{"id":668,"date":"2015-07-31T16:33:20","date_gmt":"2015-07-31T14:33:20","guid":{"rendered":"http:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/?p=668"},"modified":"2015-08-28T22:33:08","modified_gmt":"2015-08-28T20:33:08","slug":"science-actualite-juin-2015","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/?p=668","title":{"rendered":"Science &#8211; actualit\u00e9, juin 2015"},"content":{"rendered":"<p><strong>Quelques points saillants en juin 2015<\/strong><\/p>\n<p>(5.6.15, 1147: Structure d&rsquo;un complexe de la beta-galactosidase \u00e0 2.2\u00c5. <strong>Nouveau record. <\/strong>Subramanian, NIH<br \/>\nScience 19.6.15, 1365: design de r\u00e9seaux prot\u00e9iques artificiels 2-dimensionnels<\/p>\n<p>Nature, 25.5, 450 &#8211; 4: le complexe promoteur de l&rsquo;anaphase et son m\u00e9canisme d&rsquo;ubiquitinisation de prot\u00e9ine)<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>01.06.15. Scientific American.<\/strong><\/p>\n<p>&#8211; 16. <strong>SCIENCE ET SOCI\u00c9T\u00c9, RISQUE.<\/strong> <span style=\"color: #ff0000;\">Alain<\/span>, Lazare. Le Bulletin of the Atomic Scientists, cr\u00e9\u00e9 par des scientifiques issus du projet Manhattan, informe depuis 70 ans sur les risques de destruction massive que g\u00e9n\u00e8re notre soci\u00e9t\u00e9. Edouard (mon patron de th\u00e8se) m&rsquo;y avait longtemps abonn\u00e9. Sa lecture fut formative pour moi. L&rsquo;horloge, ic\u00f4ne du Journal, veut faire remarquer que nous sommes dangereusement proches de minuit. Elle a \u00e9t\u00e9 r\u00e9cemment avanc\u00e9e de 3 minutes en raison de l&rsquo;\u00e9chauffement climatique et du ralentissement des efforts de d\u00e9sarmement. Un remarquable think tank est associ\u00e9 au journal. C&rsquo;est un peu l&rsquo;International Crisis Groupe de la lutte contre les risques de destruction globale. Martin Rees, astronome de Cambridge, y participe. Il analyse la situation actuelle dans cette page du Scientific American et se r\u00e9f\u00e8re \u00e0 CRISPR et aux exp\u00e9riences de \u00ab\u00a0gain-of-function\u00a0\u00bb sur les virus. Il conclut: <u>\u00ab\u00a0Bioerreur et bioterreur sont au sommet de ma liste des risques globaux \u00e0 moyen terme (10 &#8211; 20 ans)\u00a0\u00bb<\/u>. <em>Je partage cet avis en incluant la DOYbiol (biologie do-it-yourself) dans les facteurs de danger.<\/em><\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/i0.wp.com\/www.dubochet.ch\/jacques\/wp-content\/uploads\/2015\/07\/Capture-d%E2%80%99%C3%A9cran-2015-07-31-%C3%A0-16.48.11.png?ssl=1\"><img data-recalc-dims=\"1\" loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone size-full wp-image-672\" src=\"https:\/\/i0.wp.com\/www.dubochet.ch\/jacques\/wp-content\/uploads\/2015\/07\/Capture-d%E2%80%99%C3%A9cran-2015-07-31-%C3%A0-16.48.11.png?resize=133%2C184&#038;ssl=1\" alt=\"Capture d\u2019\u00e9cran 2015-07-31 \u00e0 16.48.11\" width=\"133\" height=\"184\" \/><\/a><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&#8211; 22 &#8211; 25. ADOLESCENCE. <span style=\"color: #ff0000;\">Manu<\/span>. <u>L&rsquo;adolescent n&rsquo;est pas un enfant perdu ou un adulte mal finit<\/u>. Il repr\u00e9sente une phase caract\u00e9ristique du d\u00e9veloppement du corps et du cerveau. Comme un stade de la vie des abeilles, l&rsquo;adolescence joue un r\u00f4le important pour la soci\u00e9t\u00e9: l&rsquo;exploration, l&rsquo;invention, la cr\u00e9ativit\u00e9 d\u00e9brid\u00e9e. Manu racontait comment ses filles discutaient avec lui en sautant d&rsquo;un argument \u00e0 l&rsquo;autre sans souci des contradictions. C&rsquo;est \u00e7a, la mobilit\u00e9 de la pens\u00e9e des adolescents. Elle s&rsquo;observe aussi dans les connexions c\u00e9r\u00e9brales et les flux nerveux.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>4.6.15, Nature 522.<\/strong><\/p>\n<p>&#8211; 13 &#8211; 14. SCIENCE, POLITIQUE, \u00c9THIQUE. <u>Des scientifiques poursuivis \u00e0 cause de la maladie des oliviers.<\/u> Une bact\u00e9rie tueuse des oliviers a \u00e9t\u00e9 d\u00e9tect\u00e9e en 2013 dans la r\u00e9gion de Bari en Italie. Les sp\u00e9cialistes \u00e9tudient cette infection et cherchent \u00e0 stopper sa progression, mais, pour le moment, la maladie progresse malgr\u00e9 des mesures s\u00e9v\u00e8res. On sait que l&rsquo;\u00c9tat et la politique italienne a une relation bizarre avec la science. On se rappelle les g\u00e9ologues lourdement condamn\u00e9s parce qu&rsquo;ils n&rsquo;avaient mal pr\u00e9vu un tremblement de terre il y a quelques ann\u00e9es (ils ont finalement \u00e9t\u00e9 blanchis). En Italie, en cas de soup\u00e7on de fraude scientifique, c&rsquo;est le procureur de la r\u00e9publique qui intervient et la police qui enqu\u00eate. Ce sont eux qui s&rsquo;occupent maintenant des scientifiques qui essayent de maitriser l&rsquo;\u00e9pid\u00e9mie. Accusations diverses, descente de police, confiscation des ordinateurs. Par exemple, il est dit que l&rsquo;\u00e9pid\u00e9mie a \u00e9t\u00e9 caus\u00e9e par la bact\u00e9rie \u00e9chapp\u00e9e lors d&rsquo;un cours pratique donn\u00e9 dans la r\u00e9gion. Les scientifiques concern\u00e9s r\u00e9pliquent que la souche de l&rsquo;\u00e9pid\u00e9mie et la souche du cours n&rsquo;ont rien \u00e0 voir. Selon eux, la souche pathog\u00e8ne est probablement venue du Costa Rica avec des fleurs import\u00e9es. L&rsquo;ambiance chez les scientifiques directement ou indirectement concern\u00e9s n&rsquo;est pas radieuse.<\/p>\n<p>La question de savoir qui enqu\u00eate en cas de fraude scientifique est ainsi pos\u00e9e. La police est-elle capable de mener ces enqu\u00eates qui n\u00e9cessitent la meilleure comp\u00e9tence scientifique? Boof! On parle de d\u00e9rapages \u00e9tonnants. D&rsquo;autre part, laisser les scientifiques arranger leur cuisine entre eux n&rsquo;est pas satisfaisant non plus. L&rsquo;Italie a le m\u00e9rite de poser le probl\u00e8me.<\/p>\n<p>&#8211; 20 &#8211; 24. BIO\u00c9THIQUE, BIOTECHNOLOGIE, RISQUE. <u>Le bouleversement CRISPR et Gene Drive.<\/u> Le point exactement 3 ans apr\u00e8s la premi\u00e8re utilisation de CRISPR comme outil d&rsquo;\u00e9dition du g\u00e9nome et 4 mois apr\u00e8s son premier emploi pour le Gene Drive, le truc qui permet \u00e0 un OGM d&rsquo;envahir une esp\u00e8ce naturelle en quelques de g\u00e9n\u00e9rations. Deux pages pour r\u00e9sumer la situation et rappeler l&rsquo;histoire, avec une analyse oscillant entre enthousiasme et inqui\u00e9tude. Un exemple pour cette derni\u00e8re. On utilise CRISPR pour faire un virus qui donne un cancer sp\u00e9cifique \u00e0 une souris. Et puis, on se dit que, avec juste quelques petites mutations, le virus pourrait faire la m\u00eame chose chez l&rsquo;homme. Zut!<\/p>\n<p><em> Des possibilit\u00e9s extraordinaires, des probl\u00e8mes effarants, pas de solutions. <\/em><\/p>\n<p>&#8211; 29 &#8211; 30. M\u00c9DECINE, \u00c9THIQUE. <span style=\"color: #ff0000;\">Christine, Laur\u00e9e, Lazare.<\/span> <u>Se pr\u00e9parer pour des r\u00e9sultats inattendus lors d&rsquo;un test pr\u00e9natal. <\/u>Depuis 2011 existe un test pr\u00e9natal non invasif bas\u00e9 sur l&rsquo;analyse g\u00e9n\u00e9tique des cellules du foetus circulant dans le sang de la m\u00e8re (on vient d&rsquo;apprendre que son usage est autoris\u00e9 en Suisse). En 2014, 800&rsquo;000 de ces tests ont \u00e9t\u00e9 effectu\u00e9s par les quelques firmes qui offrent ce service. Alors que l&rsquo;amniocent\u00e8se a un taux d&rsquo;erreur de 5%, le nouveau test annonce 0.2%. Bas\u00e9 sur le s\u00e9quen\u00e7age de l&rsquo;ADN, il dit aussi beaucoup plus; potentiellement il permettrait de connaitre le g\u00e9nome complet du futur enfant. Effet collat\u00e9ral, il parle aussi de la m\u00e8re. Actuellement, le probl\u00e8me le plus fr\u00e9quent est la d\u00e9couverte d\u2019un cancer chez celle-ci. Il y a des cas plus bizarres. Par exemple, un d\u00e9faut chromosomique est suspect\u00e9 chez la m\u00e8re, mais il se r\u00e9v\u00e8le qu&rsquo;il s&rsquo;agit de l&rsquo;homme dont elle a re\u00e7u un rein transplant\u00e9.<\/p>\n<p><em>L&rsquo;usage de ces informations posera un probl\u00e8me consid\u00e9rable \u00e0 l&rsquo;avenir. D\u00e9j\u00e0 maintenant, on constate que cette probl\u00e9matique d\u00e9passe largement les prestataires du service. <\/em><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>5.6.15. Science 348, 6239.<\/strong><\/p>\n<p>&#8211; 1062. POLITIQUE, SCIENCE. <span style=\"color: #ff0000;\">Gilles<\/span>. <u>L&rsquo;ERC sauv\u00e9 des coupes?<\/u> M. Junker &#8211; le Pr\u00e9sident de la Commission europ\u00e9enne que nous n&rsquo;appr\u00e9cions pas &#8211; veut couper 2.7 milliards des 74 milliards de Horizon 2020, le programme de recherche de l&rsquo;Europe de ces 5 prochaines ann\u00e9es, y compris 220 millions coup\u00e9s \u00e0 l&rsquo;ERC. Protestation vigoureuse des scientifiques. Il faut dire que l&rsquo;ERC &#8211; Le Conseil europ\u00e9en de la recherche &#8211; est largement consid\u00e9r\u00e9 comme le fleuron des succ\u00e8s europ\u00e9ens. Retour en arri\u00e8re de la Commission, l&rsquo;ERC sera \u00e9pargn\u00e9 comme aussi les bourses Marie Curie.<\/p>\n<p>&#8211; 1072 &#8211; 1085. Cahier sp\u00e9cial. ETHNOLOGIE. <span style=\"color: #ff0000;\">Pia<\/span>. <u>Que faire avec les derni\u00e8res tribus sauvages d&rsquo;Amazonie?<\/u> Il y en a; elles n&rsquo;ont eu jusqu&rsquo;ici aucun contact avec la \u00ab\u00a0civilisation\u00a0\u00bb. On en trouve en particulier dans la for\u00eat tropicale du P\u00e9rou et du Br\u00e9sil. En principe elles sont prot\u00e9g\u00e9es par les lois du Br\u00e9sil, mais, \u00e0 la longue, le contact est in\u00e9vitable avec l&rsquo;imm\u00e9diate contamination par nos maladies et l&rsquo;impossible ajustement des cultures. Cette s\u00e9rie d&rsquo;articles fait le point et constate que c&rsquo;est \u00e0 l&rsquo;\u00c9tat, aux ethnologues et aux m\u00e9decins d&rsquo;\u00eatre proactif pour limiter les d\u00e9g\u00e2ts de la collision annonc\u00e9e. <em>J&rsquo;ai la copie des articles, vous pouvez me les demander. <\/em><\/p>\n<p>&#8211; 1087 &#8211; 8, 1118 &#8211; 22. MAT\u00c9RIAUX. <span style=\"color: #ff0000;\">Manu<\/span>. <u>Superlubricit\u00e9: \u00e7a glisse quand c&rsquo;est sec. <\/u>30% de l&rsquo;\u00e9nergie d&rsquo;une voiture part en frottement. Typiquement, les coefficients de frottement sont de l&rsquo;ordre de quelques dixi\u00e8mes (frottement \u2248 0.1 x force appliqu\u00e9e). La lubrification permet de diminuer ces pertes. La poudre de graphite que l&rsquo;on injecte dans une serrure r\u00e9ticente produit une diminution substantielle du frottement. Toutefois, il y a mieux, au niveau microscopique, on connait des cas de superlubricit\u00e9 dans lesquels le frottement disparait presque compl\u00e8tement (il peut perdre 3 ordres de grandeur.) Un exemple, mentionn\u00e9 r\u00e9cemment sur ce blog (Nature, 26.3.15), concerne le glissement de plaques de graph\u00e8nes l&rsquo;une sur l&rsquo;autre. Le pr\u00e9sent article r\u00e9ussit \u00e0 combiner \u00e9trangement des nanoparticules de diamant (hyperdur, hyperabrasif) avec des patches microscopiques de graph\u00e8ne. En agitant correctement l&rsquo;un avec l&rsquo;autre, le graph\u00e8ne \u00ab\u00a0emballe\u00a0\u00bb les particules de diamant en des petites boules qui se comportent en superlubrifiants entre deux surfaces solides macroscopiques. Une limitation toutefois: l&rsquo;effet disparait en pr\u00e9sence d&rsquo;eau. Pas de doute, le carbone est un chouette \u00e9l\u00e9ment. Nous pr\u00e9pare-t-il une r\u00e9volution m\u00e9canique?<\/p>\n<p>&#8211; 1090 &#8211; 1, 1130 &#8211; 32. SOCIOLOGIE, POLITIQUE, R\u00c9SEAUX SOCIAUX. <span style=\"color: #ff0000;\">Gilles<\/span>. <u>La mont\u00e9e des algorithmes sociaux.<\/u> La r\u00e9ponse que l&rsquo;on re\u00e7oit \u00e0 une demande sur Google ou Facebook (question \u00e0 Gilles: quelle est la relation entre ces deux?) est s\u00e9lective. En anglais, on parle de \u00ab\u00a0curation\u00a0\u00bb (un mot nouveau dont le sens est loin de sa racine \u00ab\u00a0curateur\u00a0\u00bb). L&rsquo;article tente de savoir en quoi la curation influence les visions politiques des utilisateurs. Le processus de curation est bas\u00e9 sur le portrait de l&rsquo;utilisateur et de ses \u00ab\u00a0amis\u00a0\u00bb tel que le programme de curation le construit sur la base des donn\u00e9es du web et on ne sait trop quoi d&rsquo;autre. Il est tr\u00e8s complexe. On en veut pour preuve le fait que les auteurs de cet article sont des chercheurs de Facebook. On pourrait donc penser qu&rsquo;il leur aurait suffi d&rsquo;aller poser la question \u00e0 leurs coll\u00e8gues qui \u00e9crivent le software. Pas du tout, personne n&rsquo;en a une vue globale et personne ne sait exactement son effet! On connait quand m\u00eame la tendance \u00e0 donner des r\u00e9ponses qui vont dans la direction de pens\u00e9e de l&rsquo;utilisateur et de ses \u00ab\u00a0amis\u00a0\u00bb. Quelques fois, l&rsquo;intervention est plus marqu\u00e9e; l&rsquo;auteur du commentaire a \u00e9tudi\u00e9 comment le prix des produits propos\u00e9s dans le e-commerce est quelquefois individuellement modul\u00e9. Le r\u00e9sultat de la pr\u00e9sente \u00e9tude porte sur 10 millions d&rsquo;utilisateurs US. Elle constate que, oui, les r\u00e9ponses sont politiquement biais\u00e9es, mais que l&rsquo;effet est limit\u00e9 dans la situation actuelle. Plus important est le choix que l&rsquo;internaute fera dans les r\u00e9ponses propos\u00e9es et, en amont, le choix de ses amis.<\/p>\n<p><em>On note avec satisfaction que l&rsquo;\u00e9tude a \u00e9t\u00e9 faite par les gens de Facebook eux-m\u00eames. Cela ne freinera pas les \u00e9ventuels d\u00e9rapages futurs. Des dispositifs neutres d&rsquo;analyse et de protections doivent \u00eatre mis en place. J&rsquo;ai la copie des articles, vous pouvez me les demander.<\/em><\/p>\n<p><em>\u00a0<\/em><\/p>\n<p><strong>11.6.15. Nature 522, 7555.<\/strong><\/p>\n<p>&#8211; 128. CLIMAT, POLITIQUE. <u>Buts ambitieux<\/u>. Le 8 juin, le Groupe des 7 a fix\u00e9 les buts suivants pour le climat: (i) 70% r\u00e9duction des GES (gaz \u00e0 effet de serre) en 2050; (ii) \u00e9conomie d\u00e9carbonis\u00e9e \u00e0 la fin du si\u00e8cle; (iii) confirmation de l&rsquo;engagement de Copenhague en 2009 d&rsquo;atteindre 100 milliards d&rsquo;aide annuelle (publique et priv\u00e9e) pour le climat aux pays en d\u00e9veloppement.<\/p>\n<p>&#8211; 149 &#8211; 151. \u00c9NERGIE, GOUVERNANCE. <u>Peut-on sauver ITER<\/u>. ITER est l&rsquo;\u00e9norme projet international de centrale \u00e0 fusion nucl\u00e9aire en douloureuse construction \u00e0 Cadarache. Prix et d\u00e9lais s&rsquo;envolent. Le projet survit puisque tant d&rsquo;argent y a d\u00e9j\u00e0 \u00e9t\u00e9 investi. Bernard Bigot en est le nouveau directeur. En lui reposent les espoirs de ne pas sombrer. Son analyse est que le probl\u00e8me est dans la gouvernance du projet qui se perd dans les arrangements entre pays contributeurs. Il demande du pouvoir et de l&rsquo;argent: 20 % du budget discr\u00e9tionnaire dans ses mains. D\u00e9cision cet automne. <em>J&rsquo;ai toujours pens\u00e9 du mal de ce projet; trop d&rsquo;oeufs dans le m\u00eame panier, objectif de construction trop lointain alors que la science de base change l&rsquo;\u00e9clairage du domaine au moins aussi vite. Le probl\u00e8me ressemble \u00e0 celui du HBP de Markram.<\/em><\/p>\n<p>Cl\u00e9ment Bordier a aussi son commentaire.<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/i0.wp.com\/www.dubochet.ch\/jacques\/wp-content\/uploads\/2015\/08\/FullSizeRender.jpg?ssl=1\"><img data-recalc-dims=\"1\" loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone size-large wp-image-677\" src=\"https:\/\/i0.wp.com\/www.dubochet.ch\/jacques\/wp-content\/uploads\/2015\/08\/FullSizeRender.jpg?resize=604%2C617&#038;ssl=1\" alt=\"FullSizeRender\" width=\"604\" height=\"617\" srcset=\"https:\/\/i0.wp.com\/www.dubochet.ch\/jacques\/wp-content\/uploads\/2015\/08\/FullSizeRender.jpg?resize=1002%2C1024&amp;ssl=1 1002w, https:\/\/i0.wp.com\/www.dubochet.ch\/jacques\/wp-content\/uploads\/2015\/08\/FullSizeRender.jpg?resize=293%2C300&amp;ssl=1 293w, https:\/\/i0.wp.com\/www.dubochet.ch\/jacques\/wp-content\/uploads\/2015\/08\/FullSizeRender.jpg?w=1252&amp;ssl=1 1252w\" sizes=\"auto, (max-width: 604px) 100vw, 604px\" \/><\/a><\/p>\n<p><em>&#8211; <\/em>140 &#8211; 1, 164 &#8211; 5, 167 &#8211; 72 (Allentoft et al), 207 &#8211; 11 (Haak et al). G\u00c9NITIQUE, POPULATION, HISTOIRE. <span style=\"color: #ff0000;\">Anne-Claude.<\/span> La question de l&rsquo;origine de notre civilisation occidentale et des langages indo-europ\u00e9ens fait d\u00e9bat depuis 200 ans, y compris dans ses relents racistes et nationalistes. Une importante partie du probl\u00e8me revient \u00e0 la question: qui circule principalement, les gens ou les id\u00e9es (ou les techniques)? La g\u00e9n\u00e9tique vient contribuer avec une avalanche de donn\u00e9es d&rsquo;ADN rapport\u00e9s dans 2 gros articles. Il y avait deux th\u00e9ories principales: l&rsquo;origine anatolienne (Turquie actuelle) ancienne (7k ans) ou l&rsquo;origine plus r\u00e9cente (\u00e2ge du cuivre et du bronze entre 3700 et 2000 AJC) dans la population des steppes Yamnaya au nord, entre la Mer noire et la mer Caspienne. C&rsquo;est la deuxi\u00e8me th\u00e9orie qui se confirme, d\u00e9montrant que cette population s&rsquo;est \u00e9tendue au nord de l&rsquo;Europe et \u00e0 l&rsquo;est en Asie. Les Yamnayas descendent eux-m\u00eames des populations de l&rsquo;Eurasie du Nord, les m\u00eames que celles qui sont aller peupler l&rsquo;Am\u00e9rique. On associe la mobilit\u00e9 des Yamnayas au fait qu&rsquo;ils se d\u00e9pla\u00e7aient en wagons \u00e0 roue tir\u00e9s par des chevaux.<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/i0.wp.com\/www.dubochet.ch\/jacques\/wp-content\/uploads\/2015\/07\/langage-debate-Nat-522164.png?ssl=1\"><img data-recalc-dims=\"1\" loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone size-full wp-image-671\" src=\"https:\/\/i0.wp.com\/www.dubochet.ch\/jacques\/wp-content\/uploads\/2015\/07\/langage-debate-Nat-522164.png?resize=868%2C398&#038;ssl=1\" alt=\"langage debate, Nat 522,164\" width=\"868\" height=\"398\" srcset=\"https:\/\/i0.wp.com\/www.dubochet.ch\/jacques\/wp-content\/uploads\/2015\/07\/langage-debate-Nat-522164.png?w=868&amp;ssl=1 868w, https:\/\/i0.wp.com\/www.dubochet.ch\/jacques\/wp-content\/uploads\/2015\/07\/langage-debate-Nat-522164.png?resize=300%2C138&amp;ssl=1 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 868px) 100vw, 868px\" \/><\/a><\/p>\n<p><strong>12.6.15. Science 348, 6240.<\/strong><\/p>\n<p>&#8211; 1180. ENVIRONEMENT, POLITIQUE. <span style=\"color: #ff0000;\">Larry<\/span>. <u>Le Canada tourne voyou.<\/u> Cent scientifiques respect\u00e9s demandent au Canada de freiner son activit\u00e9 mini\u00e8re des sables bitumineux. \u00c0 moins d&rsquo;une v\u00e9ritable volteface, le Canada causera des dommages incontr\u00f4l\u00e9s \u00e0 ses habitants et \u00e0 son territoire et ne respectera pas ses engagements internationaux. Il est not\u00e9 que, en Alberta, malgr\u00e9 les conventions et les promesses, moins de 0.2% des surfaces exploit\u00e9es ont \u00e9t\u00e9 remises en \u00e9tat.<\/p>\n<p>&#8211; 1204 &#8211; 5, 1224 &#8211; 6. G\u00c9OLOGIE, FRACKING. <span style=\"color: #ff0000;\">Manu<\/span>. L&rsquo;injection de liquide sous haute pression pour la fracking g\u00e9n\u00e8re d&rsquo;inqui\u00e9tants tremblements de terre (le record a atteint une magnitude de 6 lors du remplissage d&rsquo;un barrage en Inde, ceux caus\u00e9s par le fracking n\u2019ont pas d\u00e9pass\u00e9 5 jusqu\u2019ici). En chaque point du sol, il y a une contrainte normale et une contrainte tangentielle. Il y a rupture, donc tremblement de terre, quand la contrainte tangentielle d\u00e9passe le produit du coefficient de frottement et de la contrainte normal. L&rsquo;injection du liquide de fracking ne change gu\u00e8re les contraintes, mais elle peut diminuer le coefficient de frottement avec pour effet, soit une rupture brusque, soit une reptation lente vers une relaxation des forces tangentielles. Le pr\u00e9sent article, qui ne consid\u00e8re que des profondeurs de quelques centaines de m\u00e8tres, sugg\u00e8re que, en suivant exactement les micro-tremblements de terre, il devrait \u00eatre possible de contr\u00f4ler le rythme d&rsquo;injection de mani\u00e8re \u00e0 favoriser la reptation et \u00e9viter la rupture. <em>Va-t-on vers une technique de pr\u00e9vention des tremblements de terre naturels? On en est encore loin.<\/em><\/p>\n<p><em>\u00a0<\/em><\/p>\n<p><strong>18.6.15. Nature 522, 7556<\/strong><\/p>\n<p>&#8211; 259. SANT\u00c9, SOCIOLOGIE. <span style=\"color: #ff0000;\">Lucy<\/span>. <u>Ce que nous mangeons: les donn\u00e9es sont mauvaises<\/u>. http:\/\/doi.org\/5dd; http:\/\/doi.org\/5df (2015). Une enqu\u00eate de la Mayo Clinic teste, aux USA, la valeur des enqu\u00eates sur les habitudes alimentaires. Typiquement, il est demand\u00e9 ce que les gens ont mang\u00e9 la veille. L&rsquo;enqu\u00eate montre qu&rsquo;ils se souviennent mal et imaginent beaucoup. Les conseils nutritionnels donn\u00e9s sur ces bases sont mis en doute.<\/p>\n<p>&#8211; 268 &#8211; 9. MATERIAUX, BUSINESS. <u>Graph\u00e8ne: le point sur ses applications.<\/u> Le graph\u00e8ne, cette forme nouvellement d\u00e9couverte du carbone (Prix Nobel en 2010) en couche monoatomique plane (voir aussi 5.6.15.) La substance a des propri\u00e9t\u00e9s extraordinaires. 10 fois plus solide que l&rsquo;acier, 10 fois plus conductrice que le cuivre, etc. On en produira cette ann\u00e9e plus de 600 tonnes et 5000 brevets d&rsquo;applications ont \u00e9t\u00e9 attribu\u00e9s jusqu&rsquo;ici. La Chine domine largement le domaine. Les applications commercialement les plus avanc\u00e9es concernent peut-\u00eatre les \u00e9crans plats et l&rsquo;\u00e9vacuation de chaleur. Il manque toutefois une application qui fasse \u00ab\u00a0tilt\u00a0\u00bb, qui soit \u00e0 la hauteur des promesses du mat\u00e9riel. <em>On attend!<\/em><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>19.6.15. Science 348, 6241<\/strong><\/p>\n<p>&#8211; 1294. M\u00c9DIA, GENRE. <span style=\"color: #ff0000;\">Lucy<\/span>. Tim Hunt (72) est un biologiste fameux, Prix Nobel, actifs dans de nombreuses institutions. Il fait quelques mauvaises plaisanteries \u00e0 la World Conference of Scientific Journalists \u00e0 S\u00e9oul. Il fait remarquer que \u00ab\u00a0les femmes dans les labos, \u00e7a complique quand les scientifiques tombent amoureux et que les filles pleurent quand on leur fait des remarques\u00a0\u00bb. Scandale mondial. Il est d\u00e9nonc\u00e9 partout et mis au pilori du monde entier. Il admet sa b\u00eatise, mais trouve la r\u00e9action exag\u00e9r\u00e9e. Dans Nature de la semaine prochaine (25 juin, p. 393), une de ses post doc prend sa d\u00e9fense sur une page d\u00e9crivant factuellement qui est l&rsquo;homme. Le labo \u00e9tait bien \u00e9quilibr\u00e9 homme\/femme, le patron \u00e9tait pr\u00e9venant envers chacun, sa r\u00e9putation \u00e9tait solide.<br \/>\n<em>Monde stupide o\u00f9 les effets d&rsquo;annonce et les scandales remplacent l&rsquo;information.<\/em><\/p>\n<p>&#8211; 1325. INGENIERING G\u00c9N\u00c9TIQUE, \u00c9THIQUE. Lettre de H.L.Muller, descendant en flamme ceux qui demandent de la retenue envers les manipulations g\u00e9n\u00e9tiques des embryons humains. Il revient au moratoire d&rsquo;Asilomar (1975) qu&rsquo;il \u00e9value comme un total \u00e9chec. Son argument: un gamin de 20 dont les articulations se d\u00e9composent sous l&rsquo;effet de l&rsquo;an\u00e9mie falciforme; il est indigne de ne pas tout tenter pour le sauver, lui et les autres. On est pr\u00eat, allons-y!<\/p>\n<p>&#8211; 1358 &#8211; 61. \u00c9THOLOGIE. A. Strandburg-Peshkin. <u>La d\u00e9mocratie des babouins.<\/u> Nous avons vu r\u00e9cemment la proc\u00e9dure qui permet \u00e0 des fourmis de coordonner leur action dans une t\u00e2che complexe. Autre animal, autre algorithme. Il s&rsquo;agit ici d&rsquo;une bande d&rsquo;une centaine de babouins au Kenya. Durant la journ\u00e9e, \u00e0 la recherche de nourriture, la bande reste group\u00e9e en se baladant sur quelques km et revient le soir au dortoir. \u00c0 partir du suivi pr\u00e9cis de 25 individus, la proc\u00e9dure qui d\u00e9finit les d\u00e9placements a pu \u00eatre caract\u00e9ris\u00e9e. 1ere surprise: les m\u00e2les dominants qui monopolisent une grande partie de la reproduction ne sont pas particuli\u00e8rement important pour d\u00e9terminer le mouvement. En fait, le syst\u00e8me est \u00ab\u00a0d\u00e9mocratique\u00a0\u00bb dans le sens suivant: un individu partant comme \u00e9claireur dans une direction tend \u00e0 entrainer les autres; le suivi est plus rapide et plus rigoureux si plusieurs individus partent ensemble; si des individus partent dans des directions diff\u00e9rentes, la r\u00e9sultante d\u00e9pend de l&rsquo;angle entre les directions et du nombre d&rsquo;individus dans chaque direction; si l&rsquo;angle est &gt;90\u00b0, ce sont les \u00e9claireurs du groupe le plus nombreux qui emportent la d\u00e9cision, mais avec d&rsquo;autant plus de r\u00e9ticence que l&rsquo;autre groupe est nombreux; si l&rsquo;angle est &lt;90\u00b0, la troupe prend une direction moyenne, pond\u00e9r\u00e9e par la force des deux groupes.<\/p>\n<p><em>Je serai curieux de savoir si la proc\u00e9dure reste valable en cas de menace ext\u00e9rieure, lorsque la d\u00e9cision devient vitale. <\/em><\/p>\n<p><em>\u00a0<\/em><\/p>\n<p><strong>25.6.15. Nature 522, 7557.<\/strong><\/p>\n<p>&#8211; 397. M\u00c9DECINE, COMMERCE. <u>M\u00e9dicament contre l&rsquo;h\u00e9patite C (cont.)<\/u> Gilead Science facture 84 K$ l&rsquo;excellent traitement par le nouveau m\u00e9dicament. \u00c0 ce prix, m\u00eame la LAMAL impose des restrictions s\u00e9v\u00e8res: il faut d&rsquo;abord \u00eatre bien abim\u00e9 pour avoir droit \u00e0 la pilule. Soutenue par MSF, la Chine apr\u00e8s l&rsquo;Inde a refus\u00e9 l&rsquo;offre \u00e0 900$, la jugeant encore trop \u00e9lev\u00e9e. Les g\u00e9n\u00e9riques \u00ab\u00a0sauvages\u00a0\u00bb se pointent. <em>Des bruits circulent qu&rsquo;un m\u00e9dicament immunologique (g\u00e9n\u00e9ralement tr\u00e8s cher) contre Alzheimer est proche. La guerre sera farouche. <\/em><\/p>\n<p>&#8211; 410 &#8211; 412. NEUROPSYCHOLOGIE. <u>Le point sur l&rsquo;ocytocine<\/u>. Ocytocine signifie \u00ab\u00a0naissance rapide\u00a0\u00bb. Depuis 1950 elle est utilis\u00e9e couramment et \u00e0 forte dose en obst\u00e9trique &#8211; donc, \u00e0 premi\u00e8re vue, pas de probl\u00e8me de toxicit\u00e9. C&rsquo;est aussi l&rsquo;hormone \u00ab\u00a0de l&rsquo;altruisme et la socialit\u00e9\u00a0\u00bb. Avec cette r\u00e9putation et comme on peut l&rsquo;acheter facilement, la demande est consid\u00e9rable . Mais l\u00e0, il faut \u00eatre prudent. Une chose est sure: dire que l&rsquo;ocytocine est la drogue de l&rsquo;amour et de la confiance est trompeur. Plus s\u00e9rieusement, est-ce une drogue pour soigner l&rsquo;autisme ou les \u00e9tats bipolaires? Les r\u00e9sultats ne sont pas clairs. <em>Mais comment g\u00e9rer la demande des utilisateurs sauvages?<\/em><\/p>\n<p>&#8211; 413 &#8211; 4. SCIENCE ET SOCI\u00c9T\u00c9. <u>Comment d\u00e9terminer risques et b\u00e9n\u00e9fices de l&rsquo;\u00e9dition des g\u00e8nes ou de l&rsquo;intelligence artificielle.<\/u> D. Sarewitz argumente que la r\u00e9ponse ne peut \u00eatre fournie par les scientifiques seuls. <em>Eh oui! Le point de vue oriente la vision du monde bien plus qu&rsquo;on ne l&rsquo;imagine. C&rsquo;est en quelque sorte la grande le\u00e7on que j&rsquo;ai apprise des 7 premi\u00e8res ann\u00e9es de ma retraite. <\/em><\/p>\n<p>&#8211; 470 &#8211; 3. TH\u00c9ORIE DE L&rsquo;\u00c9VOLUTION. Lumley et al. <u>La s\u00e9lection sexuelle prot\u00e8ge contre l&rsquo;extinction.<\/u> On entend souvent dire apr\u00e8s Kuhn, (<em>The structure of scientific revolution<\/em>. 1970, UCP, Chicago) que la th\u00e9orie darwinienne de l&rsquo;\u00e9volution n&rsquo;est pas vraiment une th\u00e9orie scientifique puisque l&rsquo;\u00e9volution ne peut \u00eatre test\u00e9e en la r\u00e9p\u00e9tant. Erreur conceptuelle! Ce n&rsquo;est pas l&rsquo;histoire qu&rsquo;il s&rsquo;agit de tester, mais la th\u00e9orie qui peut, entre autres, aider \u00e0 en rendre compte. Ne nous trompons donc pas, la th\u00e9orie de l&rsquo;\u00e9volution est testable et les scientifiques ne s&rsquo;en privent pas. Pr\u00e9misse du pr\u00e9sent article, il y a l&rsquo;\u00e9tonnement devant la g\u00e9n\u00e9ralit\u00e9 de la reproduction sexu\u00e9e alors que son co\u00fbt est \u00e9norme, en particulier par le fait que, le plus souvent, seule la moiti\u00e9 des individus portent toute la charge de la reproduction. Pour l&rsquo;expliquer, Darwin a propos\u00e9 la th\u00e9orie de la s\u00e9lection sexuelle qui peut s&rsquo;expliquer ainsi: les mutations diverses s&rsquo;accumulent au cours du temps; si certaines &#8211; rares &#8211; peuvent d\u00e9boucher sur un avantage \u00e9volutif, la majorit\u00e9 d\u2019entre elles sont neutres ou d\u00e9favorables; sans corrections, le g\u00e9nome se d\u00e9grade. La s\u00e9lection sexuelle compense ce d\u00e9savantage en permettant aux femelles de choisir les meilleurs m\u00e2les &#8211; ou vice-versa -, \u00e9liminant ainsi la mauvaise d\u00e9rive du g\u00e9nome et favorisant les rares changements potentiellement favorables. Il est vrai que, attentif observateur de la nature, Darwin avait remarqu\u00e9 que les manifestations du ph\u00e9nom\u00e8ne sont souvent tellement extraordinaires, qu&rsquo;il faut bien leur trouver une solide explication (voir par exemple: https:\/\/www.youtube.com\/watch?v=T1EEsZCnZWE).\u00a0\u00a0 L&rsquo;exp\u00e9rience rapport\u00e9e ici est moins gracieuse. Elle porte sur des insectes plac\u00e9s pendant 7 ans en situation de s\u00e9lection sexuelle, soit forte, soit faible. Apr\u00e8s cela ils sont mis en situation de reproduction consanguine (seulement entre fr\u00e8res et soeurs, une situation qui, \u00e0 la longue, n&rsquo;est pas viable) pour tester la \u00ab\u00a0qualit\u00e9\u00a0\u00bb de leur g\u00e9nome. Le r\u00e9sultat est clair, les familles issues d&rsquo;individus soumis \u00e0 la s\u00e9lection sexuelle survivent deux fois plus longtemps que celles qui ne l&rsquo;ont pas \u00e9t\u00e9 et qui disparaissent en moins de 10 g\u00e9n\u00e9rations. Le r\u00e9sultat est pratiquement le m\u00eame que ce soit la femelle ou le m\u00e2le qui est le principal agent de la s\u00e9lection.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>26.6.15. Science 348, 6242.<\/strong><\/p>\n<p>&#8211; 1469 &#8211; 72. CLIMAT. T.R.Karl et al. (10 auteurs, US) <u>L&rsquo;apparente diminution de l&rsquo;\u00e9chauffement climatique depuis 1998 est probablement un art\u00e9fact de mesure<\/u>. Selon le dernier rapport de l&rsquo;IPCC (le panel international d&rsquo;\u00e9valuation de l&rsquo;\u00e9chauffement climatique), l&rsquo;augmentation de la temp\u00e9rature de surface a significativement ralenti depuis 1998. De ce \u00ab\u00a0hiatus\u00a0\u00bb se r\u00e9galent \u00e9videmment les n\u00e9gationnistes de tout poil. Pour l&rsquo;expliquer, les sp\u00e9cialistes ont propos\u00e9, par exemple, qu&rsquo;il correspond \u00e0 une augmentation de l&rsquo;\u00e9change avec les couches profondes des oc\u00e9ans, impossible \u00e0 mesurer actuellement avec la pr\u00e9cision requise. Le pr\u00e9sent article a une autre explication; il semble d\u00e9montrer que le \u00ab\u00a0hiatus\u00a0\u00bb est un art\u00e9fact de mesure. Il me convainc en tous cas d&rsquo;une chose: mesurer la variation de la temp\u00e9rature de surface de la Terre est diablement difficile. C&rsquo;est normal. Il y a des endroits chauds, d&rsquo;autres froids et tous se d\u00e9placent. La qualit\u00e9 de la mesure globale d\u00e9pend d&rsquo;abord du r\u00e9seau de points de mesure que l&rsquo;on a pu mettre en place. Sur terre, on connait les stations m\u00e9t\u00e9o et leur mesure standardis\u00e9e (voir \u00e0 Villa). Sur mer, la m\u00e9thode la plus fr\u00e9quente consiste \u00e0 d\u00e9terminer la temp\u00e9rature de l&rsquo;eau pomp\u00e9e dans les cargos pour refroidir les moteurs. Un r\u00e9seau de bou\u00e9es est plus pr\u00e9cis, mais moins dense. On voit le probl\u00e8me de calibrations que posent ces diff\u00e9rentes mesures. Et puis, entre les points mesur\u00e9s, il faut interpoler dans l&rsquo;espace et le temps. Sans surprise, c&rsquo;est l&rsquo;Arctique et l&rsquo;Antarctique qui sont les moins bien couverts. Le pr\u00e9sent travail reprend toutes les donn\u00e9es, y ajoute celles des deux derni\u00e8res ann\u00e9es. La conclusion est qu&rsquo;il n&rsquo;y a pas de hiatus. Finalement, je retiens que l&rsquo;\u00e9chauffement moyen depuis 1880 a \u00e9t\u00e9 d&rsquo;environ 0.07\u00b0\/d\u00e9cade en augmentation r\u00e9guli\u00e8re atteignant maintenant environ 0.11\u00b0\/d\u00e9cade r\u00e9sultant en un r\u00e9chauffement global qui approche 1\u00b0<\/p>\n<p>&#8211; 1403, 1411 &#8211; 3, 1420 &#8211; 2, 1423 &#8211; 5. SCIENCE REPRODUCTIBLE ET OUVERTE. <span style=\"color: #ff0000;\">Gilles<\/span>. Quatre articles ind\u00e9pendants autour du m\u00eame sujet.<br \/>\n1411 &#8211; 13. J. Kaiser analyse une r\u00e9cente \u00e9tude visant \u00e0 reproduire 50 des articles les plus cit\u00e9s de Nature, Science et Cell dans le domaine du cancer de 2010 &#8211; 12. Peut-\u00eatre particulier \u00e0 cette \u00e9tude, c&rsquo;est l&rsquo;effort qui a \u00e9t\u00e9 fait pour communiquer avec, et obtenir le feedback des auteurs des articles analys\u00e9s. Encore une fois, les r\u00e9sultats sont d\u00e9testables par le nombre des \u00e9tudes non reproductible. L&rsquo;article met aussi en \u00e9vidence la difficult\u00e9 \u00e0 collaborer avec les auteurs pour mettre le doigt sur les noeuds que r\u00e9v\u00e8le la tentative de reproduire. <em>Je crois, sans gu\u00e8re de difficult\u00e9s, les \u00e9tudes montrant que la majorit\u00e9 des r\u00e9sultats publi\u00e9s en sciences humaines ou celles en m\u00e9decine et biologie directement li\u00e9e \u00e0 l&rsquo;industrie ne sont pas reproductibles. Par contre, j&rsquo;ai grand-peine \u00e0 admettre que les articles provenant d&rsquo;institutions scientifiques reconnues et r\u00e9put\u00e9es neutres, publi\u00e9es dans les grands journaux scientifiques doivent, par d\u00e9faut, \u00eatre consid\u00e9r\u00e9s comme irrelevants jusqu&rsquo;\u00e0 preuve du contraire. Si tel devait \u00eatre le cas, la notion d&rsquo;innovation scientifique devrait \u00eatre profond\u00e9ment revue. <\/em><\/p>\n<p>Les trois autres articles s&rsquo;attachent \u00e0 la question: comment am\u00e9liorer la situation? Ils ne manquent pas de propositions. Celles par un groupe autour de Bruce Alberts (un scientifique remarquable) (pp1420 &#8211; 22) me semblent bien gentilles et ne tiennent pas assez compte de la brutalit\u00e9 de ceux pour qui la science de qualit\u00e9 n&rsquo;est pas le but. L&rsquo;autre ressort d&rsquo;une vaste \u00e9tude financ\u00e9e par la fondation Laura et John Arnold. Elle vise \u00e0 favoriser la science ouverte dans le but de promouvoir et valoriser la vraie innovation. J&rsquo;aime la conclusion de B. Alberts et al.: en 1787, se demandant si la fraiche \u00e9laboration de la constitution US d\u00e9boucherait sur la r\u00e9publique ou la monarchie, B. Franklin conclut: \u00ab\u00a0A Republic, if you can keep it\u00a0\u00bb. <em>Y&rsquo;a du boulot en science! <\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Quelques points saillants en juin 2015 (5.6.15, 1147: Structure d&rsquo;un complexe de la beta-galactosidase \u00e0 2.2\u00c5. Nouveau record. Subramanian, NIH Science 19.6.15, 1365: design de r\u00e9seaux prot\u00e9iques artificiels 2-dimensionnels Nature, 25.5, 450 &#8211; 4: le complexe promoteur de l&rsquo;anaphase et son m\u00e9canisme d&rsquo;ubiquitinisation de prot\u00e9ine) &nbsp; 01.06.15. Scientific American. &#8211; 16. SCIENCE ET SOCI\u00c9T\u00c9, RISQUE. 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