{"id":919,"date":"2016-10-24T22:53:05","date_gmt":"2016-10-24T20:53:05","guid":{"rendered":"http:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/?p=919"},"modified":"2016-11-14T22:13:55","modified_gmt":"2016-11-14T21:13:55","slug":"septembre-2016-actualite-scientifique-selon-jacques","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/?p=919","title":{"rendered":"Septembre 2016. Actualit\u00e9 scientifique selon Jacques"},"content":{"rendered":"

En particulier, je vous conseille:<\/strong><\/p>\n

\n

– L’\u00e9ducation des enfants \u00e0 haut potentiel.\u00a0Nature, 8. sept.\u00a0D\u00e9testable!<\/p>\n

– M\u00eame cahier: L’eau devient presque parfaitement mobile \u00e0 la surface des nanotubes de C. Exploit technique, \u00e9tonnant r\u00e9sultat.<\/p>\n

– Les bijoux des N\u00e9andertals: Science, le 23<\/div>\n
– Le couple Zuckerberg et son altruisme. Nature du 29<\/div>\n
– Les \u00e9motions du bourdon; il est optimiste quand il est content. Nature du 29.<\/div>\n
– Rosetta et sa com\u00e8te, une structure surprenante. Science le 30.<\/div>\n
… et plusieurs choses sur l’\u00e9pig\u00e9n\u00e9tique et les biotechnologies.<\/div>\n
<\/div>\n<\/div>\n

<\/p>\n

Nous gardons un oeil attentif sur la cryo-ME:<\/strong><\/p>\n

Galej, W. P., Wilkinson, M. E., Fica, S. M., Oubridge, C., Newman, A. J., & Nagai, K. (2016). Cryo-EM structure of the spliceosome immediately after branching. Nature<\/em>. doi:10.1038\/nature19316<\/p>\n

Wu, J., Yan, Z., Li, Z., Qian, X., Lu, S., Dong, M., . . . Yan, N. (2016). Structure of the voltage-gated calcium channel Cav1.1 at 3.6 A resolution. Nature, 537<\/em>(7619), 191-196. doi:10.1038\/nature19321<\/p>\n

Meyerson, J. R., Chittori, S., Merk, A., Rao, P., Han, T. H., Serpe, M., . . . Subramaniam, S. (2016). Structural basis of kainate subtype glutamate receptor desensitization. Nature, 537<\/em>(7621), 567-571. doi:10.1038\/nature19352<\/p>\n

\"meyerson_glu\"
\nLa figure (a) donne une bonne id\u00e9e de la d\u00e9marche de la cryo-me. \u00c0 gauche est montr\u00e9 le r\u00e9sultat direct de la reconstruction faite \u00e0 partir d\u2019un grand nombre d\u2019images de la particule flottant dans un mince film d\u2019eau vitrifi\u00e9e. Ici, les donn\u00e9es portent jusqu\u2019\u00e0 3.8\u00c5 de r\u00e9solution.
\n(b) \u00c0 partir de ces donn\u00e9es, les chaines des acides amin\u00e9s sont \u00e9tablies sur la base de la s\u00e9quence connue.\u00a0 Il en ressort les h\u00e9lices alpha et les autres sous-structures principales ainsi que les segments de liaison.\u00a0 La chaine lat\u00e9rale, caract\u00e9ristiques de chaque acide amin\u00e9, est mal visible \u00e0 cette r\u00e9solution. La suite du travail consiste \u00e0 utiliser toutes les donn\u00e9es, structurales et chimiques, provenant d\u2019autres syst\u00e8mes comparables ou en d\u00e9terminant le m\u00eame complexe dans des conditions diff\u00e9rentes, par exemple, lorsqu\u2019un ligand lui est attach\u00e9. C\u2019est aussi l\u00e0 le domaine des simulations dynamiques \u00e0 l\u2019ordinateur qui permettent d\u2019affiner la structure observ\u00e9e. \u00c0 la fin, on esp\u00e8re avoir progress\u00e9 vers la r\u00e9ponse \u00e0 la question\u00a0: comment\u00a0 \u00e7a marche?<\/em><\/p>\n

Gu, J., Wu, M., Guo, R., Yan, K., Lei, J., Gao, N., & Yang, M. (2016). The architecture of the mammalian respirasome. Nature, 537<\/em>(7622), 639-643. doi:10.1038\/nature19359<\/p>\n

Letts, J. A., Fiedorczuk, K., & Sazanov, L. A. (2016). The architecture of respiratory supercomplexes. Nature, 537<\/em>(7622), 644-648. doi:10.1038\/nature19774.<\/p>\n

Deux articles soumis et accept\u00e9s presque en m\u00eame temps (A. Engel a particip\u00e9 \u00e0 la r\u00e9vision) a propos du m\u00eame complexe de la chaine respiratoire des mitochondries. Le premier est chinois, le second est une collaboration Autriche-MRC GB. Il s\u2019agit d\u2019un gros complexe, 1.7 MDa, 80+ prot\u00e9ines, 132 h\u00e9lices transmembranaires. C\u2019est \u00e9tonnant qu’ils arrivent \u00e0 construire un mod\u00e8le atomique m\u00eame si la r\u00e9solution n\u2019est \u00ab\u00a0que\u00a0\u00bb de 5.4 \u00e0 7.8 \u00c5.
\nPourquoi si souvent deux groupes en m\u00eame temps sur le m\u00eame sujet\u00a0? Qui a pris \u00e0 qui\u00a0? <\/em><\/p>\n

Rauhut, R., Fabrizio, P., Dybkov, O., Hartmuth, K., Pena, V., Chari, A., . . . Luhrmann, R. (2016). Molecular architecture of the Saccharomyces cerevisiae activated spliceosome. Science, 353<\/em>(6306), 1399-1405. doi:10.1126\/science.aag1906<\/p>\n

 <\/p>\n

01.09. 2016. Nature 537, 7618<\/strong><\/p>\n

– 26 \u2013 8. MALADIE TROPICALE, M\u00c9DECINE. Lucy, Arjun. Les morsures de serpent sont un probl\u00e8me sanitaire majeur dans le tiers monde.<\/u> La figure met en relation le poids des diff\u00e9rentes maladies tropicales. On note que la bilharziose et la malaria (qui touchent un nombre comparable de personnes) dominent largement le spectre. En 3e<\/sup> position viennent les morsures de serpents. 45’000 tu\u00e9s en Inde en 2005, 100’000 dans le monde + 400’000 amputations.<\/p>\n

Pourtant, la grande majorit\u00e9 des cas seraient soignables. Le probl\u00e8me est le manque et la non-disponibilit\u00e9 des antivenins. Un des principaux producteurs, Sanofi Pasteur \u00e0 Lyon, a cess\u00e9 la fabrication de son s\u00e9rum en 2014. MSF estime que ce simple fait cause 10’000 morts suppl\u00e9mentaires par ann\u00e9e en Afrique.<\/p>\n

\"serpents-et-autres-maladies\"<\/p>\n

Le pr\u00e9sent article fait le point \u00e0 l\u2019occasion d\u2019un colloque au WHO. Il en ressort qu\u2019un progr\u00e8s rapide est frein\u00e9 par la dispute en ceux qui veulent d\u00e9velopper de nouveaux s\u00e9rums sur base des nouvelles technologies et ceux qui affirment que les s\u00e9rums efficaces existent et sont bien connus, il suffit de les produire et de les distribuer.<\/p>\n

 <\/p>\n

 <\/p>\n

– 54 – 5, 50 \u2013 6. ALZHEIMER, M\u00c9DECINE, TH\u00c9RAPIE. Tous les vieux.<\/p>\n

\"aducanumab\"<\/p>\n

Couverture de la revue\u00a0: effet d\u2019aducanumab sur les plaques Ab (rouge).<\/p>\n

L\u2019anticorps Aducanumab est en phase 3 (derni\u00e8re phase avant la mise sur le march\u00e9) d\u2019un test de la maladie d\u2019Alzheimer. Le pr\u00e9sent article montre que l\u2019injection r\u00e9guli\u00e8re de cet anticorps diminue consid\u00e9rablement les agr\u00e9gats d\u2019amylo\u00efde b\u00eata ( Ab, les fameuses plaques qui s\u2019accumulent dans le cerveau \u00a0des malades). Les donn\u00e9es pr\u00e9liminaires sugg\u00e8rent aussi qu\u2019il ralentit le d\u00e9clin cognitif. Si cette observation est confirm\u00e9e, elle d\u00e9montrera enfin l\u2019effet causal des agr\u00e9gats Ab, dans la maladie. C\u2019est la premi\u00e8re fois qu\u2019un r\u00e9sultat aussi significatif est obtenu. On peut en \u00eatre surpris, car normalement, les anticorps traversent mal la barri\u00e8re h\u00e9matoenc\u00e9phalique qui prot\u00e8ge le syst\u00e8me nerveux.<\/p>\n

D\u00e9p\u00eachons, d\u00e9p\u00eachons, mais j\u2019ai peur que, quand il arrivera sur le march\u00e9, le prix du traitement fasse fr\u00e9mir. \u00c0 suivre.<\/em><\/p>\n

02.09.2016. Science 353, 6303.<\/strong><\/p>\n

– 969. SCIENCE, POLITIQUE. Gilles. Editorial. En cette fin de septembre doit se tenir \u00e0 Bruxelles le forum INGSA (International Network for Government Science Advice)<\/u>. La d\u00e9signation, comme le but, sont prometteurs pour ce qui concerne le tr\u00e8s n\u00e9cessaire dialogue entre politiciens, scientifiques, et la soci\u00e9t\u00e9 civile afin que l\u2019\u00e9vidence scientifique prenne toute sa place. Cet \u00e9ditorial n\u2019est que beaux mots, mais l\u2019intention est \u00e0 suivre.<\/p>\n

 <\/p>\n

– 1000, 1030 \u2013 1031. LANGAGE, CHIEN. Comment les chiens comprennent-ils le langage humain\u00a0?<\/u> Selon cet article, une partie de l\u2019h\u00e9misph\u00e8re gauche r\u00e9agit aux mots positifs alors qu\u2019une partie de la droite r\u00e9agit aux intonations favorables. La synth\u00e8se des deux induit la r\u00e9action du chien.<\/p>\n

 <\/p>\n

– 1033 \u2013 36. M\u00c9DECINE, VACCINATION. Sanofi-Pasteur a obtenu la licence pour un vaccin contre la dengue dans 6 pays. L\u2019article discute les incertitudes quant \u00e0 l\u2019effet de cette vaccination \u00e0 grande \u00e9chelle. Il est demand\u00e9 qu\u2019il soit proc\u00e9d\u00e9 \u00e0 un suivi pr\u00e9cis des r\u00e9sultats afin de d\u00e9cider de la politique avenir et \u00e9valuer correctement les futurs candidats vaccins pour cette et d\u2019autres maladies semblables.<\/p>\n

\u00a0<\/strong><\/p>\n

08.09.2016. Nature 537, 7619<\/strong>.<\/p>\n

\u00a0<\/em>– 148, S49 \u2013 72. M\u00c9DECINE DE PR\u00c9CISION. Cahier sp\u00e9cial. Jacques Di. Lazare. Nous en avons souvent parl\u00e9; la recherche m\u00e9dicale s\u2019emballe depuis que CRISPR\/Cas9 laissent \u00e0 croire que les biotechnologies sont \u00e0 port\u00e9e de main. En accompagnement vient la grande id\u00e9e de la m\u00e9decine personnalis\u00e9e qui veut que chaque malade ait son traitement plut\u00f4t que chaque maladie son m\u00e9dicament.<\/u> Pourtant, m\u00eame dans ce cahier forc\u00e9ment favorable \u00e0 ces vues, les ombres sur la beaut\u00e9 du tableau ressortent, dans le titre de certains articles\u00a0par exemple: \u00ab\u00a0L\u2019illusion de l\u2019oncologie de pr\u00e9cision\u00a0\u00bb\u00a0; \u00ab\u00a0Le mythe de l\u2019anonymit\u00e9\u00a0\u00bb. Ce qui me semble le plus inqui\u00e9tant, c\u2019est combien cette agitation scientifique est imm\u00e9diatement reprise, en pire, dans le public (cf. Erger en bas de page 148). On compte aux USA, 570 cliniques offrant \u00e0 qui veut les payer, des th\u00e9rapies sauvages au moyen de cellules souches. Le gouvernement s\u2019inqui\u00e8te des d\u00e9g\u00e2ts caus\u00e9s, mais le commentateur constate que la pratique a d\u00e9j\u00e0 tellement pris racine qu\u2019il sera extr\u00eamement difficile de la r\u00e8glementer. Il semble que ce soit pire en Chine. La m\u00e9decine de pr\u00e9cision est-elle en train de devenir la m\u00e9decine de charlatan\u00a0?<\/em><\/p>\n

 <\/p>\n

 <\/p>\n

– 152 \u2013 5. \u00c9DUCATION, ENFANTS A HAUT POTENTIEL. Clynes, T. Marc D-F., Nicolas M., Gilles et Lucy, Laur\u00e9e. Le pr\u00e9tendu avantage d\u2019une \u00e9ducation s\u00e9lective.<\/u> En Europe la politique \u00e9ducative est plut\u00f4t inclusive, c\u2019est-\u00e0-dire, elle met l\u2019effort principal \u00e0 ce que tous atteignent un niveau respectable. Aux USA, on n\u2019est nettement plus exclusif, craignant moins d\u2019\u00e9largir le foss\u00e9 entre les meilleurs et les autres. Le pr\u00e9sent article concerne l\u2019\u00e9tude US SMPY (Study of Mathematically Precocious Youth) qui a suivi pendant 45 ans le devenir d\u2019enfants dou\u00e9s en math\u00e9matiques. D\u2019autres \u00e9tudes similaires portent sur les capacit\u00e9s langagi\u00e8res. Ces capacit\u00e9s sont g\u00e9n\u00e9ralement \u00e9valu\u00e9s par le test STA (Scholastic Ability Test). On sait que, selon les dipl\u00f4mes et les salaires, les enfants dou\u00e9s r\u00e9ussissent en g\u00e9n\u00e9ral mieux (le 1% sup\u00e9rieur au STA a 25x plus de chance d\u2019arriver au PhD que la population g\u00e9n\u00e9rale). On pensait d’habitude que les diff\u00e9rences s\u2019estompent au-del\u00e0 du % sup\u00e9rieur. Gr\u00e2ce \u00e0 sa large base statistique, la pr\u00e9sente \u00e9tude montre que les dipl\u00f4mes, le nombre de brevets et le revenu obtenus continuent de croitre si l\u2019on continue l\u2019\u00e9valuation jusqu\u2019au 0.01% du sommet de la pyramide (700 au SAT \u00e0 13 ans). Fig.<\/p>\n

Conclusion\u00a0de l\u2019auteur: Il regrette que \u00ab\u00a0notre soci\u00e9t\u00e9 encourage beaucoup plus les talents athl\u00e9tiques que les talents intellectuels\u00a0\u00bb . Il propose\u00a0: \u00ab\u00a0Face aux d\u00e9fis que doit relever notre soci\u00e9t\u00e9 (climat, \u2026, terrorisme) ce sont les enfants au plus haut potentiel qui apporteront la solution. Ce sont eux, les enfants sur lesquels il faut parier.\u00a0\u00bb<\/p>\n

\"enfants-surdoues_figure\"<\/p>\n

Ma conclusion\u00a0: ultralib\u00e9ralisme d\u00e9shumanisant\u00a0!<\/em><\/p>\n

Les donn\u00e9es sont des donn\u00e9es. J\u2019en prends note et confirme que les enfants dou\u00e9s peuvent et doivent contribuer \u00e0 la soci\u00e9t\u00e9. Aidons-les \u00e0 faire valoir leurs talents pour le bien de tous. <\/em><\/p>\n

Mais dans une soci\u00e9t\u00e9 \u00e0 moyens limit\u00e9s, \u00ab\u00a0parier sur eux\u00a0\u00bb se traduit par\u00a0: aider les forts et n\u00e9gliger les autres. Cette vue transparait dans tout l\u2019article. C\u2019est le choix politique de l\u2019ultralib\u00e9ralisme ou, autrement dit, le choix du darwinisme social. <\/em><\/p>\n

Ce n\u2019est pas mon choix et l\u00e0-dessus il y aurait beaucoup \u00e0 dire (voir ailleurs). Dans le petit cadre de l\u2019argumentation pr\u00e9sent\u00e9e ici, constatons quand m\u00eame que l\u2019id\u00e9e de vaincre le terrorisme par le soutien aux \u00e9lites plut\u00f4t que par l\u2019aide au d\u00e9veloppement des d\u00e9favoris\u00e9s d\u00e9note un \u00e9go\u00efsme remarquablement aveugle. <\/em><\/p>\n

Il est \u00e9galement parlant que les auteurs prennent pour mod\u00e8le le soutien public accord\u00e9 aux super-\u00e9lites sportives. <\/em><\/p>\n

Cet article rappelle: <\/em>Herrnstein, R. J., & Murray, C. (1994). The Bell Curve. Intelligence and Class Structure in American Life<\/em>. New York: The Free Press.\u00a0 Des donn\u00e9es importantes, mais des conclusions puantes, fameusement d\u00e9fendues par les auteurs.<\/p>\n

Gilles fait remarquer\u00a0: Selon le graphique, en passant du meilleur 1% au meilleur 0.01% les indicateurs pr\u00e9sent\u00e9s ici augmentent d\u2019un facteur 2 (doctorats) \u00e0 10 (revenu). Pour un facteur 100 en abscisse le 2-10 en ordonn\u00e9e n\u2019est pas impressionnant.\u00a0 Il\u00a0 semble toutefois que les auteurs font l\u2019hypoth\u00e8se implicite que le param\u00e8tre \u00ab\u00a0utilit\u00e9 sociale\u00a0\u00bb augmente d\u2019un facteur beaucoup plus grand. Deux fois plus en QI c\u2019est infiniment plus en vraie valeur. Un g\u00e9nie n\u2019a pas de prix puisque lui r\u00e9soudra le probl\u00e8me des migrants, de l\u2019\u00e9chauffement climatique, du vieillissement pr\u00e9coce et de la compr\u00e9hension entre les peuples. Y croyons-nous\u00a0? <\/em><\/p>\n

 <\/p>\n

– 171 \u2013 2, 210 \u2013 3. R\u00c9OLOGIE, EAU. EAU. Res E., Beno\u00eet. Secchi et al. L\u2019eau coule presque sans frottement dans des nanotubes de carbone<\/u>. Pour un liquide \u00ab\u00a0honn\u00eate\u00a0\u00bb (newtonien) qui coule sur une surface, la vitesse d\u2019\u00e9coulement est proportionnelle \u00e0 la distance \u00e0 la surface. La viscosit\u00e9 est le facteur de proportionnalit\u00e9. En r\u00e9alit\u00e9 beaucoup de liquides ont un comportement diff\u00e9rent\u00a0; la viscosit\u00e9 semble diminuer tr\u00e8s pr\u00e8s de la surface.\u00a0 Ls<\/sub>, \u00ab\u00a0slipp length\u00a0\u00bb (longueur d\u2019arrachage\u00a0?) caract\u00e9rise cette d\u00e9viation.<\/p>\n

\"slip_length\"<\/p>\n

Pour les questions d\u2019\u00e9talement de l\u2019eau sur un film de carbone, je m\u2019\u00e9tais souvent r\u00e9f\u00e9r\u00e9 aux travaux de de Gennes ({de Gennes, 1985 #2708; de Gennes, 1985 #2447; de Gennes, 1984 #1012}) qui avaient montr\u00e9 la grande mobilit\u00e9 des premi\u00e8res couches d\u2019eau envahissant une surface hydrophile. Les donn\u00e9es \u00e9taient peu quantitatives parce que les mesures sont extr\u00eamement difficiles.<\/p>\n

Dans le pr\u00e9sent article, les auteurs mesurent le d\u00e9bit d\u2019eau \u00e0 travers des nanotubes de carbone individuels de 15 \u2013 50 nm de diam\u00e8tre selon la pression appliqu\u00e9e. La m\u00e9thode de mesure (Figure) et les r\u00e9sultats (Figure) sont remarquables.<\/p>\n

 <\/p>\n

\"ecoulement_principe\"\"ecoulement_resultat\"<\/p>\n

 <\/p>\n

Un nanotube est mont\u00e9 sur une pipette (un seul, sans fuite lat\u00e9rale) et la pression est appliqu\u00e9e pour faire couler l\u2019eau de la pipette vers le r\u00e9cipient ext\u00e9rieur. (Il ne s\u2019agit pas de faire gicler le jet dans l\u2019air, les forces de tension superficielle seraient alors une tout autre affaire.) La quantit\u00e9 d\u2019eau transvas\u00e9e (\u00b5m3<\/sup>) est trop petite pour que le jet soit directement visible dans le compartiment r\u00e9cepteur. Des microbilles visibles au microscope optique sont ajout\u00e9es au liquide. Leur d\u00e9placement sous l\u2019effet du jet permet de calculer les param\u00e8tres de l\u2019\u00e9coulement, vitesse du jet, d\u00e9bit et longueur d\u2019arrachage qui exprime l\u2019effondrement de la viscosit\u00e9 lorsque le diam\u00e8tre du tube est petit (fig. de droite, en vert, en bleu\u00a0: r\u00e9sultat avec les tubes en bore.)<\/p>\n

Les auteurs montrent ainsi que le d\u00e9bit augmente lin\u00e9airement avec la pression (pas de surprise) et que Ls <\/sub>augmente quand le diam\u00e8tre diminue (on s\u2019y attendait). Ce qui est \u00e9tonnant et remarquable, c\u2019est que Ls semble diverger en dessous 20 nm et n\u2019est plus mesurable \u00e0 15 nm. Il apparait qu\u2019\u00e0 ces dimensions, l\u2019eau glisse sans viscosit\u00e9 dans le nanotube de C. Par contre aucun effet sp\u00e9cial n\u2019est observ\u00e9 dans des nanotubes de bore. Ils ont pourtant une g\u00e9om\u00e9trie semblable.<\/p>\n

Les ions contenus dans l\u2019eau n\u2019ont pas cette m\u00eame facilit\u00e9 de glissement. Les auteurs sp\u00e9culent que cette diff\u00e9rence pourrait servir \u00e0 dessaler l\u2019eau de mer.<\/p>\n

En ce qui me concerne, je m\u2019intrigue pour une autre raison. La porine est un canal membranaire qui contr\u00f4le le passage de l\u2019eau entre l\u2019ext\u00e9rieur et l\u2019int\u00e9rieur des cellules. C\u2019est notre ami J\u00fcrg Rosenbusch, de B\u00e2le, qui en d\u00e9termina la structure atomique par diffraction X. C\u2019\u00e9tait la 2e<\/sup> prot\u00e9ine membranaire \u00e0 \u00eatre ainsi r\u00e9solue. J\u2019ai un probl\u00e8me avec cette prot\u00e9ine et cette structure\u00a0; selon moi, sa capacit\u00e9 de transport telle que mesur\u00e9e par variation de volume des cellules d\u00e9passe de plusieurs ordres de grandeur ce que mes calculs laissent \u00e0 penser. Malheureusement, avec mon approche simple, je n\u2019ai jamais obtenu une r\u00e9ponse directe des sp\u00e9cialistes consult\u00e9s. Les r\u00e9sultats ci-dessus serait-il une explication. <\/em><\/p>\n

Ceci dit, ces r\u00e9sultats vont stimuler les sp\u00e9cialistes de l\u2019eau qui auront \u00e0 revoir le comportement de l\u2019eau pr\u00e8s d\u2019une surface. C\u2019est la question de l\u2019eau vicinale,\u00a0 un vieux serpent de mer malsain \u00e0 cause d\u2019innombrables exp\u00e9riences douteuses et des annonces sensationnalistes. On peut esp\u00e9rer que la remarquable m\u00e9thode de mesure pr\u00e9sent\u00e9e ici ainsi que les r\u00e9sultats obtenus apporteront du nouveau et du solide sur ce domaine liquide.<\/em><\/p>\n

 <\/p>\n

09.09.2016. Sciencre 353, 6304.<\/strong><\/p>\n

– 1094, 1129 \u2013 232. ZIKA, VACCIN, RECHERCHE ET COMMERCIALISATION. D\u2019abord, un essai sur le d\u00e9veloppement des vaccins \u00e0 la lumi\u00e8re de la catastrophe Ebola, de l\u2019\u00e9mergence de Zika et la pression montante face \u00e0 d\u2019autres menaces semblables (dengue) ou diff\u00e9rentes (naturelles ou artificielles). Le point d\u2019achoppement est toujours le m\u00eame\u00a0: conflit entre la bonne recherche qui prend du temps et l\u2019urgence m\u00e9dicale ou commerciale.<\/p>\n

Et puis, un article rapportant la mise au point de trois vaccins prot\u00e9geant les singes rh\u00e9sus contre Zika. Il semble que le rythme de cette recherche \u00e0 laquelle ont contribu\u00e9 des centres universitaires et militaires a \u00e9t\u00e9 impressionnant. La publication l\u2019a \u00e9t\u00e9 \u00e9galement\u00a0: 7 jours entre la soumission et l\u2019acceptation, 7 jours avant la publication en ligne. Six parmi la trentaine d\u2019auteurs sont coapplicants pour les brevets des vaccins, antig\u00e8nes et vecteurs.<\/p>\n

Eh oui, la recherche change.<\/em><\/p>\n

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\u00a0<\/strong><\/p>\n

15.09.2016. Nature 537, 7620.<\/strong><\/p>\n

– 339 \u2013 346. CRYO-ME. Une revue par Fernandez-Leiro et S. Scheres au MRC de\u00a0 Cambridge. Le point sur les r\u00e9cents d\u00e9veloppements de la cryo-ME<\/u>. Il ne s\u2019agit pas de rediscuter la vitrification et la stabilit\u00e9 des films minces qui sont \u00e0 l\u2019origine de la m\u00e9thode. C\u2019est vieux tout cela. Ici, ce sont les progr\u00e8s depuis 2008 environ. On connait les avanc\u00e9es qu\u2019ont permis les nouvelles cam\u00e9ras o\u00f9 les \u00e9lectrons sont mesur\u00e9s directement (et non le flash lumineux produit par l\u2019\u00e9lectron dans du phosphore). On connait moins \u2013 et c\u2019est l\u00e0 que les auteurs ont leurs meilleures contributions \u2013 les progr\u00e8s du traitement des donn\u00e9es des images. En particulier les m\u00e9thodes math\u00e9matiques qui permettent de grouper et traiter s\u00e9par\u00e9ment les variations structurales de l\u2019objet. Ainsi, parmi les centaines de milliers de vues de la particule \u00e9tudi\u00e9e, on peut r\u00e9soudre la structure atomique des diff\u00e9rents \u00e9tats du complexe. Par exemple, le complexe qui synth\u00e9tise l\u2019ATP dans les mitochondries est un g\u00e9n\u00e9rateur rotatif. Dans la solution observ\u00e9e se retrouvent les diff\u00e9rents pas de la rotation dont chacun est r\u00e9v\u00e8l\u00e9 par l’analyse des images de la solution. Semblablement, la reconstruction est possible avec des particules dont certaines parties sont variables, ce qui ne peut se faire par diffraction des rayons X. Tout ceci donne \u00e0 la m\u00e9thode une puissance extraordinaire.<\/p>\n

La cryo-ME est adapt\u00e9e \u00e0 \u00e9tudier de relativement gros objets (des centaines de milliers d\u2019atomes). Les petits objets (10’000) atomes ne donnent pas assez de signal pour les orienter et permettre ainsi de commencer la reconstruction par addition de diff\u00e9rentes particules. La limite s\u2019am\u00e9liore, on commence \u00e0 obtenir des reconstructions de particules de moins de 200kDalton (record \u00e0 130). Quant \u00e0 la r\u00e9solution, elle s\u2019am\u00e9liore de mois en mois. Le record du moment (mars 2016) est de 2.6\u00c5.<\/p>\n

Vient ensuite la liste des principales structures analys\u00e9es \u00e0 r\u00e9solution atomique. C\u2019est l\u2019avalanches! 50 structures de ribosomes dans tous leurs \u00e9tats ces deux derni\u00e8res ann\u00e9es. Splicosome, inflamasome , signallosome, etc et surtout les prot\u00e9ines membranaires que les autres m\u00e9thodes ne r\u00e9solvent que difficilement. Pour cette ann\u00e9e, \u00e7a doit d\u00e9j\u00e0 en faire plus de 300.<\/p>\n

Les progr\u00e8s futurs. Les auteurs souhaitent voir continuer la route actuelle, mais sur des microscopes \u00e0 1 million et non \u00e0 5 ou 10 millions de francs. Oh, l\u2019industrie \u00e0 bien men\u00e9 son affaire. Selon moi, les 300kV de ces microscopes chers sont un d\u00e9savantage. Le probl\u00e8me c\u2019est que les microscopes \u00e0 100 kV n\u2019ont pas \u00e9t\u00e9 optimis\u00e9s comme les gros. Pour la cryo il faut la qualit\u00e9 d\u2019une Mercedes, mais une 2CV construite \u00e0 ces standards ferait parfaitement l\u2019affaire.<\/p>\n

\u00c0 faire progresser\u00a0: la tomographie sur des objets uniques ou des r\u00e9gions cellulaires. Elle a \u00e9t\u00e9 n\u00e9glig\u00e9e parce que plus laborieuse. Quant \u00e0 CEMOVIS, plus laborieux encore, on n\u2019en parle m\u00eame pas.<\/p>\n

Pourquoi y a-t-il tant d\u2019alpinistes qui cherchent les voies difficiles et si peu de scientifiques qui font de m\u00eame? <\/em><\/p>\n

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– 347 \u2013 355. SPECTROSCOPIE DE MASSE, PROT\u00c9OMIQUE. R. Aebersold and M. Mann. Z\u00fcrich and M\u00fcnich. Similaire \u00e0 l\u2019article pr\u00e9c\u00e9dent et presque aussi impressionnant. Encore une lecture recommand\u00e9e.<\/em><\/p>\n

 <\/p>\n

– 403 \u2013 7. \u00a0\u00a0OISEAUX, APPRENTISSAGE, INN\u00c9. On a tous vu cette corneille qui plie habilement un fil de fer pour l\u2019utiliser comme canne \u00e0 p\u00eache dans un r\u00e9cipient. On se dit qu\u2019elle est vachement maline, qu\u2019elle a re\u00e7u de bonnes le\u00e7ons et qu\u2019elle s\u2019est bien exerc\u00e9e.<\/p>\n

Il est rapport\u00e9 ici que deux esp\u00e8ces \u00e9loign\u00e9es de corneilles de nouvelles Cal\u00e9donie vivant (l\u2019une est \u00e9teinte dans la nature) sur des \u00eeles isol\u00e9es ont des comp\u00e9tences semblables. Les auteurs en d\u00e9duisent que le comportement est inn\u00e9 et ne n\u00e9cessite pas d\u2019apprentissage. Une \u00e9volution convergente y a conduit des esp\u00e8ces diff\u00e9rentes.<\/p>\n

 <\/p>\n

16.09.2016. Science 353, 6305.\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0 <\/strong><\/p>\n

– 1211 \u2013 13. BIOTECHNOLOGIE, L\u00c9GISLATION. J. Kuzna. Une occasion manqu\u00e9e de r\u00e9guler les biotechnologies.<\/u> On l\u2019a compris, les biotechnologies sont en r\u00e9volution qui ne manquera pas de devenir une r\u00e9volution sociale et politique dans un futur plus ou moins proche. Forts de ce constat, les organes US concern\u00e9s se sont mis au travail pour revoir les r\u00e8glements de 1986. Ils ont fait un effort (petit) pour se coordonner. D\u2019un c\u00f4t\u00e9, il y a l\u2019OSTP (White House\u2019s Office of Science and Technology Policy.), de l\u2019autre le CFRB (Coordinated Framework for the Regulation of Biotechnology.) form\u00e9 de la FDA (Federal Drug Administration), l\u2019Agence de Protection de l\u2019Environement et le D\u00e9partement de l\u2019Agriculture \u2013 bref, une grosse affaire. Selon l\u2019auteur, c\u2019est un \u00e9chec. Chacun est rest\u00e9 sur son pr\u00e9 carr\u00e9 en l\u2019\u00e9tendant \u00b1 aux nouvelles technologies. Ainsi, la premi\u00e8re autorisation pour un moustique st\u00e9rile destin\u00e9 \u00e0 lutter contre la malaria (pas la technologie gene drive toutefois) a \u00e9t\u00e9 trait\u00e9e par la FDA qui normalement s\u2019occupe de savoir si un produit est toxique pour les consommateurs. Ces gens sont-ils vraiment ceux qui peuvent juger les cons\u00e9quences de la destruction d\u2019une population de moustiques\u00a0? Semblablement, les discussions n\u2019ont pas vraiment abord\u00e9 les cons\u00e9quences des nouvelles technologies CRISPR et les nouvelles d\u00e9finitions qu\u2019elles imposent \u00e0 la notion d\u2019OGM (par exemple, action non pas sur l\u2019ADN mais sur l\u2019ARN). \u00c0 mon sens, le plus fort signal de la faillite est que gene drive<\/em> n\u2019est m\u00eame pas \u00e9voqu\u00e9. Voil\u00e0 qui me rappelle les discussions sur le trait\u00e9 d\u2019interdiction des armes biologiques: on \u00e9tudie ce que l’on connait et maitrise et on met le reste sous le tapis.<\/em><\/p>\n

 <\/p>\n

– 1215. ART, PEINTURE ET SCIENCE. Christine, Fran\u00e7ois R. R\u00e9censsion. {Kandel, 2016 #5739}<\/p>\n

Kant proposait qu\u2019en offrant une exp\u00e9rience qui n\u2019est pas directement li\u00e9e \u00e0 la vie pratique, l\u2019art stimule ce qu\u2019il appelle le \u00ab\u00a0libre jeu de l\u2019imagination\u00a0\u00bb. Pas mal\u00a0!<\/em> Kandel va dans une direction semblable. Il dit encore que, moins l\u2019\u0153uvre et descriptive, plus elle ne rappelle rien, plus elle nous fait avancer pour suivre et r\u00e9pondre \u00e0 notre perception et nos \u00e9motions du moment et aussi pour suivre l\u2019attitude et le jugement des autres dans un milieu culturel dynamique et souvent provocateur. Nous sommes mus par l\u2019art. L\u2019art peut \u00eatre ainsi un pont entre les deux cultures.<\/p>\n

\"rothko_sci-161016\"<\/p>\n

Analogie avec la musique qui drill le cerveau et fait vibrer les humains en r\u00e9sonnance {Ball, 2010 #4971; Levitin, 2010 #4970; Sacks, 2007 #4902}.<\/p>\n

22.09.2016.\u00a0 Nature 537, 7621<\/strong>.<\/p>\n

– 460 \u2013 1. BREVETS, CRISPR. Pourriture (suite<\/u>). C\u2019est sous ce titre que, de Science du 14.04.16, je rapportais la saga des brevets autour de la technologie CRISPR. Rappel. Mmes J.Doudna (Berkeley) et E. Charpentier d\u00e9crivent les possibilit\u00e9s biotechnologiques de CRISPR\/Cas9 sur les bact\u00e9ries. Elles d\u00e9posent un brevet. Sur ce Zhang du MIT pose un brevet express pour faire la m\u00eame chose sur des cellules eucaryotes. Il obtient le brevet en premier. Berkeley lance une proc\u00e9dure de contestation. La suite n\u2019est pas meilleure. Actuellement il y a 860 brevets d\u00e9j\u00e0 accord\u00e9s autour des brevets initiaux et les investisseurs sont bien emb\u00eat\u00e9s. L’Office europ\u00e9en des Brevets a sa propre version de la dispute. \u00c0 la base il y a cette question\u00a0: le passage de la bact\u00e9rie \u00e0 l\u2019eucaryote\u00a0est-il \u00e9vident\u00a0? Il me semble que oui. <\/em>Pour le reste, les deux institutions se battent \u00ab\u00a0until the bitter end\u00a0\u00bb. Tout est bon, \u00e0 la guerre comme \u00e0 la guerre. C\u2019est nouveau entre nobles institutions acad\u00e9miques.<\/p>\n

 <\/p>\n

– 465 \u2013 482. IN\u00c9GALIT\u00c9, SCIENCE. Cahier sp\u00e9cial. Gilles. L\u2019in\u00e9galit\u00e9 en science.<\/u> Analyse globale et par pays. En gros l\u2019in\u00e9galit\u00e9 actuelle entre ceux qui gagnent beaucoup dans le travail scientifique et ceux qui gagnent peu augmente partout. Pourtant, l\u2019indice de Gini s\u2019effondre normalement au d\u00e9but d\u2019une r\u00e9volution industrielle. Cela a \u00e9t\u00e9 tr\u00e8s marqu\u00e9 dans les ann\u00e9es 50 \u2013 80 avec l\u2019informatique (depuis, il remonte.) Pour la biologie, on ne d\u00e9tecte pas la chute \u00e0 l\u2019\u00e9mergence d\u2019une nouvelle technologie. L\u2019indice de Gini a pass\u00e9 de 0.12 en 1973 \u00e0 0.25 en 2006. Depuis il s\u2019est stabilis\u00e9, mais, aux derni\u00e8res nouvelles, il repart vigoureusement \u00e0 la hausse. Ceci est certainement le cas en Californie o\u00f9 les firmes telles que Google d\u00e9tournent \u00e0 prix fort les meilleurs acad\u00e9miciens. Pourtant, une recherche UK montre que l\u2019effet sur la production d\u2019un d\u00e9partement de recherche ne d\u00e9pend pas du fait qu\u2019il soit \u00e9galitaire ou \u00e9litiste. Par contre ce facteur a certainement beaucoup d\u2019effet sur la qualit\u00e9 de vie des participants. <\/em><\/p>\n

\u00a0<\/em><\/p>\n

– 500 \u2013 1\u00a0; 535 \u2013 8. \u00a0ORIGINE DE LA VIE. Indice de vie sur Terre il y a 3.7 milliards d\u2019ann\u00e9es.<\/u> On a rep\u00e9r\u00e9 sur l\u2019\u00eele d\u2019Isua au sud-ouest du Groenland que les glaces lib\u00e8rent de mieux en mieux, les plus vieilles roches du monde\u00a0: 3.7 milliards d\u2019ann\u00e9es selon les datations isotopiques. Le pr\u00e9sent article rapporte l\u2019observation dans ces roches de stromatolites, signe de la pr\u00e9sence de cyanobact\u00e9ries formant, en eau peu profonde, des petits monticules ench\u00e2ss\u00e9s dans des couches s\u00e9dimentaires. C\u2019est fort, car\u00a0:<\/p>\n

– une roche s\u00e9dimentaire d\u2019il y a 3.7 milliards d\u2019ann\u00e9es a eu largement l\u2019occasion de faire ses voyages m\u00e9tamorphiques dans la profondeur de la terre et de perdre ses marques d\u2019origine. \u00c0 Isua, il y a des bouts de roches qui n\u2019ont pas \u00e9t\u00e9 d\u00e9natur\u00e9es.<\/p>\n

– Il y a 4.5 milliards d\u2019ann\u00e9es s\u2019allumait le soleil et s\u2019agr\u00e9geaient les plan\u00e8tes. \u00c0 4 milliards d\u2019ann\u00e9es la Terre, encore bombard\u00e9 de tous les c\u00f4t\u00e9s n\u2019\u00e9tait pas un lieu viable. \u00c0 3.7, les masses de bact\u00e9ries fa\u00e7onnaient le fond de mares peu profondes. Il semble donc que la vie foisonnait un clin d\u2019\u0153il apr\u00e8s que la Terre soit devenue un rien viable. Cette constatation conduit les auteurs \u00e0 penser que la vie profite de toutes les occasions; elle a sans doute profit\u00e9 de Mars \u00e0 cette m\u00eame \u00e9poque et de bien d\u2019autres possibilit\u00e9s connues ou pas connues.<\/p>\n

Conclusion l\u00e9g\u00e8re et peu fond\u00e9e. Elle n\u00e9glige, entre autres, la panspermie (la vie venue de l\u2019ext\u00e9rieur).<\/em><\/p>\n

 <\/p>\n

– 494 – 6, 548 \u2013 62. \u00c9PIG\u00c9N\u00c9TIQUE, FERTILISATION. Laur\u00e9e. L\u2019\u00e9pig\u00e9n\u00e9tique \u00e0 la fertilisation et peu apr\u00e8s\u00a0; l\u2019analyse devient s\u00e9rieuse.<\/u> L\u2019\u00e9pig\u00e9n\u00e9tique consiste \u00e0 modifier chimiquement l\u2019ADN ou des mol\u00e9cules agissant sur son expression sans toutefois changer le code (succession des A, T, G, C). Typiquement, la modification consiste en un groupe m\u00e9thyle (CH3), ac\u00e9tyle (COCH3) ou une phosphorylation. Ici sont pr\u00e9sent\u00e9s 3 articles qui semblent traiter du m\u00eame sujet. En fait, ils sont ind\u00e9pendants et, vu l\u2019ampleur du probl\u00e8me, chacun apporte son compl\u00e9ment qui enrichit les autres. Ils concernent sp\u00e9cifiquement des m\u00e9thylations qui peuvent avoir lieu sur les Lysine4 et 27 de l\u2019histone H3 peu apr\u00e8s la fertilisation. Il s\u2019agit donc de modifications apport\u00e9es \u00e0 des nucl\u00e9osomes, c\u2019est-\u00e0-dire aux structures qui contr\u00f4lent l\u2019empaquetage de l\u2019ADN et ainsi son accessibilit\u00e9. La suite est compliqu\u00e9e. Les nucl\u00e9osomes ainsi m\u00e9thyl\u00e9s (ou pas) sont attach\u00e9s \u00e0 des r\u00e9gions relativement grandes de l\u2019ADN (10kB)\u00a0; d\u00e8s la fertilisation et durant les premi\u00e8res phases du d\u00e9veloppement \u00e9tudi\u00e9es ici, ces r\u00e9gions sont profond\u00e9ment modifi\u00e9es, en particulier elles deviennent plus sp\u00e9cifiques et plus localis\u00e9es. Ces articles montrent le chemin qu\u2019il va falloir suivre pour comprendre l\u2019\u00e9pig\u00e9n\u00e9tique. Le probl\u00e8me, c\u2019est qu\u2019il y a beaucoup de modifications \u00e9pig\u00e9n\u00e9tiques possibles alors qu\u2019une seule est \u00e9tudi\u00e9e ici. \u00c0 part cela, on aimerait savoir en quoi ces modifications modifient la structure de la chromatine et comment cela agit sur la fonction. Peut-\u00eatre, un jour, la cryo-me apportera sa contribution.\u00a0 <\/em><\/p>\n

 <\/p>\n

23.09.2016. Science 353, 6306.<\/strong><\/p>\n

– 1350. N\u00c9ANDERTAL, BIJOUX, CULTURE. On-line dans PNAS. Les bijoux des N\u00e9andertaliens. <\/u>Jusqu\u2019\u00e0 r\u00e9cemment, on admettait que les N\u00e9andertaliens n\u2019avaient pas de capacit\u00e9s symboliques. Il y a peu, a \u00e9t\u00e9 report\u00e9 dans ce blog (Nature du 2.6.2016, pp 43 & 111), la d\u00e9couverte au fond d\u2019une caverne difficilement atteignable, d\u2019arrangements circulaires de fragments de stalactites. Dans l’article analys\u00e9 ici, il est d\u00e9montr\u00e9 que de nombreux bijoux de la culture appel\u00e9e Ch\u00e2telperoniane, d\u00e9couverts dans la grotte du Renne \u00e0 Arcy-sur-Cure doivent \u00eatre attribu\u00e9s \u00e0 des N\u00e9andertaliens. M. Collins (York) et F.Welker) du MPI d\u2019anthropologie \u00e9volutive de Leipzig ont analys\u00e9 les prot\u00e9ines retrouv\u00e9es sur les art\u00e9facts ainsi que leur composition isotopique. Ils ont pu montrer, par exemple, que le collag\u00e8ne est riche en acide-amin\u00e9 asparagine\u00a0 alors que le collag\u00e8ne humain moderne riche en acide aspartique (on le sait parce qu\u2019on a la s\u00e9quence du g\u00e9nome du N\u00e9andertal). L\u2019\u00e2ge a pu \u00eatre pr\u00e9cis\u00e9\u00a0: 42’000 ans. C’\u00e9tait le temps o\u00f9 les H. sapiens arrivaient dans ces r\u00e9gions. Triste pour les N\u00e9andertaliens, la rencontre n’a pas dur\u00e9.<\/p>\n

\u00a0<\/strong><\/p>\n

29.09.2016. Nature 537, 7622<\/strong><\/p>\n

–<\/strong> 587. EVIDENCE-BASES POLICY. Gilles, Lucy, Arjun. \u00c9ditorial. B. Colglazier. La politique bas\u00e9e sur l\u2019\u00e9vidence est en progression<\/u>. Pinker (2011) explique comment et pourquoi la violence du monde ne cesse de diminuer. Il parait qu\u2019une actualisation confirme la tendance. J\u2019imagine qu\u2019aux derni\u00e8res nouvelles, il faut quand m\u00eame noter une mauvaise passe. Ici, l\u2019auteur offre un message presque \u00e9galement optimiste\u00a0: la politique bas\u00e9e sur l\u2019\u00e9vidence progresse un peu partout. Il remarque toutefois que, si ce fait n\u2019apparait pas toujours clairement (on pense \u00e0 Brexit et Trump), il faut voir que l\u2019\u00e9vidence s\u2019\u00e9value en fonction de diff\u00e9rentes valeurs (je r\u00e9p\u00e8te les mots de l\u2019auteur.) Valeur distributive se r\u00e9f\u00e8re \u00e0 l\u2019int\u00e9r\u00eat propre de la personne ou du groupe\u00a0; \u00a0proc\u00e9durale, pour la fa\u00e7on de mise en application (autoritaire, consensuelle)\u00a0; \u00e9videntielle quand il s\u2019agit d\u2019\u00e9valuer la solidit\u00e9 des \u00e9vidences. Le message de l\u2019auteur c\u2019est que le monde progresse pour ce qui concerne le 3e<\/sup> aspect\u00a0; c\u2019est de la science. Les autres, c\u2019est la politique.<\/p>\n

Je comprends donc que la science progresse mais o\u00f9 sont les progr\u00e8s de la politique\u00a0? <\/em><\/p>\n

\u00a0<\/em><\/p>\n

– 588. CRISPR, \u00c9PIG\u00c9N\u00c9TIQUE. Laur\u00e9e. Les possibilit\u00e9s de CRISPR pour l\u2019\u00e9dition de l\u2019ADN sont connues. Puis, on a appris \u00e0 l\u2019utiliser pour \u00e9diter les ARN. Un nouveau d\u00e9veloppement est cit\u00e9 ici\u00a0; il s\u2019agit d\u2019\u00e9diter la m\u00e9thylation de l\u2019ADN, c\u2019est-\u00e0-dire non pas de change les codons A,T,G, C ou U de l\u2019ADN ou de l\u2019ARN, mais de modifier les marqueurs \u00e9pig\u00e9n\u00e9tiques qui modifient la lecture des g\u00e8nes. Cell <\/em>http:\/\/doi.org\/bqzj(2016)<\/p>\n

 <\/p>\n

– 591. \u00c9CHAUFFEMENT CLIMATIQUE. Nouveau rapport d\u2019un think tank US. L\u2019\u00e9chauffement probable induit par l\u2019utilisation des r\u00e9serves connues de combustibles fossiles d\u00e9passerait 2\u00b0. Pour rester aux 1.5\u00b0 vis\u00e9s \u00e0 Paris 2015, il faudrait s\u2019abstenir d\u2019en consommer plus de la moiti\u00e9, davantage si on continue \u00e0 en d\u00e9couvrir de nouvelles. Quand arr\u00eatera-t-on de subventionner la recherche de nouvelles sources\u00a0?<\/em><\/p>\n

 <\/p>\n

– 595. M\u00c9DECINE, BIENFAISANCE. Lucy, Gilles. La Fondation Bill et Melinda Gates a \u00e9t\u00e9 cr\u00e9\u00e9e en 2000 avec une dote de 43 milliards. Sa philosophie\u00a0: chaque vie est \u00e9galement valable\u00a0; sa politique\u00a0: l\u2019altruisme efficace. J\u2019ai cr\u00fb comprendre qu\u2019elle a un impact impressionnant sur la recherche m\u00e9dicale et l\u2019aide au d\u00e9veloppement.. Ici est discut\u00e9e une initiative similaire de Mark Zuckerberg, fondateur et directeur de Facebook et de sa femme Priscilla Chan. \u00c0 l\u2019occasion de la naissance de leur filles, ils avaient annonc\u00e9 en d\u00e9cembre qu\u2019ils voulaient donner 99% de leur fortune (m\u00eame ordre de grandeur que celle des Gates) pour am\u00e9liorer le monde durant leur vie. Le projet se met en route. Il veut voir grand et loin et ils le veulent evidence-based.<\/p>\n

Que dire\u00a0? Bravo les femmes\u00a0! (Je trouve Mme Chan tr\u00e8s bien sur la photo\u00a0; c\u2019est presque une injure, mais comparer ces deux sur cette photo \u2013 et sur d\u2019autres photos d\u2019ailleurs \u2013 avec celles des Trump est significatif).<\/em><\/p>\n

\"zuckerberg_200916\"<\/p>\n

Bravo les altruistes\u00a0! Il existe malheureusement d\u2019autres actions tout aussi massives et priv\u00e9es dans le domaine de la m\u00e9decine bas\u00e9e sur l\u2019\u00e9vidence qui ne semblent pas \u00eatre motiv\u00e9es par l\u2019altruisme (Verily de Google, ou 23andMe).<\/em><\/p>\n

Que penser de ces champions de l\u2019\u00e9conomie rapace qui deviennent si g\u00e9n\u00e9reux. Je suis pour, parce que je crois que l\u2019homme peut s\u2019am\u00e9liorer et prendre conscience que, au-dessus du minimum, le bonheur vient de ce qu\u2019on donne et non de ce que l\u2019on a. Je pr\u00e9f\u00e8rerais que le premier b\u00e9n\u00e9ficiaire de ces fortunes colossales soit l\u2019\u00c9tat, \u00e0 travers les imp\u00f4ts fortement progressifs. L\u2019id\u00e9al serait les deux. <\/em><\/p>\n

Il n\u2019emp\u00eache que cette histoire me rend joyeux. <\/em><\/p>\n

go.nature.com\/2dzc018<\/p>\n

 <\/p>\n

– 627 \u2013 8, 656 \u2013 660. ORIGINE DE LA VIE. Cl\u00e9ment. De Science du 3.6, je rapportais des consid\u00e9rations sur les conditions n\u00e9cessaires \u00e0 l\u2019\u00e9mergence de la vie. La partie qui me semblait la moins \u00e9labor\u00e9e se rapportait \u00e0 l\u2019\u00e9mergence des r\u00e9seaux chimiques complexes. Dans le pr\u00e9sent article, les auteurs construisent, \u00e0 partir de mol\u00e9cules organiques simples (thiol, R-C-SH\u00a0; on en trouve dans les com\u00e8tes r\u00e9cemment explor\u00e9es) des r\u00e9actions qui, combin\u00e9es, sont autocatalytiques, bistables et p\u00e9riodiques. C\u2019est d\u00e9j\u00e0 beaucoup\u00a0! Ceci d\u2019autant plus qu\u2019avec la p\u00e9riodicit\u00e9 s\u2019ouvrent de riches possibilit\u00e9s de structures complexes\u00a0; l\u2019autoassemblage n\u2019est pas loin. Le commentateur de l\u2019article identifie la localisation comme le point manquant principal. Il fait alors remarquer que si la localisation est le fait de l\u2019enfermement dans une membrane, on tombe sur un autre probl\u00e8me\u00a0: les membranes sont relativement perm\u00e9ables \u00e0 ces petites mol\u00e9cules. Ce qui peut alors sauver, c\u2019est le m\u00eame type de r\u00e9seau r\u00e9alis\u00e9 avec des macromol\u00e9cules. Le ribozyme est tout indiqu\u00e9, mais les exercices avec les mol\u00e9cules simples aideront \u00e0 affiner les conditions d\u2019\u00e9laboration des r\u00e9seaux pr\u00e9vivants. Petit \u00e0 petit, on y voit plus clair sur l\u2019origine de la vie.<\/em><\/p>\n

 <\/p>\n

30.09.16. Science 353, 6307<\/strong><\/p>\n

– 1482 ORIGINE SYST\u00c8ME SOLAIRE, ROSETTA. Manu. La mission de Rosetta \u00e0 la com\u00e8te 67P\/Churyumov-Gerasimenko s\u2019est termin\u00e9e le 30 septembre par la collision finale. M\u00eame si la rencontre s\u2019est faite \u00e0 la vitesse du pas et que la sonde n\u2019est pas forc\u00e9ment d\u00e9truite, il n\u2019y aura pas de suite, car l\u2019antenne ne peut s\u2019orienter dans la bonne direction. Malgr\u00e9 l\u2019\u00e9chec partiel de l\u2019atterrisseur Philae qui a \u00e9t\u00e9 se fourrer dans l\u2019ombre d\u2019une crevasse et n\u2019a ainsi pas pu recharger ses batteries, vid\u00e9es apr\u00e8s 3 jours, la moisson des r\u00e9sultats, dont la publication ne fait que commencer, est remarquable.<\/p>\n

Jusqu\u2019ici on pensait g\u00e9n\u00e9ralement que les com\u00e8tes \u00e9taient n\u00e9es avec le syst\u00e8me solaire par la violente agr\u00e9gation de gros morceaux. Ce n\u2019est pas le cas m\u00eame si on voit des empreintes de morceaux de quelques m\u00e8tres. Pour le reste, Rosetta a montr\u00e9 de 67P, une structure en couches d’ognon datant de la formation de la com\u00e8te et partiellement expos\u00e9e par \u00e9rosion. Globalement 67P est tr\u00e8s peu dense, 70% de son volume est vide est 15% est compos\u00e9 d\u2019une mati\u00e8re duveteuse \u00e0 structure fractale typique de l\u2019agr\u00e9gation douce de particules irr\u00e9guli\u00e8res (une de ces particules a \u00e9t\u00e9 recueillie et analys\u00e9e par Rosetta avec un microscope \u00e0 force atomique). La densit\u00e9 de ces agr\u00e9gats ne serait pas plus grande que celle de l\u2019air. Le tout est parsem\u00e9 de mati\u00e8re organique complexe.<\/p>\n

On se r\u00e9jouit de lire les publications.<\/em><\/p>\n

\u00a0<\/em><\/p>\n

–<\/em> 1499-1500, 1529 \u2013 31. \u00c9MOTION, COMPORTEMENT, BOURDON. Lia, Jacques H. Les \u00e9tats d\u2019\u00e2me du bourdon.<\/u> Les humains ont l\u2019intelligence, les sentiments et les \u00e9motions, les animaux ont l\u2019instinct, \u00e7a n\u2019a rien \u00e0 voir. Le 20e<\/sup> si\u00e8cle nous a fatigu\u00e9s avec cette vue st\u00e9rile et pr\u00e9tentieuse. On en ressort lentement et je me plais \u00e0 suivre ce chemin. Ici, il s\u2019agit d\u2019\u00e9tudier l\u2019optimisme et le pessimisme chez le bourdon! \u00c9videmment, pour commencer, il faut d\u00e9finir les termes. On appelle punition quelque chose pour quoi on est dispos\u00e9 \u00e0 travailler afin de l\u2019\u00e9viter\u00a0; par contre on est pr\u00eat \u00e0 travailler pour obtenir une r\u00e9compense. Un animal expos\u00e9 \u00e0 une punition est dans un \u00e9tat affectif n\u00e9gatif<\/em>. Mutant mutandis pour \u00e9tat affectif positif.<\/em> Sont-ce de bonnes d\u00e9finitions\u00a0? On peut en discuter, mais, au moins, ce sont des d\u00e9finitions op\u00e9rationnelles que l\u2019on peut utiliser exp\u00e9rimentalement. Voici donc l\u2019exp\u00e9rience.<\/p>\n

On commence par enseigner \u00e0 un bourdon que, \u00e0 gauche de l\u2019ar\u00e8ne, il y a une solution de sucrose \u00e0 30% dans un r\u00e9cipient vert. Miam c\u2019est bon! \u00c0 droite de l\u2019ar\u00e8ne, il d\u00e9couvre aussi que, marqu\u00e9e en bleu, il y a, quelquefois, de l\u2019eau. Une fois ceci acquit, le bourdon l\u00e2ch\u00e9 dans l\u2019ar\u00e8ne se presse pour aller au sucre, il prend son temps pour aller \u00e0 l\u2019eau. Vient alors l\u2019\u00e9l\u00e9ment d\u2019incertitude. Plus de sucrose, plus d\u2019eau, mais, entre les deux, un r\u00e9cipient de couleur interm\u00e9diaire. On d\u00e9termine le temps qu\u2019il faut au bourdon pour y aller voir.<\/p>\n

Ayant bien maitris\u00e9 ces situations le bourdon est pr\u00eat pour tester l\u2019effet de l\u2019\u00e9tat affectif positif induit en rempla\u00e7ant l\u2019eau sucr\u00e9e verte \u00e0 30% par de l\u2019eau sucr\u00e9e verte \u00e0 60%. Ouah, c\u2019est super bon! Le bourdon tout heureux (en \u00e9tat affectif positif) est remis devant le cas incertain. Il y va explorer le r\u00e9cipient inconnu plus vite qu\u2019avant. L\u2019optimisme le motive.<\/p>\n

Exp\u00e9rience inverse, l\u2019\u00e9tat affectif n\u00e9gatif est induit en immobilisant le bourdon, simulacre d\u2019attaque du pr\u00e9dateur. Lib\u00e9r\u00e9, on le remet devant le test ambigu. Le stress\u00e9, dans un \u00e9tat affectif n\u00e9gatif prend plus de temps pour aller chercher ce qui, peut-\u00eatre lui fera du bien. Il n\u2019emp\u00eache que, il sera plus vite remis s\u2019il tombe sur du sucre concentr\u00e9.<\/p>\n

Suivent toutes sortes de variantes. L\u2019une d\u2019entre elles consiste \u00e0 traiter le bourdon avec un inhibiteur de la dopamine. Le petit courage au sucre concentr\u00e9 n\u2019a plus d\u2019effet, que ce soit pour le rendre entreprenant vers la source incertaine, ou pour retrouver sa forme apr\u00e8s le traumatisme.<\/p>\n

Parler des \u00e9motions du bourdon devient raisonnable. Va-t-on bient\u00f4t tester sa conscience\u00a0?<\/em><\/p>\n

R\u00e9f\u00e9rences<\/strong><\/p>\n

Kandel, E. R. (2016). Reductionism in Art and Brain Science. Bridging the Two\u00a0 Cultures<\/em>: Columbia University Press.<\/p>\n

Ball, P. (2010). The music instinct: how music works and why we can’t do without it. <\/em>: Bodley Head.<\/p>\n

Levitin, D. J. (2010). Why music moves us. Nature, 464<\/em>, 834 – 835.<\/p>\n

Sacks, O. (2007). Musicophilia. Tales of music and the brain<\/em>. London: Picador.<\/p>\n

de Gennes, P.-G. (1985). Scaling concepts in polymer physics<\/em> (2d ed.). Ithaca, London: Cornell University Press.<\/p>\n

de Gennes, P. G. (1985). Wetting: Statistics and dynamics. Reviews Modern Physics, 57<\/em>, 828-637.<\/p>\n

De Gennes, P. G. (1984). Comment s’\u00e9tale une goutte ? Pour la Science<\/em> (pp. 88-113).<\/p>\n

Semenov, S. N., Kraft, L. J., Ainla, A., Zhao, M., Baghbanzadeh, M., Campbell, V. E., . . . Whitesides, G. M. (2016). Autocatalytic, bistable, oscillatory networks of biologically relevant organic reactions. Nature, 537<\/em>(7622), 656-660. doi:10.1038\/nature19776<\/p>\n

Pinker, S. (2011). The better angels of our nature: Why violence has declined<\/em>: Viking.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

En particulier, je vous conseille: – L’\u00e9ducation des enfants \u00e0 haut potentiel.\u00a0Nature, 8. sept.\u00a0D\u00e9testable! – M\u00eame cahier: L’eau devient presque parfaitement mobile \u00e0 la surface des nanotubes de C. Exploit technique, \u00e9tonnant r\u00e9sultat. – Les bijoux des N\u00e9andertals: Science, le 23 – Le couple Zuckerberg et son altruisme. Nature du 29 – Les \u00e9motions du […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"jetpack_post_was_ever_published":false,"footnotes":"","jetpack_publicize_message":"","jetpack_publicize_feature_enabled":true,"jetpack_social_post_already_shared":false,"jetpack_social_options":{"image_generator_settings":{"template":"highway","default_image_id":0,"font":"","enabled":false},"version":2}},"categories":[1,89],"tags":[],"class_list":["post-919","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-article","category-science-actualite"],"jetpack_publicize_connections":[],"jetpack_featured_media_url":"","jetpack-related-posts":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/919","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=919"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/919\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=919"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=919"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dubochet.ch\/jacques\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=919"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}