviendrait possible de refaire simplement un organisme entier \u00e0 partir d’une cellule quelconque du corps). Tr\u00e8s vite les r\u00e9sultats sont mis en doute puis il apparait qu’ils reposent sur des donn\u00e9es frauduleuses. La r\u00e9action des autorit\u00e9s est massive jusque au plus haut niveau. C’est comme si la nation tout enti\u00e8re se sentait attaqu\u00e9e. Un coauteur de l’article – personnage important et cofondateur de l’Institut – se suicide. Toute l’institution Riken est paralys\u00e9e. Une commission gouvernementale est d\u00e9sign\u00e9e pour analyser le cas et proposer les mesures \u00e0 prendre. Au lieu de se borner \u00e0 identifier les tricheurs, comme habituellement dans un tel cas, elle consid\u00e8re d’abord les conditions qui ont pu conduire au d\u00e9rapage. Leurs propositions sont larges et s\u00e9v\u00e8res. L’une d’elles appelle \u00e0 \u00ab\u00a0d\u00e9molir le CDB parce que, en tant qu’organisation, il induit structurellement la fraude ou est incapable de la d\u00e9tecter\u00a0\u00bb. La Direction et m\u00eame le nom du CDB sont remplac\u00e9s, le budget r\u00e9duit de 40%. Aujourd’hui, le Centre et Riken tout entier se sentent malades et ils le sont. Beaucoup de voix critiquent la s\u00e9v\u00e9rit\u00e9 de la proc\u00e9dure qui revient \u00e0 jeter le b\u00e9b\u00e9 avec le bain, ils sugg\u00e8rent que la jalousie a jou\u00e9 un grand r\u00f4le et que le fait de mettre tous les membres du Centre dans le m\u00eame paquet est malhonn\u00eate et inhabile.<\/p>\n

Je constate que dans les affaires de tricherie scientifique, j’ai le plus souvent l’impression que les petits scientifiques agit\u00e9s sont des boucs \u00e9missaires ad\u00e9quats pour limiter les d\u00e9g\u00e2ts. Dans le cas Riken, les Japonais innovent \u00e0 l’extr\u00eame oppos\u00e9. Dans les deux cas, un meilleur \u00e9quilibre serait bienvenu, mais – comme disent les artilleurs – apr\u00e8s tant de coups trop courts, un coup trop long peut-\u00eatre bienvenu. Si j’avais quelque chose \u00e0 dire \u00e0 la science en g\u00e9n\u00e9ral et \u00e0 l’EPFL en particulier, je sugg\u00e8rerais, \u00e0 titre prophylactique, de prendre note du coup japonais. <\/em><\/p>\n

– 615 – 16. G\u00c9N\u00c9TIQUE. Cl\u00e9ment, Laur\u00e9e, Mario, Urs. Recension de 3 livres. Small talk.<\/u> Lorsque l’on a commenc\u00e9 \u00e0 d\u00e9chiffrer le g\u00e9nome des organismes sup\u00e9rieurs, on s’est \u00e9tonn\u00e9 que seulement une petite partie code pour des prot\u00e9ines (2% chez les humains). Ne sachant rien du reste, beaucoup l’ont h\u00e2tivement appel\u00e9 \u00ab\u00a0junk DNA\u00a0\u00bb (ADN-poubelle). Puis, petit \u00e0 petit, on a d\u00e9couvert que cette \u00ab\u00a0mati\u00e8re noire\u00a0\u00bb est transcrite en ARN de toutes tailles et on a d\u00e9couvert des r\u00f4les pour certains de ces ARN. Bref, le nouveau cr\u00e9do est invers\u00e9: tout est fonctionnel dans le message g\u00e9n\u00e9tique. Ce qui \u00e9tait imagin\u00e9 \u00ab\u00a0junk\u00a0\u00bb est ainsi devenu le meilleur de nous. La merveilleuse nature humaine est \u00e0 trouver dans cette mer de composantes issues de l’ADN qui ne code pas pour des prot\u00e9ines. C’est en gros le message de ces trois livres. Alors donc, quelle valeur et quelle fonction faut-il attribuer \u00e0 ce DNA qui reste passablement myst\u00e9rieux?<\/p>\n

L’autre jour (le 29.4) Chris Pointing du MRC de Cambridge posait cette question dans le cadre du s\u00e9minaire hebdomadaire du DEE. Son approche est fondamentale: fonctionnel est ce que l’\u00e9volution contraint, le reste est bruit de fond, ballast ou parasite. Si un codon (une lettre de l’ADN) est contraint par l’\u00e9volution, c’est \u00e0 dire s’il joue un r\u00f4le dans la fitness (la survie) de l’organisme, il aura tendance \u00e0 \u00eatre pr\u00e9cieusement conserv\u00e9 s’il est utile ou alors, il sera \u00e9limin\u00e9 s’il est perturbateur. Le \u00ab\u00a0junk\u00a0\u00bb inutile changera au hasard, selon le taux d’erreur classique des m\u00e9canismes de reproduction du message g\u00e9n\u00e9tique. Bref, le taux local de mutation est un indicateur de la fonctionnalit\u00e9 du message auquel il contribue. Notons quand m\u00eame que les mutations sont trop rares pour que la mesure soit statistiquement valable sur un seul codon. La r\u00e9solution de la m\u00e9thode est relativement faible, mais ce qu’elle dit se moque de tous les d\u00e9tails fonctionnels, seul \u00ab\u00a0\u00e7a sert\u00a0\u00bb ou \u00ab\u00a0\u00e7a ne sert pas\u00a0\u00bb compte. R\u00e9sultat: 8% du g\u00e9nome est contraint.<\/u> Et le reste? On le sait, il n’est pas rien, il fonctionne, il est biophysiquement et biochimiquement actif, biologiquement probablement aussi, mais il ne sert pas \u00e0 l’individu. 92% du g\u00e9nome humain ne raconte que du small talk, bruyant, inutile pour l\u2019organisme, peut-\u00eatre utile pour quelques \u00e9tranges formes de parasitisme.\u00a0\u00a0 <\/em><\/p>\n

– 640 – 645. CRYO-ME, STRUCTURE MOL\u00c9CULAIRE. Encore une structure de ribosome; une de plus pour celui des eucaryotes. De mieux en mieux, 3.6 – 2.9\u00c5 par un groupe plut\u00f4t modestement connu (B. Klaholz \u00e0 Strasbourg). C’est l’inflation des mod\u00e8les; la Cryo-ME se d\u00e9mocratise.<\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

01.04.05. Scientific American. – 11 – 12. NEUROBIOLOGIE, BIOLOGIE MOL\u00c9CULAIRE. Laur\u00e9e. R. Jacobson. The persistence of memory. On explique g\u00e9n\u00e9ralement la m\u00e9moire \u00e0 court terme (m\u00e9moire de travail, le No. de t\u00e9l\u00e9phone que l’on compose \u00e0 partir de l’annuaire) par l’activit\u00e9 \u00e9lectrique du cerveau. Elle est inscrite dans les trains de d\u00e9charges coordonn\u00e9es qu’envoient les […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"jetpack_post_was_ever_published":false,"footnotes":"","jetpack_publicize_message":"","jetpack_publicize_feature_enabled":true,"jetpack_social_post_already_shared":false,"jetpack_social_options":{"image_generator_settings":{"template":"highway","default_image_id":0,"font":"","enabled":false},"version":2}},"categories":[89],"tags":[180,176,110,189,154,48,175,158,191,113,178,70,179,184,190],"class_list":["post-587","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-science-actualite","tag-biologie-moleculaire","tag-biotechnologie","tag-climat","tag-crispr","tag-cryo-me","tag-energie","tag-epigenetique","tag-ethique","tag-genre","tag-medecine","tag-neurobiologie","tag-politique-2","tag-psychologie","tag-sociobiologie","tag-technologie"],"jetpack_publicize_connections":[],"jetpack_featured_media_url":"","jetpack-related-posts":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/587","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=587"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/587\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=587"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=587"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=587"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}