{"id":634,"date":"2015-05-08T18:59:39","date_gmt":"2015-05-08T16:59:39","guid":{"rendered":"http:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/?p=634"},"modified":"2015-08-01T16:37:17","modified_gmt":"2015-08-01T14:37:17","slug":"science-actualite-mai-2015","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/?p=634","title":{"rendered":"Science – actualit\u00e9, mai 2015"},"content":{"rendered":"

01.05.05. Scientific American.<\/strong><\/p>\n

– 10. M\u00c9DECINE. ROUGEOLE. La rougeole ne fait plus peur chez nous. Le vaccin est efficace et notre population est bien couverte. Et pourtant!<\/p>\n

D’abord la maladie est extr\u00eamement contagieuse (on dit qu\u2019un malade infecte 15 personnes en moyenne; environ 1.5 – 2 pour Ebola). Ainsi, pour pr\u00e9venir une \u00e9pid\u00e9mie explosive il faut que le taux de vaccination soit tr\u00e8s \u00e9lev\u00e9 (plus de 95%). Ensuite, on l’ignore g\u00e9n\u00e9ralement que, dans le monde, la rougeole est un grave probl\u00e8me de sant\u00e9 publique. Elle tue d’avantages que le SIDA ou les accidents de voiture. Eh oui!<\/p>\n

Atteindre un taux de vaccination suffisant dans le tiers-monde est difficile, mais bien des pays y sont arriv\u00e9s. Or voil\u00e0 que ces derni\u00e8res ann\u00e9es, des d\u00e9but d’\u00e9pid\u00e9mies se d\u00e9veloppent dans nos pays (premier mort depuis longtemps, l’an pass\u00e9 en Allemagne). C’est que le taux de couverture est en train de diminuer et cela peut \u00eatre vite grave puisqu’il faut rester au-dessus de 90 ou 95%. pour \u00e9viter une \u00e9pid\u00e9mie. Tout cela parce que certaines personnes et certains groupes s’opposent aux vaccins et gobent avec un apparent d\u00e9lice les rumeurs du soi-disant effet n\u00e9faste de ces vaccins. \u00c0 ce propos, il est impressionnant de constater le succ\u00e8s de l’article plus que douteux du Lancet en 1998 (il a \u00e9t\u00e9 r\u00e9tract\u00e9 ensuite apr\u00e8s avoir \u00e9t\u00e9 d\u00e9clar\u00e9 falsifi\u00e9) associant vaccin et autisme. La responsabilit\u00e9 individuelle des nantis comme aussi la responsabilit\u00e9 des pays pouvant se permettre un syst\u00e8me de sant\u00e9 efficace n’est pas un vain mot.<\/p>\n

1.05.15. Science 348, 6234<\/strong><\/p>\n

– 486 – 7. BIO\u00c9THIQUE. Apr\u00e8s la 1ere tentative de modification d’un embryon humain.<\/u> Alain, Jean, Lazare,<\/span> Officiellement, personne ne pr\u00e9tend vouloir modifier actuellement des embryons humains dans un but th\u00e9rapeutique ou autre. Il est \u00e0 noter que – sage mesure de protection contre la critique des \u00e9thiciens – la r\u00e9cente publication chinoise a \u00e9t\u00e9 faite sur des embryons f\u00e9cond\u00e9s par plusieurs spermatozo\u00efdes et qui, de ce fait, ne pouvaient pas se d\u00e9velopper. Il est pourtant bien \u00e9vident que plusieurs groupes y travaillent (il semble que d’autres travaux sont en – ou proche de – publication) et on peut croire que certains pays soutiendront ces recherches – la Chine en particulier. Toutefois, la communaut\u00e9 scientifique et divis\u00e9e selon deux points de vue. (i) Il faut arr\u00eater les exp\u00e9riences jusqu’\u00e0 ce que le point de vue \u00e9thique et les r\u00e9flexions politiques soient arriv\u00e9s \u00e0 une conclusion. (ii) Il faut continuer la recherche parce que le savoir est pr\u00e9f\u00e9rable \u00e0 l’ignorance – et ce, d’autant plus que l’exp\u00e9rience chinoise montre qu’on est loin de comprendre les processus impliqu\u00e9s. Selon moi, la recherche va continuer, mal contr\u00f4l\u00e9e, jusqu’aux prochaines vagues. Ce que l’on peut esp\u00e9rer, c’est que ces vagues vont, petit \u00e0 petit et sans cons\u00e9quences trop f\u00e2cheuses, travailler les responsables politiques et la soci\u00e9t\u00e9 civile qui viendront finalement \u00e0 r\u00e9agir sainement. Comme on le sait, l’optimisme est une exigence philosophique.<\/em><\/p>\n

– 567 – 573. CLIMAT, \u00c9COLOGIE. Deux articles pour \u00e9tudier les risques d’extinctions des esp\u00e8ces. Le premier (Finnegan et al.) d\u00e9termine une ligne de base \u00e0 partir des donn\u00e9es fossiles de ces 23 derniers millions d’ann\u00e9es. Le deuxi\u00e8me (M.C.Urban) synth\u00e9tise toutes les donn\u00e9es disponibles sur les risques et les extinctions actuelles. J’en tire un r\u00e9sultat qui me semble utile pour penser au probl\u00e8me. Le risque de disparition d’une esp\u00e8ce est estim\u00e9 \u00e0 2.8% actuellement, il passerait \u00e0 5.2% avec 2\u00b0 d’\u00e9chauffement et \u00e0 16% avec 4.3 \u00b0. C’est l’Am\u00e9rique du sud o\u00f9 le risque est le plus grand, puis l’Australie et le Sud-est asiatique.<\/p>\n

– 581 – 585. STRUCTURE MOL\u00c9CULAIRE, CRYO-ME. Taylor et al. (Californie) Structure de CRISPR et interaction avec son ARN. Moins de 3 ans apr\u00e8s sa d\u00e9couverte, la cryo-me r\u00e9v\u00e8le la structure mol\u00e9culaire d’une des formes du complexe et la fa\u00e7on par laquelle il utilise l’ARN guide de la bact\u00e9rie pour attaquer l’ARN cible. L’image E donne une id\u00e9e de l’analyse que permet un tel mod\u00e8le. Elle marque en rouge les 2 acides amin\u00e9s de la boucle prot\u00e9ique qui va couper l’ARN cible (filament bleu de droite) tenu en bonne position par l’ARN guide associ\u00e9 au complexe (filament bleu de gauche).<\/p>\n

\"Capture<\/a><\/p>\n

 <\/p>\n

7.05.15. Nature 521, 7550<\/strong><\/p>\n

– 15 – 16. BIOTECHNOLOGY, POLITIQUE. Un peut tous, Alain, Gilles, Laur\u00e9e, Lazare, Lucy, Mario.<\/span> Je me rappelle bien, c’\u00e9tait \u00e0 la fin des ann\u00e9es 70, lors d’un s\u00e9minaire interne au EMBL. Vincenzo Pirrotta nous impressionna en \u00e9crivant sans h\u00e9sitation les 70 lettres d’un tARN qu’il venait de s\u00e9quencer. En 2003 \u00e9tait publi\u00e9e la 1ere s\u00e9quence du g\u00e9nome humain, 3 milliards de lettres, 3 milliards de $. En 2012 la firme Oxford Nanopore annon\u00e7ait pour l’ann\u00e9e suivante l’appareil qui s\u00e9quencerait le g\u00e9nome humain en 15′. C’est rat\u00e9, il est encore annonc\u00e9 pour l’an prochain. Par contre, la firme a distribu\u00e9 l’an pass\u00e9, pour les premiers essais en conditions r\u00e9elles, le s\u00e9quenceur gros comme une canette de bi\u00e8re, simple, promis bon march\u00e9 et bient\u00f4t conduit par iPhone. Apr\u00e8s une ann\u00e9e, les utilisateurs sont impressionn\u00e9s, \u00e7a marche, m\u00eame dans la brousse! Pas encore vraiment pour s\u00e9quencer \u00e0 toute vitesse le g\u00e9nome humain int\u00e9gral, mais l’appareil s’av\u00e8re excellent pour s\u00e9quencer parfaitement des virus ou des bact\u00e9ries ou caract\u00e9riser d\u00e9j\u00e0 fort en d\u00e9tail n’importe quel organisme sup\u00e9rieur, l’individu humain par exemple.<\/p>\n

Les cons\u00e9quences scientifiques, commerciales sociales et politiques du s\u00e9quen\u00e7age de l’ADN sont formidables. Le d\u00e9veloppement rapport\u00e9 ci-dessus annonce que le remplacement des papiers d’identit\u00e9 par l’ADN sera pratiquement faisable dans, disons, 2 ans. Je pense que la politique va suivre, \u00e0 quel rythme? La combinaison UDC\/bateaux de r\u00e9fugi\u00e9s pourrait acc\u00e9l\u00e9rer le processus.<\/em><\/p>\n

– 74 – 80. POLLUTION, \u00c9COLOGIE. Tester l’effet d’insecticides sur les abeilles est difficile. Les tests en laboratoires sont critiqu\u00e9s parce qu’ils font g\u00e9n\u00e9ralement appel \u00e0 des doses irr\u00e9alistes. Ceux en conditions naturelles sont forc\u00e9ment de grosses et couteuses exp\u00e9riences. Les r\u00e9sultats jusqu’ici n’ont pas conduit \u00e0 des conclusions fortes. Les deux pr\u00e9sents articles font appel \u00e0 de plus vastes exp\u00e9riences et semblent \u00eatre plus solides. Ils montrent l’effet n\u00e9faste des insecticides n\u00e9onicotino\u00efdes sur la r\u00e9colte et la survie des abeilles domestiques (Kessler et al. GB) et des abeilles sauvages (Rundl\u00f6f et al, Su\u00e8de). L’effet semble d\u00e9pendre de l’esp\u00e8ce d’abeille consid\u00e9r\u00e9e. Les sauvages \u00e9tudi\u00e9s par le groupe su\u00e9dois sont particuli\u00e8rement sensibles. Le 1er article montre aussi que les abeilles domestiques ne reconnaissent pas les plantes trait\u00e9es de celles qui ne le sont pas. En fait, elles passent plus de temps \u00e0 butiner les zones trait\u00e9es quoiqu’en y r\u00e9coltant moins.<\/p>\n

– on line, 24.4. \u00c9THIQUE, PSYCHOLOGIE, REPRODUCTIBILIT\u00c9. Lucy. www.nature.com\/news\/first-results-from-psychology-s-largest-reproducibility-test-1.17433<\/p>\n

    \n
  1. Baker. Cent publications r\u00e9centes dans le domaine de la psychologie sont reprises pour en tester si les r\u00e9sultats son reproductibles. Selon les crit\u00e8res pr\u00e9\u00e9tablis, la r\u00e9ponse est non dans 61 cas.<\/li>\n<\/ol>\n

     <\/p>\n

    8.5.15. Science 348, 6235<\/strong>.<\/p>\n

    – 618-19, 640 – 41, 648-669. BIOLOGIE. Les biologistes.<\/span> Relation entre les traits d’un individus et ces g\u00e8nes<\/u>. Trois gros articles et d’\u00e9normes masses de donn\u00e9es. 80% des marqueurs g\u00e9n\u00e9tiques de risques de maladies sont situ\u00e9s hors des g\u00e8nes codants des prot\u00e9ines impliqu\u00e9es. Ceci veut dire que ce ne sont pas les machines (les prot\u00e9ines) qui sont en fautes, mais leurs r\u00e9glages. Ceux-ci se situent \u00e9ventuellement compl\u00e8tement ailleurs dans le g\u00e9nome. Le premier de ces articles (GTEx Consortium) g\u00e9notype maladie et expression des g\u00e8nes dans diff\u00e9rents tissus. Lourd, lourd!<\/p>\n

    Il s’agit ici d’aller plus loin dans la relation (variant g\u00e9n\u00e9tique)\/maladie en caract\u00e9risant le trait (dans ce cas, la maladie) par l’ensemble des effets induits par le variant. Fondamentalement, on revient au probl\u00e8me nature\/nurture, g\u00e9nome\/milieu. Jusqu’ici, c’est surtout la relation entre le g\u00e8ne et le trait (an\u00e9mie falciforme, etc.) qui a \u00e9t\u00e9 \u00e9tudi\u00e9e parce que la r\u00e9ponse est accessible. Toutefois cette simplification ne marche que rarement. Dans l’immense majorit\u00e9 des cas, chaque trait est associ\u00e9 \u00e0 de nombreux g\u00e8nes (400 rep\u00e9r\u00e9s pour la taille d’une personne). Pire, comme le mettent en \u00e9vidence les pr\u00e9sents travaux, ce ne sont pas les g\u00e8nes (c’est-\u00e0-dire l’information codant pour la formule chimique d’une prot\u00e9ine), mais ses r\u00e9glages (o\u00f9, quand, combien, avec qui) qui sont les plus importants. La g\u00e9n\u00e9tique des populations nous informe que l’h\u00e9ritabilit\u00e9 des traits (h \u2248 nature) est g\u00e9n\u00e9ralement consid\u00e9rable, mais ses chemins sont plus complexes et tortueux qu’on ne l’imagine. La maitrise de l’ing\u00e9niering g\u00e9n\u00e9tique pour obtenir un trait particulier (par exemple le temp\u00e9rament d’une enfant) n’est pas pour demain. <\/em><\/p>\n

    \u00a0<\/em><\/p>\n

    14.5.15. Nature 521, 7551.<\/strong><\/p>\n

    – 127. BIO\u00c9THIQUE, BIOS\u00c9CURIT\u00c9, BIOTECHNOLOGIE. Alain, Jean, Lazare, Mario.<\/span> \u00c9ditorial. J. Lunshof. Il faut r\u00e9guler l’\u00e9dition des g\u00e8nes des animaux sauvages<\/u>.<\/p>\n

    Bonne id\u00e9e, mais c’est un peu court. Ceux qui suivent mon blog connaissent la situation.<\/em> Avec CRISPR, l’\u00e8re de l’ingeniering g\u00e9n\u00e9tique est vraiment ouverte. Plus fort encore, avec la technique du \u00ab\u00a0gene-drive\u00a0\u00bb, nouvellement d\u00e9nomm\u00e9e \u00ab\u00a0mutagenic chain reaction\u00a0\u00bb (MCR) (cf. ci-dessus, Science du 24.4) l’homme court-circuite les m\u00e9canismes de s\u00e9lection naturelle.<\/p>\n

    Ainsi l’homme est aux commandes et, dans ces conditions, il arrive qu’il fasse des b\u00eatises, parce qu’il a mal analys\u00e9 l’effet de son action, parce qu’il a fait une erreur ou parce qu’il a d\u00e9lib\u00e9r\u00e9ment choisi de faire du mal. <\/em><\/p>\n

    Quand les possibilit\u00e9s de faire des d\u00e9gats d\u00e9passent notre imagination, qu’elles sont faciles \u00e0 mettre en oeuvre, qu’une fois lanc\u00e9es elles se d\u00e9veloppent sans limites et hors contr\u00f4le, on fait quoi? Pour le moment, sur ce blog, nous observons pour essayer de comprendre ce qui se passe et o\u00f9 nous allons. <\/em><\/p>\n

    – 137. SANT\u00c9. POLITIQUE. La d\u00e9b\u00e2cle de l’OMS face \u00e0 l’\u00e9pid\u00e9mie d’Ebola appelle une r\u00e9forme. En gros, la question est: faut-il retirer \u00e0 l’OMS, trop lourde et trop lente, la responsabilit\u00e9 de g\u00e9rer les \u00e9pid\u00e9mies au niveau mondial ou faut-il pr\u00e9f\u00e9rer une solide r\u00e9forme interne? Cette 2e vue domine, mais il faudra former une unit\u00e9 \u00ab\u00a0\u00e9pid\u00e9mie\u00a0\u00bb capable de r\u00e9action rapide, disposant de moyens consid\u00e9rables et d’une grande autonomie. Est-ce possible? Certains en doutent au vu de la rigidit\u00e9 de l’organisation.<\/p>\n

    – 141 – 157. Cahier sp\u00e9cial. SCIENCE EN INDE. Arjun. Quelques articles g\u00e9n\u00e9raux suivis de 10 commentaires de scientifiques divers. Plusieurs sont forts, par exemple, celui sur la gestion des d\u00e9chets par Sunita Narain ainsi qu’un condens\u00e9 d’information g\u00e9n\u00e9rale (142-3) dont je retiens: (i) L’institution dont le taux de citation est le plus \u00e9lev\u00e9 est l’universit\u00e9 du Panjab \u00e0 Chandigarh. (ii) L’investissement R et D est stable \u00e0 0.8% du PIB. En Chine, il cro\u00eet et approche 2%. (iii) Il y a 3x plus de chercheurs en Chine qu’en Inde, mais le budget par chercheur est semblable dans les deux pays. (iv) La proportion de subsides attribu\u00e9s aux femmes a doubl\u00e9 ces 10 derni\u00e8res ann\u00e9es.<\/p>\n

     <\/p>\n

    15.5.15. Science 348, 6236.<\/strong><\/p>\n

    – 740 – 1. PRIVACIT\u00c9, ANTISCIENCE. Gilles, Lucy.\u00a0<\/span>\u00a0Collision aux USA entre les craintes pour la sph\u00e8re priv\u00e9e et le typage g\u00e9n\u00e9tique des nouveau-n\u00e9s.<\/u> De mani\u00e8re g\u00e9n\u00e9rale, l’\u00e9thique veut que les pr\u00e9l\u00e8vements biologiques soient faits avec le consentement du donneur. Cela devrait \u00eatre clair pour les b\u00e9b\u00e9s \u00e0 la naissance quand on teste le sang pour une batterie de maladies possibles. Que faire si, par la suite, on souhaite utiliser ces m\u00eames pr\u00e9l\u00e8vements pour une autre recherche? En gros, la r\u00e8gle US voulait que, une fois anonymis\u00e9, le pr\u00e9l\u00e8vement puisse \u00eatre utilis\u00e9 \u00e0 d’autres fins \u00e9thiquement acceptables. Le consensus passait sans trop approfondir. En Suisse, en principe, il faut une autorisation du donneur, mais avec quelle rigueur faut-il d\u00e9finir \u00ab\u00a0autre fin\u00a0\u00bb? Aux USA se d\u00e9veloppe un mouvement tr\u00e8s dur pour interdire toute action qui n’aurait pas \u00e9t\u00e9 sp\u00e9cifiquement autoris\u00e9e. Il y a bien quelque chose \u00e0 dire, en particulier sur le pr\u00e9l\u00e8vement d’ADN (l\u2019appel de B\u00e2le contre le typage g\u00e9n\u00e9tique a aussi ses raisons), mais il semble que le mouvement US prend force et racine dans le mouvement antiscience de la droite Tea Party.<\/em>
    \nVoir aussi Science du 29.5, pp9646.<\/p>\n

    – 796 – 798. \u00c9VOLUTION, ANTHROPOLOGIE, SOCIOBIOLOGIE, GENRE. Tous, car malin et sympathique.<\/span> Dyble et al. L’\u00e9galit\u00e9 des sexes peut expliquer la socialit\u00e9 extrafamiliale des bandes de chasseurs-cueilleurs. <\/u>Si l’on veut absolument trouver ce qui fait que l’homme est homme, ses capacit\u00e9s sociales sont un bon point de d\u00e9part. Ainsi, les humains sont hypercollaboratifs. Mieux, ils le sont aussi en dehors du lien familial ce qui est bizarre selon la biologie \u00e9volutive. En effet, si l’avantage \u00e9volutif de la collaboration est bien compr\u00e9hensible entre individus g\u00e9n\u00e9tiquement proches (chez beaucoup d’insectes sociaux, la collaboration \u00e0 lieu entre individus g\u00e9n\u00e9tiquement identiques), on doit se demander comment la collaboration entre individus non apparent\u00e9s a pu se d\u00e9velopper face \u00e0 l\u2019avantage de la collaboration interfamiliale (pourquoi utiliser de pr\u00e9cieuses forces \u00e0 aider la famille du voisin au lieu de soutenir les miens?). Cet article compare, dans des soci\u00e9t\u00e9s primitives, les liens familiaux \u00e0 l’int\u00e9rieur de groupes \u00e9galitaires de chasseurs-cueilleurs avec ceux de groupes non \u00e9galitaires d’agriculteurs (les seconds poss\u00e8dent des biens et l’h\u00e9ritage y est important avec les cons\u00e9quences que Piketty a analys\u00e9). Les auteurs mettent en \u00e9vidence un fait remarquable: dans les groupes \u00e9galitaires, le choix du partenaire du couple est autant le fait de l’homme que de la femme<\/u>. Ainsi la belle lign\u00e9e d’une filiation patriarcale ou matriarcale est constamment rompue. Dans une telle soci\u00e9t\u00e9, m\u00eame si les couples sont stables et que les parents savent qui sont leurs enfants, la relation familiale devient d\u00e9j\u00e0 compliqu\u00e9e avec les cousins et les petits enfants; pour les parents plus \u00e9loign\u00e9s, le cheni est vite total. Il y a l\u00e0 un mod\u00e8le qui explique, peut-\u00eatre, comment au cours de l’\u00e9volution r\u00e9cente de l’homme, les cartes du lien familial ont \u00e9t\u00e9 brouill\u00e9es, laissant ainsi la possibilit\u00e9 aux nouvelles capacit\u00e9s sociales de l’homme de s’\u00e9panouir au-del\u00e0 du milieu familial \u00e9troit. En compl\u00e9ment de cet article, les auteurs mod\u00e9lisent le processus. Les biologistes de l’\u00e9volution et des populations auront sans doute mati\u00e8re \u00e0 contribuer. Ceux qui souhaitent voir plus de femmes aux d\u00e9cisions s’en r\u00e9galeront.<\/p>\n

    \u00a0<\/strong><\/p>\n

    21.5.15. Nature 521, 7552.<\/strong><\/p>\n

    – 264. News. COMMERCE, M\u00c9DECINE. JaDi<\/span>, Urs. Aux USA, le nombre de personnes dont la d\u00e9pense annuelle en m\u00e9dicaments d\u00e9passe 100’000$, \u00e0 tripl\u00e9 de 2013 – 14. L’augmentation est de 63% pour le nombre de ceux qui en consomment plus 50k$. L’h\u00e9patite C et diff\u00e9rents traitements du cancer en sont la cause. L’augmentation du cout de la m\u00e9decine a subi la plus forte hausse depuis 10 ans. La tendance ne va pas s’arr\u00eater avec la mont\u00e9e en puissance de la m\u00e9decine personnalis\u00e9e. Faut-il croire que la grande m\u00e9decine est pourrie?<\/p>\n

    – S45 -92. cahier sp\u00e9cial. ABEILLES. Antoine<\/span>. Une information g\u00e9n\u00e9rale sur les abeilles et plusieurs articles visant \u00e0 faire le point sur le collapse des colonies<\/u>. Le cahier se termine par un article sponsoris\u00e9 par Bayer valorisant les n\u00e9ocortico\u00efdes. On y apprend qu’il est tr\u00e8s difficile d’y voir clair et que les exp\u00e9riences pour d\u00e9terminer la cause du probl\u00e8me des abeilles et autres insectes poll\u00e9niseurs sont difficiles \u00e0 identifier. Il faut noter la s\u00e9lection \u00e0 outrance, le m\u00e9chant Varroa, le camionnage ridicule des colonies \u00e0 travers les USA, et puis les n\u00e9ocorticoides et autres produits phytosanitaires. Qui joue quel r\u00f4le? La r\u00e9ponse n’est pas \u00e9vidente. \u00c9videmment cet article insistes sur les avantanges des n\u00e9ocorticoides. Ils sont relativement peu toxiques pour les mammif\u00e8res; ils s’appliquent en une fois sur les semences; comme ils ne s’\u00e9pandent pas dans les champs, ils sont peu diss\u00e9min\u00e9s. Leur interdiction par l’UE augmente l’usage des insecticides \u00e9pandu sur le terrain, souvent de mani\u00e8re r\u00e9p\u00e9t\u00e9e.
    \nJe vois quand m\u00eame dans cet article des donn\u00e9es diff\u00e9rentes de celles lues ailleurs sur le taux de destruction des colonies. Surtout, je me r\u00e9f\u00e8re aux deux articles de Nature du 7.5 (voir ci-dessus) qui d\u00e9montrent – il semble pour la premi\u00e8re fois de mani\u00e8re solide – l’effet n\u00e9faste des n\u00e9ocorticoides en conditions r\u00e9alistes.<\/em><\/p>\n

     <\/p>\n

    22.5.15. Science 348, 6237.<\/strong><\/p>\n

    – 848. POLITIQUE SCIENTIFIQUE. Gilles<\/span>. La Commission europ\u00e9enne promet d’\u00e9couter les scientifiques.<\/u> D\u00e8s son entr\u00e9e en fonction, J.-Cl. Junker, pr\u00e9sident de la CE, n’a pas renouvel\u00e9 Anne Glover, la cheffe consultant scientifique de la CE. Depuis les scientifiques s’inqui\u00e8tent. Le 13 mai a \u00e9t\u00e9 pr\u00e9sent\u00e9 la nouvelle organisation bas\u00e9e sur un groupe de 7 tops-scientifiques qui devraient servir de relai entre les organisations nationales ou internationales et la CE. \u00c0 ce que je comprends, l’enthousiasme est mitig\u00e9. Pour juger, il faudrait comprendre\u00a0\u00a0 <\/em><\/p>\n

    – 865 – 7, 873 – 5. BIODIVERSIT\u00c9, SCIENCE ET SOCI\u00c9T\u00c9. L’exp\u00e9dition Tara. <\/u>\u00c9ric Karsenti est venu au EMBL peu de temps avant que je n’en parte, mais, comme nous travaillions tous les deux sur les \u00b5tubules, nous nous sommes bien connus. Il est sympa comme tout. Je le savais aussi navigateur, mais ce qu’il a fait de cette derni\u00e8re comp\u00e9tence est \u00e9tonnant.<\/p>\n

    \"karsenti\"<\/a> \"Capture\"Capture<\/a><\/p>\n

    De 1831 \u00e0 1836, Darwin a fait un grand tour du monde en bateau. Il y a r\u00e9colt\u00e9 beaucoup d’informations dont il a su faire bon usage. Karsenti et ses copains ont pens\u00e9 qu’il valait la peine d’actualiser l’op\u00e9ration en utilisant les m\u00e9thodes de la biologie et de la communication d’aujourd’hui. Ainsi est n\u00e9 Tara Oceans, l’exp\u00e9dition qui, \u00e0 bord d’un voilier \u00e0 moteur de 36m, a sillonn\u00e9 les oc\u00e9ans durant 3 ans – disons que, \u00e0 la diff\u00e9rence du Beagle, l’\u00e9quipage pouvait \u00eatre relev\u00e9 aux escales et qu’un flot d’information \u00e9tait continuellement diffus\u00e9e.<\/p>\n

    L’exp\u00e9dition fut deux choses. (i) Une magnifique action de sensibilisation \u00e0 la valeur du milieu marin et (ii) une vaste op\u00e9ration de recherche sur la diversit\u00e9 de la vie dans l’oc\u00e9an. Le pr\u00e9sent no. de Science pr\u00e9sent cinq articles consid\u00e9rables dont \u00c9ric (avec beaucoup d’autres) est chaque fois coauteur. Juste pour donner une id\u00e9e, l’un, sign\u00e9 par 51 auteurs, s’intitule: \u00ab\u00a0Structure et fonction du microbiome oc\u00e9anique global\u00a0\u00bb. On y lit: \u00a0\u00bb Nous avons analys\u00e9 7.2.10^12 bases (d’ADN) de donn\u00e9es m\u00e9tag\u00e9nomiques de 243 \u00e9chantillons pr\u00e9lev\u00e9s dans 68 emplacements dans tous les oc\u00e9ans du globe … et identifi\u00e9 plus de 40 millions de s\u00e9quences de g\u00e8nes non redondants\u00a0\u00bb. Une belle le\u00e7on d’engagement Science, Environnemental et Politique.<\/p>\n

    – 921 – 925. BIOLOGIE SYST\u00c9MIQUE, \u00c9VOLUTION. Les biologistes<\/span>. Kachroo et al. L’humanisation des g\u00e8nes de la levure r\u00e9v\u00e8le la conservation de fonctions et la modularit\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique<\/u>. L’id\u00e9e que les animaux sont tellement diff\u00e9rents de l’homme qu’ils ne sont gu\u00e8re utilisables pour la recherche m\u00e9dicale est r\u00e9pandue, en particulier chez les opposants \u00e0 l’exp\u00e9rimentation animale. C’est mal vu. Au contraire, c’est l’unit\u00e9 de la vie qui nous \u00e9tonne le plus souvent comme l’illustre le pr\u00e9sent article.<\/p>\n

    Au point de vue de l’\u00e9volution, la levure est \u00e0 peu pr\u00e8s l\u2019eucaryote (cellules avec noyau) l plus distant de nous. Ici, on s’est amus\u00e9 \u00e0 remplacer une \u00e0 une, 414 g\u00e8nes essentiels de la levure par leur orthologue (le g\u00e8ne ayant la fonction correspondante) humain. Premier r\u00e9sultat: la levure humanis\u00e9e fonctionne correctement dans presque la moiti\u00e9 des cas. Deuxi\u00e8me r\u00e9sultat: ce n’est pas tellement la similarit\u00e9 de s\u00e9quence (le code de l’ADN) que la fonction dans le cadre du syst\u00e8me m\u00e9tabolique dont fait partie le g\u00e8ne qui est importante. On le comprend, si deux usines produisent le m\u00eame objet, qu’importe les machines (les prot\u00e9ines) du moment qu’elles remplissent la m\u00eame fonction. C’est la fonction de tout le syst\u00e8me qui compte. Pour cette raison, la biologie syst\u00e9mique nous \u00e9claire et nous aide \u00e0 comprendre les processus vitaux. Par exemple: (i) L’apprivoisement du chien par l’homme (ou vice vers) a \u00e9t\u00e9 possible en redirectionnant (vers l’homme) d’une fonction globale ancestrale (l’attachement de la louve \u00e0 ses petits). (ii) On d\u00e9couvre avec surprise que l’inflammation semble jouer un r\u00f4le dans toute sorte de processus disparates – y compris Alsheimer. C’est l’excellent J\u00fcrg Tschopp de l’UNIL (h\u00e9las, mort en montagne) qui \u00e0 d\u00e9couvert l’inflammasome, la structure qui produit l’inflammation mobilisatrice des d\u00e9fenses, mais que le corps utilise quelques fois \u00e0 tort et \u00e0 travers.<\/p>\n

     <\/p>\n

     <\/p>\n

    28.5.15. Nature 521, 7553.<\/strong><\/p>\n

    – 393, 401 – 2. POLITIQUE, COMMERCE, ENVIRONNEMENT, SANT\u00c9. \u00c9ditorial. TTIP<\/u> (partenariat transatlantique de commerce et d’investissement), TiSA<\/u> (accord sur le commerce des services) et ACTA<\/u> (accord commercial anticontrefa\u00e7on) ne sont pas des sujets de ce blog. Il faut quand m\u00eame les suivre de pr\u00e8s. <\/u><\/p>\n

    -914 – 917. VIROLOGIE, CRYO-ME. Les biologistes.<\/span> Ed. Egelman et al. Un virus infectant \u00e0 80\u00b0C; son truc: empaqueter l’ADN en forme A, plus stable que la forme B usuelle.<\/u> C’est nouveau, c’est une surprise.
    \nChacun aura compris pourquoi je suis avec un int\u00e9r\u00eat particulier l’avalanche croissante des structures mol\u00e9culaires que la cryo-ME rapporte \u00e0 r\u00e9solution atomique. Dans Nature et Science, il y en a maintenant plus d’une par semaine en moyenne. L’auteur principal du pr\u00e9sent article, un ami avec qui nous faisions une grande marche autour de Grandvaux vendredi pass\u00e9, parle de la r\u00e9volution de la cryo-ME et le bouleversement qu\u2019elle engendre en biologie structurale. Bon, \u00e7a me plait, mais je vais quand m\u00eame arr\u00eater de rapporter ici \u00e0 chaque occasion.<\/p>\n

    – 408 – 10, 415 – 418, 435 – 482. Cahier sp\u00e9cial: INTELLIGENCE ARTIFICIELLE, DRONES, LASER*.\u00a0On les appelle apprentissage profond (AP) ou intelligence artificielle (AI)<\/u>. Il leur faut d’\u00e9normes bases de donn\u00e9es et de la puissance de calcul. Il leur faut aussi un r\u00e9seau de neurones, c’est \u00e0 dire: I entr\u00e9es ind\u00e9pendantes dans une boite noire, R boutons pour r\u00e9gler la boite noire, et O sorties. \u00c0 l’entr\u00e9e, par exemple, il y a les sons d’un locuteur ou des images. \u00c0 la sortie, il y a des phrases ou la nature de l’objet. Quand l’apprentissage par le r\u00e9seau de neurones porte sur 1 milliard de phrases ou d’images et un nombre semblable de boutons ajust\u00e9s, le r\u00e9sultat est impressionnant. Je peux bien y croire, connaissant ce qui se fait en microscopie \u00e9lectronique. Il parait que les analyseurs de parole sont maintenant comp\u00e9titifs, m\u00eame en milieu bruyant et il est pr\u00e9tendu que la reconnaissance de personne permet de suivre une vaste population en situation r\u00e9elle.<\/p>\n

    Drones. pp. 460-466. Science, technologie et le futur des petits drones autonomes. <\/u>Pas cher et tr\u00e8s maniables, l’AI les rend autonome. L’auteur d\u00e9crit toutes sortes de fonction et de formes – y compris le drone qui se met en boule pour aller rouler dans des cavit\u00e9s impossibles- et r\u00eave d’essaims envoy\u00e9s sur les lieux d’une catastrophe. Ils informeront intelligemment sur la situation et farfouilleront dans tous les coins pour y rechercher les bless\u00e9s et, par exemple, apporter quelques premiers secours.<\/p>\n

    Armes et usage de combat.<\/u> Il faut glaner quelques bouts de phrases, lire entre les lignes ou sortir de ce cahier sp\u00e9cial pour comprendre l’importance militaire des LAWS (light autonomous weapons systems) et se rappeler que les grands investisseurs de l’AI et l’AP sont les militaires. L\u00e0, le r\u00eave est diff\u00e9rent. Par exemple, il s’agit d’envoyer des milliers de LAWS dans une ville investie par des terroristes. On ne parle pas de les \u00e9quiper de lasers aveuglants, comme ceux que l’on ach\u00e8te sous forme de petit pointeur; leur usage militaire est interdit par la CCW (Convention on Certain Conventional Weapons) \u00e0 Gen\u00e8ve en 1995. Par contre on apprend qu’une charge de 1 gramme perce un cr\u00e2ne.<\/p>\n

    Conclusions<\/u>. Tout comme CRISPR, gene drive et MCR (cf. plus haut et Nature 15.5 et 4.6), la technologie de l’AI et des robots autonomes est en marche. Qu’on le veuille ou non, elle seront\u00a0d\u00e9velopp\u00e9es et utilis\u00e9es.<\/p>\n

    Le r\u00e9sultat est explosif. Et alors?<\/p>\n

    – Alors,
    \n<\/em> (i) on continue de suivre ces d\u00e9veloppements,
    \n(ii) on milite pour une prise de conscience et une r\u00e8glementation mondiale, et
    \n(iii) on se r\u00e9jouit que la jeune g\u00e9n\u00e9ration soit intelligente et peut-\u00eatre plus responsable que la vieille.. <\/em><\/p>\n

    * Las\u00e9rologie.<\/u><\/p>\n

    Il s’agit de l’interaction entre les ondes \u00e9lectromagn\u00e9tiques (la lumi\u00e8re) et la mati\u00e8re. Trois cas sont possibles. (1) Un syst\u00e8me – disons un atome – au repos absorbe un photon et devient excit\u00e9. (2) Un atome excit\u00e9 perd son \u00e9nergie en \u00e9mettant un photon. (3) Einstein, dans un de ses fameux 4 articles de 1905, montrait qu’un 3e type d’interaction est n\u00e9cessaire pour rendre compte de la radiation du corps noir (la couleur de la lumi\u00e8re dans une boite ferm\u00e9e). Un atome excit\u00e9 est stimul\u00e9 \u00e0 perdre son \u00e9nergie lorsqu’il est travers\u00e9 par un photon de la m\u00eame \u00e9nergie. Au lieu d’un photon, on en a alors deux. Premi\u00e8re propri\u00e9t\u00e9 de l’\u00e9mission stimul\u00e9e<\/u>: la probabilit\u00e9 que le photon de passage prenne l’\u00e9nergie de l’atome excit\u00e9 est la m\u00eame que la probabilit\u00e9 qu’un photon de cette \u00e9nergie soit absorb\u00e9 en excitant un atome semblable. Cons\u00e9quemment, si l’on dispose d’une population d’atomes dont plus de la moiti\u00e9 est dans l’\u00e9tat excit\u00e9, le premier photon \u00e0 bonne \u00e9nergie entrainera avec lui plus de photons qu’il ne s’en perdra par absorption dans les atomes au repos. La lumi\u00e8re s’amplifie en vidant l’\u00e9nergie des atomes excit\u00e9s. Le ph\u00e9nom\u00e8ne s’arr\u00eate quand les atomes excit\u00e9s ne sont plus majoritaires. Pour obtenir un faisceau continu, il faut constamment \u00ab\u00a0pomper\u00a0\u00bb les atomes dans l’\u00e9tat excit\u00e9. Deuxi\u00e8me propri\u00e9t\u00e9 de l’\u00e9mission stimul\u00e9e<\/u>. Non seulement les photons stimul\u00e9s ont tous la m\u00eame \u00e9nergie, ils ont aussi la m\u00eame direction et la m\u00eame phase. Ils sont fondamentalement indistingables.<\/p>\n

    \"IMG_1793\"\u00a0\"Capture<\/p>\n

    Laser de puissance<\/u>. Les lasers sont partout, dans les lecteurs CD, dans les pointeurs pour conf\u00e9renciers. Jusqu’ici, les lasers capables de bruler ou percer sont tr\u00e8s lourds et tr\u00e8s chers. Ainsi le projet de bouclier spatial (Star War) dont r\u00eavait Busch a englouti en vain 2.4 milliards de dollars. Il semble toutefois qu’un progr\u00e8s d\u00e9cisif ait \u00e9t\u00e9 r\u00e9alis\u00e9 r\u00e9cemment. Son d\u00e9ploiement militaire n’en est qu’\u00e0 ses balbutiements, mais les ingr\u00e9dients sont l\u00e0. Le principe est illustr\u00e9 sur la figure. Des LED envoient de la lumi\u00e8re qui circule dans une fibre optique en se r\u00e9fl\u00e9chissant \u00e0 la surface de la fibre. Les deux bouts de la fibre r\u00e9fl\u00e9chissent la lumi\u00e8re afin d’augmenter encore la densit\u00e9 lumineuse. Le centre de la fibre est dop\u00e9 avec des atomes lourds que la lumi\u00e8re ambiante excite \u00e0 une \u00e9nergie pr\u00e9cise. C’est dans ce mince volume d’atomes excit\u00e9s au centre de la fibre que s’amplifie l’\u00e9mission stimul\u00e9e que seul laisse passer le filtre miroir du bout de la fibre. Des appareils capables de d\u00e9poser 10kw sur une surface de 5 cm de diam \u00e0 3 km sont en phase de commercialisation. Ils n’ont pas le niveau antiartillerie au antifus\u00e9es balistique, mais ils viendraient correctement \u00e0 bout des drones commerciaux actuels ou de petits bateaux des pirates cherchant noise \u00e0 de grands bateaux. Actuellement, ce sont encore de grosses machines \u00e0 monter sur de lourds camions ou des cargos. On s’attend \u00e0 ce que les progr\u00e8s de miniaturisation soient rapides et qu’ils changeront radicalement la physionomie des sites de combats. On veut bien le croire.<\/p>\n

     <\/p>\n

    29.5.15.Science 348, 6238.<\/strong><\/p>\n

    – 947. EUROPE, POLITIQUE. Gilles<\/span>. J. Wilsdon. Conseil scientifique pour l’Europe<\/u>. Cet \u00e9ditorial d\u00e9veloppe deux points. (i) Anne Glover, la cheffe conseill\u00e8re scientifique du pr\u00e9sident de l’EC a \u00e9t\u00e9 vid\u00e9e brutalement \u00e0 l’arriv\u00e9e de J-Cl Junker. Elle agissait au mieux dans un contexte peu favorable. (ii) Un nouveau syst\u00e8me qui regroupera 7 scientifiques de haut niveau vient d’\u00eatre pr\u00e9sent\u00e9. Il faudra voir, mais sa structure risque de favoriser les positions mollement consensuelles.<\/p>\n

    – 948. BUSINESS, CONFLIT, \u00c9THIQUE. Gilles, Lucy<\/span>. Henry Markram, le tr\u00e8s controvers\u00e9 directeur du Humain Brain Project de l’EPFL et de son \u00e9ventuel milliard europ\u00e9en, est aussi, avec sa femme Kamila, le fondateur de la firme Frontiers qui a lanc\u00e9 en 2014 les journaux m\u00e9dicaux \u00ab\u00a0Frontiers ub Medicine\u00a0\u00bb et \u00ab\u00a0Frontiers in Cardiovascular Medidine\u00a0\u00bb. Le 7 mai, la direction de la firme a saqu\u00e9 31 des \u00e9diteurs de ces deux journaux (c-\u00e0-d, presque tous) qui se plaignaient de l’interf\u00e9rence de la firme dans les d\u00e9cisions \u00e9ditoriales. La firme explique que le blocage de certains articles par les \u00e9diteurs revient \u00e0 une forme d’extorsion.<\/p>\n

    Il va vraiment falloir mettre de l’ordre avec les int\u00e9r\u00eats financiers priv\u00e9s dans les universit\u00e9s suisses, de l’EPFL en particulier.<\/p>\n

    – 971-2, 1013-15.\u00c9DUCATION, M\u00c9MOIRE, PAVLOV. Lucy.\u00a0<\/span>G.B.Feld & J. Born; Hu et al. Exploiter le sommeil pour corriger les mauvaises habitudes.<\/u> On travaille sur le biais classique associant personne noire\/mauvaise et femme\/stupide. L’exp\u00e9rience consiste \u00e0 demander au sujet d’identifier, parmi les paires pr\u00e9sent\u00e9es, celles qui sont positives (par exemple: portrait d’un noir \/ le mot \u00ab\u00a0beau\u00a0\u00bb). Un son caract\u00e9ristique marque les r\u00e9ponses correctes. La premi\u00e8re partie du r\u00e9sultat est connu: le sujet \u00ab\u00a0s’am\u00e9liore\u00a0\u00bb il devient moins biais\u00e9, mais l’effet ne tient gu\u00e8re qu\u2019une semaine. Deuxi\u00e8me exp\u00e9rience: apr\u00e8s l’exercice de s\u00e9lection des paires, le sujet fait une sieste de 30′ et, pendant la p\u00e9riode d’ondes lentes, il est soumis au son caract\u00e9ristique de ses bons choix. R\u00e9sultat: l'\u00a0\u00bbam\u00e9lioration\u00a0\u00bb du patient est renforc\u00e9e et, surtout, elle dure.<\/p>\n

    Suivent deux questions: est-ce reproductible? Que peut\/veut-on en faire? En lisant cet article, le film \u00ab\u00a0les oranges m\u00e9caniques\u00a0\u00bb me revient \u00e0 l\u2019esprit.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

    01.05.05. Scientific American. – 10. M\u00c9DECINE. ROUGEOLE. La rougeole ne fait plus peur chez nous. Le vaccin est efficace et notre population est bien couverte. Et pourtant! D’abord la maladie est extr\u00eamement contagieuse (on dit qu\u2019un malade infecte 15 personnes en moyenne; environ 1.5 – 2 pour Ebola). Ainsi, pour pr\u00e9venir une \u00e9pid\u00e9mie explosive il […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"jetpack_post_was_ever_published":false,"footnotes":"","jetpack_publicize_message":"","jetpack_publicize_feature_enabled":true,"jetpack_social_post_already_shared":false,"jetpack_social_options":{"image_generator_settings":{"template":"highway","default_image_id":0,"font":"","enabled":false},"version":2}},"categories":[89],"tags":[111,176,110,154,161,113,70,188,187],"class_list":["post-634","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-science-actualite","tag-bioethique","tag-biotechnologie","tag-climat","tag-cryo-me","tag-ecologie","tag-medecine","tag-politique-2","tag-pollution","tag-structure-moleculaire"],"jetpack_publicize_connections":[],"jetpack_featured_media_url":"","jetpack-related-posts":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/634","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=634"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/634\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=634"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=634"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=634"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}